vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2021-03-22T09:31:46+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2107Indication onlyV trompeuse sur anayse de capture2021-03-22T09:31:46+01:00Thonier FlorianIndication onlyV trompeuse sur anayse de captureSur un set issu d'analyses de Necker :
Sur 4 millions de séquences issus de capture, avec de nombreuses sondes autre que les J, on a une forte proportion de séquences faussement anotées "only V" suite à quelques Kmer éparses trouvés da...Sur un set issu d'analyses de Necker :
Sur 4 millions de séquences issus de capture, avec de nombreuses sondes autre que les J, on a une forte proportion de séquences faussement anotées "only V" suite à quelques Kmer éparses trouvés dans la séquence ( ~25% des reads sont concernés).
En détails, ceux-ci ne sont composés que de 5 ou 6 kmer répartis sur toute la longueur du read.
@magiraud @mikael-s Algo 2017.03https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2230Seuil provisoire pour les D, e-valeur2017-03-14T09:41:45+01:00Mathieu GiraudSeuil provisoire pour les D, e-valeurSolution temporaire pour #1879, pour %"Algo 2017.03"Solution temporaire pour #1879, pour %"Algo 2017.03"Algo 2017.03Mikaël SalsonMikaël Salson