vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2023-03-28T16:14:38+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/5123Warning view; Ugly display on chrome2023-03-28T16:14:38+02:00THONIER FlorianWarning view; Ugly display on chromeWhile I was testing to take screenshot for documentation, I found that warning view is not similar that the view on firefox.
![Screenshot_20230228_102853](/uploads/7e5eff9708e63deadfb4961ff384b425/Screenshot_20230228_102853.png)While I was testing to take screenshot for documentation, I found that warning view is not similar that the view on firefox.
![Screenshot_20230228_102853](/uploads/7e5eff9708e63deadfb4961ff384b425/Screenshot_20230228_102853.png)Web 2023.10https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2541L'infobox peut être trop large en mode utilisateur2017-11-29T09:16:25+01:00Mikaël SalsonL'infobox peut être trop large en mode utilisateurQuand on va [à cette adresse](http://app.vidjil.org/?custom=26319&custom=26320&custom=26321&custom=26322) en tant qu'administrateur, l'infobox est normale.
![Screenshot_20170628_091558](/uploads/688b31b2f2953832e443a67e5e63f4a1/Screensh...Quand on va [à cette adresse](http://app.vidjil.org/?custom=26319&custom=26320&custom=26321&custom=26322) en tant qu'administrateur, l'infobox est normale.
![Screenshot_20170628_091558](/uploads/688b31b2f2953832e443a67e5e63f4a1/Screenshot_20170628_091558.png)
En revanche quand on y va en tant qu'utilisateur (102), celle-ci est trop large car le nom du fichier est trop long.
![Screenshot_20170628_091544](/uploads/366e00505e28aa6f0eae0496eb5300fd/Screenshot_20170628_091544.png)
La différence s'explique probablement par le fait qu'on ajoute l'identifiant dans le nom du fichier, quand on est admin. Mais le nom du fichier ne devrait pas prendre autant de place en mode utilisateur. Ici cela prend quasiment la moitié de mon écran.Web 2018.01https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4757axes: avoir plus de place (responsive ?) pour les légendes longues2021-06-11T14:47:03+02:00Mathieu Giraudaxes: avoir plus de place (responsive ?) pour les légendes longuesSuite à !940
![ax](/uploads/acbffa2ca7be0fd02f1916c835270355/ax.jpg)Suite à !940
![ax](/uploads/acbffa2ca7be0fd02f1916c835270355/ax.jpg)marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4740"Unknown" tant qu'on n'a pas envoyé sur IMGT ?2021-03-31T15:24:00+02:00Mathieu Giraud"Unknown" tant qu'on n'a pas envoyé sur IMGT ?The following discussion from !836 should be addressed:
- [ ] @mikael-s started a [discussion](https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/merge_requests/836#note_498331): (+1 comment)
> C'est voulu le point (et la zone verte #4737) l...The following discussion from !836 should be addressed:
- [ ] @mikael-s started a [discussion](https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/merge_requests/836#note_498331): (+1 comment)
> C'est voulu le point (et la zone verte #4737) lorsqu'on n'a pas les informations d'IMGT sur la productivité et le % d'identité ? Quand on a passe la souris au dessus du point on a un popup nous affichant « unknown ».
>
> ![aligner](/uploads/855c08725c89447119f426ea398f0758/aligner.png)
Mais bon, que mettre d'autre ? Rien au lieu de "unknown" ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4715Supprimer le nom de l'usager de la fenêtre db2021-03-10T19:25:04+01:00Mathieu GiraudSupprimer le nom de l'usager de la fenêtre dbDepuis #XXXX, le nom de l'utilisateur est affiché en haut. Quand une fenêtre db est ouverte, on le voit deux fois.Depuis #XXXX, le nom de l'utilisateur est affiché en haut. Quand une fenêtre db est ouverte, on le voit deux fois.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4447Positionner correctement les axes du graphes à l'initialisation2020-08-04T09:28:18+02:00Mathieu GiraudPositionner correctement les axes du graphes à l'initialisationhttps://app.vidjil.org/3241-25 : à l'initialisation, les axes du ~"client-graph" viennent du coin supérieur gauche et, selon la machine, mettent quelques secondes à être au bon endroit. Ce n'est pas très beau, il faudrait soit les positi...https://app.vidjil.org/3241-25 : à l'initialisation, les axes du ~"client-graph" viennent du coin supérieur gauche et, selon la machine, mettent quelques secondes à être au bon endroit. Ce n'est pas très beau, il faudrait soit les positionner directement, soit attendre qu'ils soient positionnés pour afficher le ~"client-graph".
