vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2016-11-29T14:31:28+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1073Éviter les « explosions » lors du play (initialiser position)2016-11-29T14:31:28+01:00Vidjil TeamÉviter les « explosions » lors du play (initialiser position)(lors du premier lancement de play)
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et aussi arrivée de nulle part lorsqu'on augmente le nb de clones
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@Duez(lors du premier lancement de play)
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et aussi arrivée de nulle part lorsqu'on augmente le nb de clones
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1075Changer les boutons info/edit de place2016-11-29T14:31:29+01:00Vidjil TeamChanger les boutons info/edit de placeIls sont entre le bouton play et les flèches et c'est trompeur
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@DuezIls sont entre le bouton play et les flèches et c'est trompeur
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1076Passer d'un point de suivi au suivant/précédent avec les flèches directionnelles2016-11-29T14:31:30+01:00Vidjil TeamPasser d'un point de suivi au suivant/précédent avec les flèches directionnellesc'est absolument génial
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@Duezc'est absolument génial
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1081Utiliser le nouveau format .analysis2016-11-29T14:31:34+01:00Vidjil TeamUtiliser le nouveau format .analysissur branche à part
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La semaine prochaine? On essaie déjà de mettre en prod le server avant
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- s'assurer que les fichiers sur bx.vidjil.org sont au nouveau format
- message d'erreur si le fichier est à l'ancien format
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le format...sur branche à part
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La semaine prochaine? On essaie déjà de mettre en prod le server avant
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- s'assurer que les fichiers sur bx.vidjil.org sont au nouveau format
- message d'erreur si le fichier est à l'ancien format
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le format analysis '2014.09' est ok
TODO : supprimer le fallback '2014.02'
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Euh... je ne vois plus les fichiers analysis d'avant (testé pour Van Cel, Lec Lec...)
Est-ce parce que le parser 2014.02 ne marche plus trop ?
Uncaught TypeError: Cannot read property 'length' of undefined model.js:694
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fallback '2014.02' retiré
les fichiers analysis sur la db sont tous au format '2014.09'
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Désolé d'insister, mais je ne vois toujours pas les .analysis (Van Cel par exemple)
(Safari: TypeError: 'undefined' is not an object (evaluating 'c.length'))
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Mikaël, est-ce que cela marche pour toi ?
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Ah, cela commence à fonctionner. C'est de ma faute, je n'avais pas tout rafraîchi ?
On fera ensemble une passe sur les patients mardi
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Que fait-on pour les fichiers existants sur bioinfo.lifl.fr ? Est-ce qu'on reste avec ces vieux fichiers (ce qui va nous poser problème un jour ou l'autre) ? Ou est-ce qu'on les convertit et si oui comment ?
Par exemple pour le run de Necker qui a tourné avec une version récente de Vidjil, sauf que bioinfo n'a pas la dernière version du browser. Si je passe à la dernière version du browser, je casse tout pour les autres utilisateurs… (qui ont des vieux fichiers)
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Proposition :
- on ne casse pas bioinfo, on le laisse à la vieille version, jusqu'à ce que tout nos utilisateurs soient migrés vers rbx.
Et donc pour Necker, deux solutions :
- on relance le run avec la vieille version (branche vidjil.org)
- un jour, on les met sur le serveur
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1082model.js devrait faire moins de 2000 lignes :)2016-11-29T14:31:35+01:00Vidjil Teammodel.js devrait faire moins de 2000 lignes :)
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1084Investigate code coverage for C++ codebase2016-11-29T14:31:37+01:00Vidjil TeamInvestigate code coverage for C++ codebase
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#1083
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#1083https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1083Couverture de code2016-11-29T14:31:37+01:00Vidjil TeamCouverture de codeSuggestion de JeanFred : l’intégration avec Coveralls.io ;) https://coveralls.io/docs/cpp
Pas si facile, encore plus en multi-langage comme nous...
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L’intégration avec Coveralls.io c’est surtout pour se la péter avec un zoli badge ...Suggestion de JeanFred : l’intégration avec Coveralls.io ;) https://coveralls.io/docs/cpp
Pas si facile, encore plus en multi-langage comme nous...
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L’intégration avec Coveralls.io c’est surtout pour se la péter avec un zoli badge sur le GitHub.
En revanche, le calcul de couverture de code ce n’est pas du tout du bonus, c’est vraiment un outil utile :)
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L’utilitaire de référence de couverture de code en C++ semble être gcov (GNU) https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Gcov.html
Gcovr peut être un wrapper utile http://gcovr.com/
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Je rappelle la suggestion de JeanFred : https://github.com/eddyxu/cpp-coveralls :-)
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Pour envoyer sur coveralls.io :
coveralls --exclude algo/tests --exclude algo/tools --gcov-options '\-lp' -t b6fyDWE9GGe8yKsLcqOZxBQIkWgmNyuuU
(attention, notre clé est privée, ne pas la mettre sur le git)
Test sur Travis en cours
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https://coveralls.io/jobs/3009533
Mvouais. Je n'aurais pas du faire un "ln -s algo/core .", ce n'est sûrement pas propre.
