vidjil.cpp: alléger le traitement de cluster-junctions.cpp
État actuel : les clusters faits par cluster-jonctions sont balladés partout dans vidjil.cpp, et alourdissent le code. En particulier, 1 représentative est cherché pour le cluster.
État proposé : le module cluster_jonctions est indépendant, son seul boulot est d'écrire dans le vidjil.data (et sur stdout ou ailleurs) quelques merge de clones. Mais 1 représentative = 1 clone de base. Cela va alléger le code.
Pour plus tard : on pourra même déporter cluster-junctions.cpp... dans une commande / prog indépendant, avec l'évaluation des distances et le calcul de la matrice, et tout cela pourrait être fait après fuse.py.
Mikaël, ton avis ? Marc était déjà plutôt pour.
600ef3d2~1..859aedfe bonus : une seule option -r au lieu de -r/-R
sur 14-04/084 en TRG, les fichiers vidjil.data sont identiques par rapport à la release 2014.09