Voir aussi #4112 et #2489.
cc @duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4446Notation scientifique à partir de 1e-4 sur les axes log2021-02-19T08:16:10+01:00Mathieu GiraudNotation scientifique à partir de 1e-4 sur les axes logmarc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4342problème d'échelle sur les axes2021-02-19T08:16:10+01:00Thonier Florianproblème d'échelle sur les axesEn testant une nouvelle option algo, j'ouvre un fichier qui ne contient des clones qui ne font nunquement que 300 et 301 nt.
Le rendu n'est pas jolie du tout. Les clones ont maintenant une largeur aussi large que l'ensemble du graph.
...En testant une nouvelle option algo, j'ouvre un fichier qui ne contient des clones qui ne font nunquement que 300 et 301 nt.
Le rendu n'est pas jolie du tout. Les clones ont maintenant une largeur aussi large que l'ensemble du graph.
En voici un exemple:
![Screenshot_20200611_180027](/uploads/0c6be42524f2cebc8a4621f42fa5f573/Screenshot_20200611_180027.png)https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4228Largeurs des colonnes dans la liste des samples d'un set2020-04-14T11:07:52+02:00Mathieu GiraudLargeurs des colonnes dans la liste des samples d'un setVu avec @flothoni.
- `size` est bien trop grand
- certaines classes en dur ?
- passer à flex ?Vu avec @flothoni.
- `size` est bien trop grand
- certaines classes en dur ?
- passer à flex ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4192Les clones bougent à chaque clic2020-02-20T16:19:05+01:00Mikaël SalsonLes clones bougent à chaque clicDepuis D3V5 (?) les clones bougent beaucoup plus à chaque clic sur un clone.
Voici un exemple maintenant (sur [L3](http://app.vidjil.org/?set=25736&config=25)).
Notez comme le paquet de clones TRG à droite bouge beaucoup alors que je cl...Depuis D3V5 (?) les clones bougent beaucoup plus à chaque clic sur un clone.
Voici un exemple maintenant (sur [L3](http://app.vidjil.org/?set=25736&config=25)).
Notez comme le paquet de clones TRG à droite bouge beaucoup alors que je clique sur un autre clone.
![vidjil2](/uploads/17d53c760f25d8cb0c5fe75343084f4b/vidjil2.ogv)
Et la situation l'année dernière, plus stable :
![vidjil1](/uploads/cf82756c7a9118828b1eb4585a640625/vidjil1.ogv)marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4117Déplacement de l'ascenseur horizontal du segmenter2020-10-14T11:29:54+02:00Mathieu GiraudDéplacement de l'ascenseur horizontal du segmenterAu moment où je déplace l'ascenseur horizontal du segmenteur, le bloc avec les ids bouge (avant de revenir en place). Cela se voit particulièrement quand on bouge "vite" cet ascenseur.Au moment où je déplace l'ascenseur horizontal du segmenteur, le bloc avec les ids bouge (avant de revenir en place). Cela se voit particulièrement quand on bouge "vite" cet ascenseur.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3895Comparer dans le client beaucoup de samples d'un coup2019-12-13T12:26:11+01:00Mathieu GiraudComparer dans le client beaucoup de samples d'un coup@Anne, dans https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/issues/3889#note_187960 :
> la visualisation par run est aussi un peu longue à ouvrir et pas très facile à manier (65 samples dans mon dernier run)
Oui ! C'est dommage. Nous avons des c...@Anne, dans https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/issues/3889#note_187960 :
> la visualisation par run est aussi un peu longue à ouvrir et pas très facile à manier (65 samples dans mon dernier run)
Oui ! C'est dommage. Nous avons des choses en cours de développement pour avoir une vue d'ensemble sur un run via une page du ~server (~"server\-qc\-stats"), mais on pourrait se demander ce qu'on pourrait voir depuis le ~client.
L'axe `number of samples sharing each clone` peut être utile. Voir par exemple http://app.vidjil.org/?set=30982&config=2&plot=v,nbSamples,grid&clone=7,25,166 , ici au moins trois clones se trouvent dans au moins 10 samples.
Y aurait-il un moyen de mieux voir cela ?
- limiter le ~"client\-graph" ? À un moment, on n'affichait qu'au plus 20 samples (mais c'était ~"server\-fuse"). Cela pourrait être une limitation soft, ou les données sont présentes et on se contente de cacher (dans l'épingle à droite) des choses (serait-ce plus rapide ?)
- enlever complètement le ~"client\-graph" ? (mais comment indiquer clairement qu'on visualise alors un sample ? mettre en valeur le nom du sample en haut à gauche ?)
- avoir par défaut une vue ~"client\-grid" avec l'axe `nbSamples` ? (~"!\-easy") Si on enlève le ~"client\-graph", on pourrait avoir cette vue en plus de la ~"client\-grid" habituelle.
