should-vdj-to-tap.py: mark as failed a test when there is an UNSEG
The only are .should-locus tests.
Showing
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Je ne comprends pas pourquoi
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Dans les rares cas où le FineSegmenter dit
UNSEG
(comme dans 941f8e6f), la sortie devidjil-algo
est :>IGHV3-23*01 IGHJ6 ! @42 @23 IGH UNSEG only J/3' 7.390463e+01 7.390183e+01/2.807806e-03 GTAAAACGACGGCCAGTAGGTGCAGCTGGTGGAGTCGTATTAGGTCACCGTCTCCTCAGGTAAGCCCTATAGTGAGTCGTATTA
Le
IGHV3-23*01 IGHJ6
au début est... ce qui est dans le.should-vdj
. Et jusqu'à avant ce commit ce test "passait" pourshould-to-vdj.py
. Ce commit permet que ce test soit bien en failed. Normalement les tests passent toujours surdev
(testé chez moi, https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/pipelines/29849 en cours). -
Owner
(Et on a bien quelques tests qui disent qu'on doit trouver
UNSEG
, mais ce sont des.should-locus
, traités par l'autre branche duif
) -
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ok, merci
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