vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2018-08-09T14:12:06+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2751La selection par les labels de certains axes est fausse2018-08-09T14:12:06+02:00Thonier FlorianLa selection par les labels de certains axes est fausseSuite à #2116 et !107, je me suis aperçu que certaines séléctions (qu isont dorenavent misent en avant par le pointeur) ne retourne pas des séléctions adéquates.
* le preset 2 (Vgene/Nlength) selectionne par exemple l'ensemble des clones...Suite à #2116 et !107, je me suis aperçu que certaines séléctions (qu isont dorenavent misent en avant par le pointeur) ne retourne pas des séléctions adéquates.
* le preset 2 (Vgene/Nlength) selectionne par exemple l'ensemble des clones si on clique sur plus ou moins n'importe lequel des labels Nlength.
* Il en va de même pour l'ensemble des axes numériques, avec parfois un simple décalage (clone consensus length en histogramme), ou parfois une séléction completement aléatoire ().
@magiraud @mikael-s @RyanHerbWeb 2017.11Thonier FlorianThonier Florianhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2704Remplacer les presets avec « clone consensus length » par « clone average len...2017-11-29T08:01:02+01:00Mikaël SalsonRemplacer les presets avec « clone consensus length » par « clone average length » ?La longueur de la séquence consensus est peu interprétable et difficile à expliquer, on devrait se contenter d'afficher la longueur des reads moyenne d'un clone.
Un exemple où cela serait nettement mieux (ne pas se mettre en mode bar po...La longueur de la séquence consensus est peu interprétable et difficile à expliquer, on devrait se contenter d'afficher la longueur des reads moyenne d'un clone.
Un exemple où cela serait nettement mieux (ne pas se mettre en mode bar pour tester, à cause de #2703) : http://app.vidjil.org/index.html?sample_set_id=25317&config=2
Quand on regarde la longueur de la séquence consensus, on voit que le clone principal a une longueur un peu inférieure à ses sous-clones, ce qui pourrait donner l'impression d'une sous-population différente.
Mais en fait quand on passe en « clone average read length », on se rend compte que tous ont bien la même taille moyenne de reads.
La différence de longueur de séquence consensus est juste due à l'heuristique de calcul de la consensus et apporte plus de bruit que d'information.
Pour l'instant bloqué par #2703, mais à faire juste après.
cc @flothoniWeb 2017.11https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2703Axes et value en string : bug lors du passage en « clone average read length ...2017-11-29T11:01:58+01:00Mikaël SalsonAxes et value en string : bug lors du passage en « clone average read length » en mode bar1. Aller sur un résultat quelconque : http://app.vidjil.org/index.html?sample_set_id=3241&config=32
2. Dans le menu plot, mettre l'axe des x à « clone average read length » (tout va bien)
3. Dans le menu plot, passer en mode « bar »
Aïe...1. Aller sur un résultat quelconque : http://app.vidjil.org/index.html?sample_set_id=3241&config=32
2. Dans le menu plot, mettre l'axe des x à « clone average read length » (tout va bien)
3. Dans le menu plot, passer en mode « bar »
Aïe. On a une erreur :
```
numerical_axis.js:273
TypeError: value.toFixed is not a function
```Web 2017.11Ryan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2116Sélection avec un axe de la grille/histogramme : l'indiquer à l'utilisateur2018-06-04T10:24:06+02:00Mikaël SalsonSélection avec un axe de la grille/histogramme : l'indiquer à l'utilisateurExcellente suggestion d'Aurélie : le curseur de la souris lorsqu'on survole un label d'axe de la grille/histogramme ne se transforme pas ce qui n'aide pas à penser que ces labels sont cliquables. Il faut mettre un pointeur avec la petite...Excellente suggestion d'Aurélie : le curseur de la souris lorsqu'on survole un label d'axe de la grille/histogramme ne se transforme pas ce qui n'aide pas à penser que ces labels sont cliquables. Il faut mettre un pointeur avec la petite main (`cursor: pointer`).
Il me semble que c'est géré par D3. Je ne suis pas sûr que ce soit aussi simple que ça en a l'air.
@magiraud @RyanHerb @tydax @flothoni Web 2017.11Thonier FlorianThonier Florian