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Manual
Ne pas relancer filterBioReaderWithACAutomaton() dans vidjil.cpp
#3271
· opened
Jun 12, 2018
by
Mathieu Giraud
merge-filter
cpp-export
cpp-filter-fine
CLOSED
2
1
updated
Jun 13, 2018
-z et segment
#3266
· opened
Jun 11, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp-options
wont-fix
CLOSED
2
updated
Jun 11, 2018
Des analyses avec des BAM ne fonctionnent pas
#3263
· opened
Jun 07, 2018
by
Thonier Florian
cpp
data
repseq-formats
CLOSED
10
updated
Jan 22, 2020
Filtrage des germlines : temps total, comparaison avec dev
#3260
· opened
Jun 06, 2018
by
Mathieu Giraud
Algo 2018.08
cpp-filter-fine
cpp-speed
CLOSED
26
updated
Jul 12, 2018
Se souvenir de la taille des BioReader filtrés et l'afficher tout à la fin en debug / info
#3259
· opened
Jun 06, 2018
by
Mathieu Giraud
Algo 2018.08
bio-control
cpp-filter-fine
cpp-speed
CLOSED
1
37
updated
Jul 05, 2018
Aho-Corasick : utiliser un set plutôt qu'une liste pour stocker les informations ?
#3238
· opened
May 30, 2018
by
Mikaël Salson
cpp
cpp-aho
CLOSED
1
updated
Jun 13, 2018
Évaluer la spécificité du filtrage
#3223
· opened
May 17, 2018
by
Mikaël Salson
Algo 2018.08
cpp
cpp-filter-fine
CLOSED
34
updated
Jul 09, 2018
Filtrage par automate: prendre les N meilleures séquences
#3217
· opened
May 15, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp-filter-fine
cpp-speed
CLOSED
23
updated
Jun 13, 2018
modifier la méthode insert de automaton pour mettre l'information dans les différentes étapes de l'automate
#3212
· opened
Apr 27, 2018
by
Cyprien Borée
cpp
cpp-aho
cpp-filter-fine
CLOSED
1
updated
May 15, 2018
Créer un test fonctionnel pour le filtrage de BioReader
#3210
· opened
Apr 26, 2018
by
Cyprien Borée
Algo 2018.08
cpp-filter-fine
dev-tests-should-get
CLOSED
1
3
updated
Jul 11, 2018
Créer un cas de test pour getMultiResults où la séquence à tester est plus courte que celles représentées par les K-mers
#3209
· opened
Apr 26, 2018
by
Cyprien Borée
cpp-aho
cpp-filter-fine
dev-tests
CLOSED
1
updated
Jun 12, 2018
Compléter le test sur getMultiResults qui n'avait pas été terminé
#3208
· opened
Apr 26, 2018
by
Cyprien Borée
cpp-filter-fine
dev-tests
CLOSED
1
updated
Jun 12, 2018
Supprimer un sample set supprime forcément les fichiers de séquence : laisser le choix
#3200
· opened
Apr 19, 2018
by
Mikaël Salson
feature
server
server-sample-sets
CLOSED
0
updated
Jun 24, 2020
should.py et tests avec utilisation conséquente du shell
#3197
· opened
Apr 18, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-tests-should-get
CLOSED
1
9
updated
Apr 20, 2018
Voir où créer l'automate de filtrage et le transmettre dans les germlines
#3191
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-filter-fine
CLOSED
3
updated
Jun 13, 2018
Précéder align_against_collection de la création et du filtrage par automate
#3190
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-filter-fine
CLOSED
17
updated
Jun 13, 2018
Corriger les fuites de mémoire en lien avec le filtrage du BioReader
#3189
· opened
Apr 17, 2018
by
Mikaël Salson
cpp
cpp-filter-fine
cpp-mem
CLOSED
2
updated
Jun 12, 2018
Extraire buildACAutomatonToFilterBioReader et filterBioReaderWithACAutomaton vers un nouveau filter.cpp
#3188
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-filter-fine
dev-refactor
CLOSED
0
updated
Jun 12, 2018
Documenter le processus de A à Z pour déployer sur un serveur sous Docker
#3175
· opened
Apr 13, 2018
by
Mikaël Salson
dev-packaging
doc
server-admin
server-docker
CLOSED
5
updated
Oct 16, 2018
Extraction d'info depuis .vidjil pour contrôleur stats
#3172
· opened
Apr 13, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-refactor
server-fuse
server-qc-stats
CLOSED
2
updated
Sep 14, 2018
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