Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Ne pas relancer filterBioReaderWithACAutomaton() dans vidjil.cpp

#3271 · opened Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud merge-filter cpp-export cpp-filter-fine
- CLOSED
- 2
- 1
updated Jun 13, 2018
-z et segment

#3266 · opened Jun 11, 2018 by Mathieu Giraud cpp-options wont-fix
- CLOSED
- 2
updated Jun 11, 2018
Des analyses avec des BAM ne fonctionnent pas

#3263 · opened Jun 07, 2018 by Thonier Florian cpp data repseq-formats
- CLOSED
- 10
updated Jan 22, 2020
Filtrage des germlines : temps total, comparaison avec dev

#3260 · opened Jun 06, 2018 by Mathieu Giraud Algo 2018.08 cpp-filter-fine cpp-speed
- CLOSED
- 26
updated Jul 12, 2018
Se souvenir de la taille des BioReader filtrés et l'afficher tout à la fin en debug / info

#3259 · opened Jun 06, 2018 by Mathieu Giraud Algo 2018.08 bio-control cpp-filter-fine cpp-speed
- CLOSED
- 1
- 37
updated Jul 05, 2018
Aho-Corasick : utiliser un set plutôt qu'une liste pour stocker les informations ?

#3238 · opened May 30, 2018 by Mikaël Salson cpp cpp-aho
- CLOSED
- 1
updated Jun 13, 2018
Évaluer la spécificité du filtrage

#3223 · opened May 17, 2018 by Mikaël Salson Algo 2018.08 cpp cpp-filter-fine
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- 34
updated Jul 09, 2018
Filtrage par automate: prendre les N meilleures séquences

#3217 · opened May 15, 2018 by Mathieu Giraud cpp-filter-fine cpp-speed
- CLOSED
- 23
updated Jun 13, 2018
modifier la méthode insert de automaton pour mettre l'information dans les différentes étapes de l'automate

#3212 · opened Apr 27, 2018 by Cyprien Borée cpp cpp-aho cpp-filter-fine
- CLOSED
- 1
updated May 15, 2018
Créer un test fonctionnel pour le filtrage de BioReader

#3210 · opened Apr 26, 2018 by Cyprien Borée Algo 2018.08 cpp-filter-fine dev-tests-should-get
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- 1
- 3
updated Jul 11, 2018
Créer un cas de test pour getMultiResults où la séquence à tester est plus courte que celles représentées par les K-mers

#3209 · opened Apr 26, 2018 by Cyprien Borée cpp-aho cpp-filter-fine dev-tests
- CLOSED
- 1
updated Jun 12, 2018
Compléter le test sur getMultiResults qui n'avait pas été terminé

#3208 · opened Apr 26, 2018 by Cyprien Borée cpp-filter-fine dev-tests
- CLOSED
- 1
updated Jun 12, 2018
Supprimer un sample set supprime forcément les fichiers de séquence : laisser le choix

#3200 · opened Apr 19, 2018 by Mikaël Salson feature server server-sample-sets
- CLOSED
- 0
updated Jun 24, 2020
should.py et tests avec utilisation conséquente du shell

#3197 · opened Apr 18, 2018 by Mathieu Giraud dev-tests-should-get
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- 1
- 9
updated Apr 20, 2018
Voir où créer l'automate de filtrage et le transmettre dans les germlines

#3191 · opened Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-filter-fine
- CLOSED
- 3
updated Jun 13, 2018
Précéder align_against_collection de la création et du filtrage par automate

#3190 · opened Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-filter-fine
- CLOSED
- 17
updated Jun 13, 2018
Corriger les fuites de mémoire en lien avec le filtrage du BioReader

#3189 · opened Apr 17, 2018 by Mikaël Salson cpp cpp-filter-fine cpp-mem
- CLOSED
- 2
updated Jun 12, 2018
Extraire buildACAutomatonToFilterBioReader et filterBioReaderWithACAutomaton vers un nouveau filter.cpp

#3188 · opened Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-filter-fine dev-refactor
- CLOSED
- 0
updated Jun 12, 2018
Documenter le processus de A à Z pour déployer sur un serveur sous Docker

#3175 · opened Apr 13, 2018 by Mikaël Salson dev-packaging doc server-admin server-docker
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updated Oct 16, 2018
Extraction d'info depuis .vidjil pour contrôleur stats

#3172 · opened Apr 13, 2018 by Mathieu Giraud dev-refactor server-fuse server-qc-stats
- CLOSED
- 2
updated Sep 14, 2018

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