vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2022-01-07T12:50:35+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4923Tags avec valeur / scoped tags2022-01-07T12:50:35+01:00Mathieu GiraudTags avec valeur / scoped tags
Proposition de @flothoni : `#age=25 #disease=LLC`. Cela correspond bien au modèle de stats. Florian s'en sert déjà pour de l'import de données.
- modèle: est-ce qu'on a envie d'encourager cela ? Est-ce que cela n'encourage pas à trop ...
Proposition de @flothoni : `#age=25 #disease=LLC`. Cela correspond bien au modèle de stats. Florian s'en sert déjà pour de l'import de données.
- modèle: est-ce qu'on a envie d'encourager cela ? Est-ce que cela n'encourage pas à trop de variations ?
- listes prédéfinies: si oui, est-ce que par exemple `#LLC` serait équivalent/remplacé par `#disease=LLC` ?
- UI: un rendu à la [Gitlab scoped label](https://docs.gitlab.com/ee/user/project/labels.html#scoped-labels) ? Mais alors que donne la recherche (est-ce que `#age` doit récupérer `#age=25` ?) Ou bien, pour `#disease=LLC`, juste afficher `LLC` ?
- Recherches plus complexes (`age<25`) ?2022-07-07https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2171Permettre des OR dans les requêtes de recherche de sample sets ou samples2024-02-21T14:18:07+01:00Mathieu GiraudPermettre des OR dans les requêtes de recherche de sample sets ou samplesVoir dicussion soulevée par @flothoni dans #2170.
On souhaiterait éventuellement accepter des `OU` logiques dans requêtes (`advanced_filter` dans `modules/vijdil_utils.py`). Et d'autres choses (parenthèses ?) ? Discuter déjà de la syntax...Voir dicussion soulevée par @flothoni dans #2170.
On souhaiterait éventuellement accepter des `OU` logiques dans requêtes (`advanced_filter` dans `modules/vijdil_utils.py`). Et d'autres choses (parenthèses ?) ? Discuter déjà de la syntaxe.
cc @mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2166Méta-données : provenance de l'échantillon2017-02-07T17:07:42+01:00Mathieu GiraudMéta-données : provenance de l'échantillonSang ou moelle ? Parafine ?
Autres métadonnées en réflexion : #1558 #1556 #1555
@mikael-sSang ou moelle ? Parafine ?
Autres métadonnées en réflexion : #1558 #1556 #1555
@mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1558Méta-données : sexe2021-02-04T10:01:45+01:00Vidjil TeamMéta-données : sexeAjouter un champ *facultatif* "sex" aux patients.
Rien d'urgent.
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Une branche avait été faite par Ryan lors de la Vidjil Rando 2016.
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@magiraud @RyanHerb @mikael-sAjouter un champ *facultatif* "sex" aux patients.
Rien d'urgent.
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Une branche avait été faite par Ryan lors de la Vidjil Rando 2016.
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@magiraud @RyanHerb @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1556Méta-données : technique de séquençage2023-03-02T09:42:32+01:00Vidjil TeamMéta-données : technique de séquençageDNA-seq, RNA-seq, Capture, PCR, nested PCR... (plusieurs choix possibles...)
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Ping. ADT, Aurélien ?
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@magiraud @mikael-sDNA-seq, RNA-seq, Capture, PCR, nested PCR... (plusieurs choix possibles...)
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Ping. ADT, Aurélien ?
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1555Méta-données : maladie2017-02-08T13:42:46+01:00Vidjil TeamMéta-données : maladieévoqué par Cédric :
- T-ALL B-ALL CLL
- Lymphome (T) Lymphome (B) (classification pas si simple)
Et aussi AML ? CML ?
On oriente très fortement hémato (pour de l'immuno standard, pas besoin...)
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@nobodyévoqué par Cédric :
- T-ALL B-ALL CLL
- Lymphome (T) Lymphome (B) (classification pas si simple)
Et aussi AML ? CML ?
On oriente très fortement hémato (pour de l'immuno standard, pas besoin...)
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@nobody