Utiliser pour de vrai les séquences upstream/downstream
Il y a des données d'Alice avec un D5-J5 qui a 12 délétions → il en reste 8.
Il faut mettre à jour les germlines (sur Vidjil-data), et mettre à jour les tests et le germline.cpp qui utilise certaines séquences.
Fait pour DH-JH (9e16fee5). Met-on les J downstream pour tout le monde ?
fait pour plusieurs germlines...