Lien avec répertoire de lancement ?
(Je ne touche plus.)
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Celui lancé par Travis : https://coveralls.io/builds/1304118
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Merci Mikaël !
On donc deux manières de voir notre couverture :
https://ci.inria.fr/bonsai/job/Vidjil-coverage/
https://coveralls.io/r/magiraud/vidjil/ (unit seulement)
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Nice :)
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#1084
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@mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1086Afficher une systemBox à côté du sp_system_label2016-11-29T14:31:39+01:00Vidjil TeamAfficher une systemBox à côté du sp_system_labelles systemBox sont en html et sp_system_label en svg ...
on passe tout en html
>> 38de6aea7a2ffcd54e91f4
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parfait
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@Duezles systemBox sont en html et sp_system_label en svg ...
on passe tout en html
>> 38de6aea7a2ffcd54e91f4
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parfait
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1087'color by V/J' en mono et multisystème ne fait que le TRG2016-11-29T14:31:39+01:00Vidjil Team'color by V/J' en mono et multisystème ne fait que le TRGdevrait colorer le système actif dans le scatterPlot ?
mais que se passe-t-il si on change ?
- si cela change automatiquement, bizarre
- si on ne change pas, pas très intuitif
pas facile
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ok, cela peut changer automatiquement....devrait colorer le système actif dans le scatterPlot ?
mais que se passe-t-il si on change ?
- si cela change automatiquement, bizarre
- si on ne change pas, pas très intuitif
pas facile
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ok, cela peut changer automatiquement...
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apparament cela fonctionne, système actif
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1088Désactiver certaines fonctionnalités quand il y a un seul point (typiquement ...2016-11-29T14:31:40+01:00Vidjil TeamDésactiver certaines fonctionnalités quand il y a un seul point (typiquement diagnostic) : play, graph(et plusieurs de nos clients veulent se lancer dans le diagnostic)
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08f14fcbd
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parfait
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(et si on le veut vraiment, on peut toujours aller chercher le graphe, pourquoi pas)
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@Duez(et plusieurs de nos clients veulent se lancer dans le diagnostic)
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08f14fcbd
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parfait
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(et si on le veut vraiment, on peut toujours aller chercher le graphe, pourquoi pas)
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1089Confirm patient deletion : Yes / No2016-11-29T14:31:41+01:00Vidjil TeamConfirm patient deletion : Yes / No
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1090Pouvoir éditer les détails d'un patient depuis la page de liste des samples2016-11-29T14:31:41+01:00Vidjil TeamPouvoir éditer les détails d'un patient depuis la page de liste des samples
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1091Pas de bouton 'register' pour les utilisateurs2016-11-29T14:31:42+01:00Vidjil TeamPas de bouton 'register' pour les utilisateursSeuls les admins peuvent ajouter des utilsateurs
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@DuezSeuls les admins peuvent ajouter des utilsateurs
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1092Pas de rappel de mot de passe (1 login = 1 équipe pour l'instant)2016-11-29T14:31:43+01:00Vidjil TeamPas de rappel de mot de passe (1 login = 1 équipe pour l'instant)et surtout, avec faux emails, on ne veut pas envoyer nos mots de passe à des inconnus :)
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aucun risque on a pas de serveur smtp
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désactiver pour le moment
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:-)
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@Duezet surtout, avec faux emails, on ne veut pas envoyer nos mots de passe à des inconnus :)
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aucun risque on a pas de serveur smtp
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désactiver pour le moment
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:-)
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1093Au démarrage de Vidjil (si mode database), aller directement sur la page "Login"2016-11-29T14:31:43+01:00Vidjil TeamAu démarrage de Vidjil (si mode database), aller directement sur la page "Login"Avec un lien "Continue without connecting to the server"
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@DuezAvec un lien "Continue without connecting to the server"
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1094Nettoyage suite au déplacement de l'aide (bougée vers doc/browser.org)2016-11-29T14:31:44+01:00Vidjil TeamNettoyage suite au déplacement de l'aide (bougée vers doc/browser.org)
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1095Message d'avertissement quand on quitte l'onglet/navigateur pendant un upload2016-11-29T14:31:45+01:00Vidjil TeamMessage d'avertissement quand on quitte l'onglet/navigateur pendant un uploadNe semble pas fonctionner sous FF32
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fix for firefox
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@DuezNe semble pas fonctionner sous FF32
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fix for firefox
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1096Vérifier les permissions pour supprimer/modifier. Ne montrer que les boutons ...2016-11-29T14:31:46+01:00Vidjil TeamVérifier les permissions pour supprimer/modifier. Ne montrer que les boutons nécessaires
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1102pas de dowload de fasta pour l'instant2016-11-29T14:31:50+01:00Vidjil Teampas de dowload de fasta pour l'instant
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1103save analysis ne se souvient pas des noms de points modifiés2016-11-29T14:31:50+01:00Vidjil Teamsave analysis ne se souvient pas des noms de points modifiésne voir cela qu'après le nouveau format .analysis
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@Duezne voir cela qu'après le nouveau format .analysis
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@Duez