- avoir une autre vue faite pour cela, qui remplace le ~client-graph et qui donne un "résumé" lisible (type #1887) ? (~"!\-hard")
cc @flothoni @mikael\-s
~"client\-axis"https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3874Tout passe en selection si shift+click sur les locus2019-03-25T13:17:40+01:00Thonier FlorianTout passe en selection si shift+click sur les locusAprès il faut donc reclicker en dehors pour "désélectionner", si on a une liste de clones select, on peut très facilement l'effacer.
Je ne sais pas à quoi c'est dû. Ca ne me semble pas constant. Je pense à un problème dans la fonction ...Après il faut donc reclicker en dehors pour "désélectionner", si on a une liste de clones select, on peut très facilement l'effacer.
Je ne sais pas à quoi c'est dû. Ca ne me semble pas constant. Je pense à un problème dans la fonction de désactivation des combinaisons de touches.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3802Quelques problèmes de CSS - div tronquée/cachée2019-03-15T10:49:57+01:00Thonier FlorianQuelques problèmes de CSS - div tronquée/cachée![Screenshot_20190315_104429](/uploads/f0260c5a04481625b6782b62a2190f4f/Screenshot_20190315_104429.png)
On a plusieurs div qui me semble être mal placées et qui se retrouvent tronquées. Ici l'exemple concerne la pagination, mais je croi...![Screenshot_20190315_104429](/uploads/f0260c5a04481625b6782b62a2190f4f/Screenshot_20190315_104429.png)
On a plusieurs div qui me semble être mal placées et qui se retrouvent tronquées. Ici l'exemple concerne la pagination, mais je crois qu'il y a plusieurs endroits ou l'on peut retrouver ce problème.
Faire une passe sur ces petits points d'aspect HTLM/CSS.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3737Afficher dans la grid des clones en carrés ou autre2019-02-14T20:14:03+01:00Mathieu GiraudAfficher dans la grid des clones en carrés ou autreExtrait de #3735 et #2603. Pas de discussion bio ici, uniquement graphique.
Saurait-on afficher des clones différemment dans le ~"client\-grid" ? En gardant la couleur mais en changeant la forme ?
Par exemple :
- carré pivoté à 45°
- c...Extrait de #3735 et #2603. Pas de discussion bio ici, uniquement graphique.
Saurait-on afficher des clones différemment dans le ~"client\-grid" ? En gardant la couleur mais en changeant la forme ?
Par exemple :
- carré pivoté à 45°
- carré
- rond évidé
- triangle
- hexagone
- étoile avec beaucoup de branches
Pas sûr qu'on voie toutes ces choses quand les clones sont petits...
Et que pourrait-on imaginer de similaire lorsqu'on est en ~"client\-bar", voire sur le ~"client\-graph" ?
Utilisation des pointillés dans un trait ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3642vmi: div data en bas à gauche de la liste déborde2018-12-21T17:30:37+01:00Mathieu Giraudvmi: div data en bas à gauche de la liste débordeConfirmé par @flothoni, avec éléments qui glissent sous la barre.
https://vdb.vidjil.org/browser/?set=28977&config=25&plot=allele_v,allele_j,gridConfirmé par @flothoni, avec éléments qui glissent sous la barre.
https://vdb.vidjil.org/browser/?set=28977&config=25&plot=allele_v,allele_j,gridhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3612Le bouton CDR3 devrait être 2-3 pixels plus haut, aligné avec "toBlast"2018-11-07T13:41:21+01:00Mathieu GiraudLe bouton CDR3 devrait être 2-3 pixels plus haut, aligné avec "toBlast"https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3604vmi et info : X5 sur deux lignes au lieu de trois2018-11-02T10:45:08+01:00Mathieu Giraudvmi et info : X5 sur deux lignes au lieu de troisDiscuté avec @RyanHerb, probablement vient de `flex`.
~"priority\-1\-low" car a priori n'affecte que des cas particuliers type Demo X5.Discuté avec @RyanHerb, probablement vient de `flex`.
~"priority\-1\-low" car a priori n'affecte que des cas particuliers type Demo X5.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3439L'animation BAR > GRID fait parfois "sauter" temporairement les clones hors d...2018-08-13T18:09:32+02:00Mathieu GiraudL'animation BAR > GRID fait parfois "sauter" temporairement les clones hors du sp?patient=146&config=26 -> alterner entre grid et bar?patient=146&config=26 -> alterner entre grid et barhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2990Quand on se déconnecte, long message arrivant dans la console2018-03-08T14:54:35+01:00Mathieu GiraudQuand on se déconnecte, long message arrivant dans la consoleVu par @Aurelie, je l'ai aussi vu. Un grand message d'erreur arrive (et ce n'est pas sûr qu'on se déconnecte bien quand même).
Lien avec #2571 ?
cc @RyanHerbVu par @Aurelie, je l'ai aussi vu. Un grand message d'erreur arrive (et ce n'est pas sûr qu'on se déconnecte bien quand même).
Lien avec #2571 ?
cc @RyanHerb