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  • Priority Created date Last updated Milestone due date Due date Popularity Label priority Manual
  • Ne pas relancer filterBioReaderWithACAutomaton() dans vidjil.cpp
    #3271 · opened Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud   merge-filter   cpp-export cpp-filter-fine
    • CLOSED
    • 2
    • 1
    updated Jun 13, 2018
  • -z et segment
    #3266 · opened Jun 11, 2018 by Mathieu Giraud   cpp-options wont-fix
    • CLOSED
    • 2
    updated Jun 11, 2018
  • Des analyses avec des BAM ne fonctionnent pas
    #3263 · opened Jun 07, 2018 by Thonier Florian   cpp data repseq-formats
    • CLOSED
    • 10
    updated Jan 22, 2020
  • Filtrage des germlines : temps total, comparaison avec dev
    #3260 · opened Jun 06, 2018 by Mathieu Giraud   Algo 2018.08   cpp-filter-fine cpp-speed
    • CLOSED
    • 26
    updated Jul 12, 2018
  • Se souvenir de la taille des BioReader filtrés et l'afficher tout à la fin en debug / info
    #3259 · opened Jun 06, 2018 by Mathieu Giraud   Algo 2018.08   bio-control cpp-filter-fine cpp-speed
    • CLOSED
    • 1
    • 37
    updated Jul 05, 2018
  • Aho-Corasick : utiliser un set plutôt qu'une liste pour stocker les informations ?
    #3238 · opened May 30, 2018 by Mikaël Salson   cpp cpp-aho
    • CLOSED
    • 1
    updated Jun 13, 2018
  • Évaluer la spécificité du filtrage
    #3223 · opened May 17, 2018 by Mikaël Salson   Algo 2018.08   cpp cpp-filter-fine
    • CLOSED
    • 34
    updated Jul 09, 2018
  • Filtrage par automate: prendre les N meilleures séquences
    #3217 · opened May 15, 2018 by Mathieu Giraud   cpp-filter-fine cpp-speed
    • CLOSED
    • 23
    updated Jun 13, 2018
  • modifier la méthode insert de automaton pour mettre l'information dans les différentes étapes de l'automate
    #3212 · opened Apr 27, 2018 by Cyprien Borée   cpp cpp-aho cpp-filter-fine
    • CLOSED
    • 1
    updated May 15, 2018
  • Créer un test fonctionnel pour le filtrage de BioReader
    #3210 · opened Apr 26, 2018 by Cyprien Borée   Algo 2018.08   cpp-filter-fine dev-tests-should-get
    • CLOSED
    • 1
    • 3
    updated Jul 11, 2018
  • Créer un cas de test pour getMultiResults où la séquence à tester est plus courte que celles représentées par les K-mers
    #3209 · opened Apr 26, 2018 by Cyprien Borée   cpp-aho cpp-filter-fine dev-tests
    • CLOSED
    • 1
    updated Jun 12, 2018
  • Compléter le test sur getMultiResults qui n'avait pas été terminé
    #3208 · opened Apr 26, 2018 by Cyprien Borée   cpp-filter-fine dev-tests
    • CLOSED
    • 1
    updated Jun 12, 2018
  • Supprimer un sample set supprime forcément les fichiers de séquence : laisser le choix
    #3200 · opened Apr 19, 2018 by Mikaël Salson   feature server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 0
    updated Jun 24, 2020
  • should.py et tests avec utilisation conséquente du shell
    #3197 · opened Apr 18, 2018 by Mathieu Giraud   dev-tests-should-get
    • CLOSED
    • 1
    • 9
    updated Apr 20, 2018
  • Voir où créer l'automate de filtrage et le transmettre dans les germlines
    #3191 · opened Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud   cpp cpp-filter-fine
    • CLOSED
    • 3
    updated Jun 13, 2018
  • Précéder align_against_collection de la création et du filtrage par automate
    #3190 · opened Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud   cpp cpp-filter-fine
    • CLOSED
    • 17
    updated Jun 13, 2018
  • Corriger les fuites de mémoire en lien avec le filtrage du BioReader
    #3189 · opened Apr 17, 2018 by Mikaël Salson   cpp cpp-filter-fine cpp-mem
    • CLOSED
    • 2
    updated Jun 12, 2018
  • Extraire buildACAutomatonToFilterBioReader et filterBioReaderWithACAutomaton vers un nouveau filter.cpp
    #3188 · opened Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud   cpp cpp-filter-fine dev-refactor
    • CLOSED
    • 0
    updated Jun 12, 2018
  • Documenter le processus de A à Z pour déployer sur un serveur sous Docker
    #3175 · opened Apr 13, 2018 by Mikaël Salson   dev-packaging doc server-admin server-docker
    • CLOSED
    • 5
    updated Oct 16, 2018
  • Extraction d'info depuis .vidjil pour contrôleur stats
    #3172 · opened Apr 13, 2018 by Mathieu Giraud   dev-refactor server-fuse server-qc-stats
    • CLOSED
    • 2
    updated Sep 14, 2018
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