vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2017-10-06T13:47:35+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2581Tip of the day : avoir une liste de 20 tips2017-10-06T13:47:35+02:00Mathieu GiraudTip of the day : avoir une liste de 20 tipsProposition de @Cyanael et de tous
Voir aussi #1320 / #1945Proposition de @Cyanael et de tous
Voir aussi #1320 / #1945Web 2017.11https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2332clonedb: option pour partager ou non anonymement ses séquences2017-12-04T11:47:21+01:00Mathieu Giraudclonedb: option pour partager ou non anonymement ses séquencesÉvoqué lors de la discussion ~"ec-ngs".
Opt-in ? opt-out ? (Cela peut être aussi par mail, lors du deuxième mail, pour ne pas braquer tout de suite les ~"com-first-time-user")
cc @aurelBZH @flothoniÉvoqué lors de la discussion ~"ec-ngs".
Opt-in ? opt-out ? (Cela peut être aussi par mail, lors du deuxième mail, pour ne pas braquer tout de suite les ~"com-first-time-user")
cc @aurelBZH @flothonihttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2278Proposer au login l'acces à la page http://app.vidjil.org/analyze2017-04-03T11:55:12+02:00Thonier FlorianProposer au login l'acces à la page http://app.vidjil.org/analyzeLors du login, on propose un champs démo, il pourrait être intéressant aussi de faire de la com pour la page [analyse](http://app.vidjil.org/analyze) avec un lien
Précise-t-on si la page est encore en évolution ?
@magiraud @mikael-s @...Lors du login, on propose un champs démo, il pourrait être intéressant aussi de faire de la com pour la page [analyse](http://app.vidjil.org/analyze) avec un lien
Précise-t-on si la page est encore en évolution ?
@magiraud @mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2275analyze: message d'erreur lorsqu'on n'envoie pas de fichier FASTA2017-03-22T15:10:36+01:00Mathieu Giraudanalyze: message d'erreur lorsqu'on n'envoie pas de fichier FASTAVu par @flothoni : le ~"segmenter-app" (maintenant sur http://app.vidjil.org/analyze) devrait donner une erreur correcte ("This is not a FASTA file") si on n'envoie pas un fichier Fasta, ce que peut faire un ~"com-first-time-user".
Est-...Vu par @flothoni : le ~"segmenter-app" (maintenant sur http://app.vidjil.org/analyze) devrait donner une erreur correcte ("This is not a FASTA file") si on n'envoie pas un fichier Fasta, ce que peut faire un ~"com-first-time-user".
Est-ce que le controlleur renvoie déjà quelque chose dans ce cas ?
cc @tydax @mikael-sMikaël SalsonMikaël Salsonhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2237Pas de README pour l'installation algo ?2017-03-15T16:38:40+01:00Mathieu GiraudPas de README pour l'installation algo ?Mika, de ~"Paris-Pitié" , a fait remonter ce matin que ce n'était pas facile d'installer. Quand on ouvre le `.tar.gz`, pas de `README` ?
(Je croyais qu'il venait du `doc/algo.org`)
cc @mikael-sMika, de ~"Paris-Pitié" , a fait remonter ce matin que ce n'était pas facile d'installer. Quand on ouvre le `.tar.gz`, pas de `README` ?
(Je croyais qu'il venait du `doc/algo.org`)
cc @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2081Indicateur de progression au "démarrage" du client, en particulier pour le li...2017-01-18T13:17:55+01:00Mathieu GiraudIndicateur de progression au "démarrage" du client, en particulier pour le lien vers la dbQuand on utilise le client en connecté, on a souvent des soucis avec un message « Cannot connect to database, retry in a few seconds ». On préfererait ne pas avoir de timeout... mais c'est déjà cela, on est au courant.
Le problème est a...Quand on utilise le client en connecté, on a souvent des soucis avec un message « Cannot connect to database, retry in a few seconds ». On préfererait ne pas avoir de timeout... mais c'est déjà cela, on est au courant.
Le problème est au "démarrage" de l'application. Il m'est arrivé plusieurs fois de vouloir accéder à https://app.vidjil.org/ et... d'attendre. L’onglet « patients » met du temps à s’afficher, et parfois, rien ne se passe.
Je ne me souviens pas de la séquence d’opérations au début (y a-t-il un timeout ou pas ?), mais en tout cas on devrait avoir un truc rapide à charger, puis "Vidjil is loading", et un message de warning/error en cas de timeout ou d'attente inhabituelle.
@mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2065Pre-process par défaut2019-10-07T16:10:55+02:00Mathieu GiraudPre-process par défautSuite à #2048.
Faudrait-il des entrées pour le pre-process dans `controllers/default.py` ?
Évidemment, on peut fonctionner sans pear... Mais bon, avoir des entrées permettrait de faire des bons exemples. On pourrait par défaut cré...Suite à #2048.
Faudrait-il des entrées pour le pre-process dans `controllers/default.py` ?
Évidemment, on peut fonctionner sans pear... Mais bon, avoir des entrées permettrait de faire des bons exemples. On pourrait par défaut créer tout de même les deux pre-process, en mettant les droits pour que cela ne soit pas accessible tant que l'admin ne les ait pas activés.
@mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2058Tutorial : Mettre un fichier démo de L3 sans analyse déjà faite2017-11-20T01:28:28+01:00Mikaël SalsonTutorial : Mettre un fichier démo de L3 sans analyse déjà faiteLe [tutoriel](doc/tutorial/mastering-vidjil.tex) demande d'ouvrir le patient L3 depuis l'application web, mais la version chargée est celle avec analyse, alors que les manipulations demandées dans le tutoriel supposent que l'analyse n'es...Le [tutoriel](doc/tutorial/mastering-vidjil.tex) demande d'ouvrir le patient L3 depuis l'application web, mais la version chargée est celle avec analyse, alors que les manipulations demandées dans le tutoriel supposent que l'analyse n'est pas chargée (par exemples les merges sont déjà faits). Il faut donc probablement proposer une version de L3 sans analyse, mais comment ?
@magiraudWeb 2017.11https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1959Tutorial2016-12-27T16:18:15+01:00Vidjil TeamTutorial- faire une passe sur la traduction d'Aurélie
- mettre éventuellement tout en LaTeX
- mettre éventuellement à jour l'ensemble, EN+FR
- envoyer à Aurélie, mais aussi à Naïs + d'autres éventuellement
***
Mikaël+Mathieu: tout est fait, r...- faire une passe sur la traduction d'Aurélie
- mettre éventuellement tout en LaTeX
- mettre éventuellement à jour l'ensemble, EN+FR
- envoyer à Aurélie, mais aussi à Naïs + d'autres éventuellement
***
Mikaël+Mathieu: tout est fait, reste plus que
- faire http://vidjil.org/doc (page statique, lien vers tout)
- (fichier du tutorial ? L3 Demo, ok ?)
- envoyer à Aurélie + Naïs
***
ok
***
@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1944Clarifier ce que fait chaque config, éventuellement les renommer2021-05-25T10:05:29+02:00Vidjil TeamClarifier ce que fait chaque config, éventuellement les renommerÉventuellement renommer certaines configs (`multi++` ? `Vidjil multi++` ?)
Penser aussi à `controller/defaults.py`.
Éventuellement renommer certaines configs (`multi++` ? `Vidjil multi++` ?)
Penser aussi à `controller/defaults.py`.
Déploiement 2020.06https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1845Mieux packager les releases algo, /README.md2020-08-27T13:00:38+02:00Vidjil TeamMieux packager les releases algo, /README.mdpour les releases algo :
doc/algo.org -> /README.org ?
CHANGELOG, LICENSE aussi dans / ?
Enlever browser/ ?
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@magiraud @mikael-spour les releases algo :
doc/algo.org -> /README.org ?
CHANGELOG, LICENSE aussi dans / ?
Enlever browser/ ?
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1825annotations: affichage par défaut, en gris2016-12-27T16:14:19+01:00Vidjil Teamannotations: affichage par défaut, en grisOn en avait parlé il y a quelque temps : si les champs sont vides (ou composés uniquement d'espaces), ce serait bien de voir "Comment on patient" et "Comment on sample" affiché en *gris*.
Ce n'est pas vraiment une valeur par défaut : s...On en avait parlé il y a quelque temps : si les champs sont vides (ou composés uniquement d'espaces), ce serait bien de voir "Comment on patient" et "Comment on sample" affiché en *gris*.
Ce n'est pas vraiment une valeur par défaut : si on double-clique dessus, alors le champ est bien vide. C'est juste pour aider/inciter les utilisateurs à remplir ce champ (surtout ceux qui ont rien mis dans "info", qui arrivent sur la page et qui peuvent se demander ce que sont ces boîtes.)
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attribut placeholder : http://www.w3schools.com/tags/att_textarea_placeholder.asp
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merci Mikaël !
0a8268e. Ryan, je te laisse vérifier que je n'ai pas fait de bêtises, j'ai changé le span en textarea, tout a l'air de fonctionner.
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cela dit placeholder fonctionne aussi avec span normalement (j'ai mis le lien vers textarea car je pensais qu'il s'agissait d'un textarea).
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Mmm... j'avais essayé, cela ne marchait pas. Cela dit, moralement ce champ est bien un textarea.
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Dans l'absolut, il aurait été possible de mettre des placeholders avec du css dans les spans.
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1706Couleurs : est-ce qu'on met une coloration par défaut ?2017-12-04T11:20:35+01:00Vidjil TeamCouleurs : est-ce qu'on met une coloration par défaut ?Comparaison avec ARResT : Florian trouve plus joli le fait d'avoir déjà des colorations. A discuter.
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@Cyanael @mikael-s @magiraudComparaison avec ARResT : Florian trouve plus joli le fait d'avoir déjà des colorations. A discuter.
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@Cyanael @mikael-s @magiraudhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1190Métadonnées de runs / Valeurs par défaut des listes PCR, Sequencer, Producer2021-10-22T10:00:14+02:00Vidjil TeamMétadonnées de runs / Valeurs par défaut des listes PCR, Sequencer, ProducerJust pour info : https://github.com/lexnederbragt/developments-in-next-generation-sequencing/blob/master/developments%20in%20next%20generation%20sequencing.txt
et on ne les veut pas tous
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mécanisme actuel n'est pas parfait, mais cela...Just pour info : https://github.com/lexnederbragt/developments-in-next-generation-sequencing/blob/master/developments%20in%20next%20generation%20sequencing.txt
et on ne les veut pas tous
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mécanisme actuel n'est pas parfait, mais cela ira pour l'instant
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- Avoir quelque part une liste en dur de valeurs proposées (reprendre patients '===' de System)
- Confidentialité : ne pas remplir avec les valeurs des autres utilisateurs
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1113Login ne met pas d'erreur si mauvais login/mot de passe2020-09-24T15:02:03+02:00Vidjil TeamLogin ne met pas d'erreur si mauvais login/mot de passe
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@Duez
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@Duez