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No
Yes
No
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Manual
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Created date
Last updated
Milestone due date
Due date
Popularity
Label priority
Manual
Vérifications sur des choses faites sans Ryan
#3122
· opened
Apr 04, 2018
by
Mathieu Giraud
5
updated
Apr 19, 2018
Création d'utilisateurs avec unicode impossible
#3123
· opened
Apr 04, 2018
by
Mathieu Giraud
client-i18n
server-auth
0
updated
Apr 04, 2018
La touche TAB valide l'autocomplétion du set
#3124
· opened
Apr 04, 2018
by
Mikaël Salson
client-autocomplete
client-keyboard
server-ergonomy
server-sample-sets
1
updated
Feb 28, 2019
Rapport : date de naissance + autres infos du patient (run/set) ?
#3126
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
Lille-LAL-next
!-easy
*-go
LIL-Lille
client-rapport
user-request
6
updated
Jan 26, 2021
Différents levels sur les warnings
#3127
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
*-go
bio-control
client-warning
user-request
CLOSED
9
updated
Feb 13, 2019
Point caché (dans l'épingle) qui apparaît malgré tout dans le graphique
#3128
· opened
Apr 05, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
LIL-Lille
client-ergonomy
client-graph
user-request
0
updated
Apr 05, 2018
Informations pour la LLC dans le rapport
#3130
· opened
Apr 05, 2018
by
Mikaël Salson
!-reflexion
client-export
client-rapport
patho-LLC
user-request
2
updated
Aug 05, 2020
Similarité Vh en natif
#3131
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-dynprog
cpp-finesegmenter
feature
repseq-IMGT
0
updated
Apr 05, 2018
Renommer des infos / tags et/ou opérations de maintenance
#3132
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
support-policy
user-request
0
updated
Apr 05, 2018
LENGTH_DOWNSTREAM: 40, autre chose ?
#3133
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
BRI-Bristol
bio-germlines-pseudo
CLOSED
2
8
updated
Jan 20, 2021
Faire utiliser à Clonedb les warnings
#3135
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
app-clonedb
client-warning
4
updated
Dec 03, 2019
Générer les warning levels depuis vidjil-algo
#3136
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
Algo 2018.04
+-working
client-warning
cpp
cpp-export
CLOSED
1
0
updated
Apr 17, 2018
vidjil-algo: warning level de W53, similar clone
#3137
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
Algo 2018.04
client-warning
cpp
cpp-export
CLOSED
1
0
updated
Jun 12, 2018
Les utilisateurs ne peuvent pas supprimer ou éditer les nouveaux sample sets créés
#3138
· opened
Apr 05, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
!-important
server
server-sample-sets
CLOSED
4
updated
Apr 05, 2018
Interdire la création en doublon de nouveaux sample sets
#3139
· opened
Apr 05, 2018
by
Mikaël Salson
client-ergonomy
server-speed
CLOSED
1
6
updated
Apr 16, 2018
Les flèches < > sur un sample set amènent à un autre sample set complètement random
#3140
· opened
Apr 05, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
server-sample-sets
CLOSED
1
updated
Apr 06, 2018
Erreurs serveur sur sample_set/delete
#3141
· opened
Apr 05, 2018
by
Mathieu Giraud
CLOSED
1
3
updated
Apr 16, 2018
On ne voit plus l'information personnal group dans la liste
#3142
· opened
Apr 06, 2018
by
Thonier Florian
client
0
updated
Apr 06, 2018
timeout sur TestExternalSegmenterPage#test_05_imgt_post
#3143
· opened
Apr 06, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-tests
dev-tests-watir
repseq-IMGT
CLOSED
3
updated
May 27, 2020
Bloquer la tabulation sur le specific set des add sample
#3144
· opened
Apr 06, 2018
by
Thonier Florian
client
client-autocomplete
CLOSED
1
updated
Apr 06, 2018
Une séquence J-D-J en TRB+ ?
#3145
· opened
Apr 06, 2018
by
Mathieu Giraud
1
updated
Jan 10, 2019
UNSEG only J curieux sur une affectation particulière
#3146
· opened
Apr 06, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-heuristic
1
updated
Jul 12, 2018
vidjil-algo: Avec des germlines up/down, calculer les positions de début/fin du gène normal
#3147
· opened
Apr 06, 2018
by
Mathieu Giraud
!-hard
bio-control
client
cpp-dynprog
feature
4
updated
May 28, 2020
split-from-imgt.py: garder le tri d'origine pour les germlines up/down
#3148
· opened
Apr 06, 2018
by
Mikaël Salson
Algo 2018.08
*-go
bio-germlines
CLOSED
2
7
updated
Jul 12, 2018
should_results_from_vidjil_output() ne renvoie pas le bon couple (should, result) lorsqu'une séquence n'est pas segmentée
#3149
· opened
Apr 06, 2018
by
Mathieu Giraud
+-working
dev-tests
dev-tests-curated-vdj
1
2
updated
Mar 13, 2019
Récupérer les patients à partir d'un run ou d'un set
#3150
· opened
Apr 09, 2018
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
server
server-sample-sets
user-request
CLOSED
2
updated
Mar 25, 2019
Afficher les warning dans le rapport
#3151
· opened
Apr 09, 2018
by
Mikaël Salson
bio-control
client-rapport
0
updated
Apr 09, 2018
Indiquer clairement que des messages se cachent derrière les notifications serveurs
#3153
· opened
Apr 09, 2018
by
Mikaël Salson
client-ergonomy
client-notifications
server
0
updated
Apr 09, 2018
Récupérer des infos des pré-process : mécanisme
#3154
· opened
Apr 09, 2018
by
Mathieu Giraud
!-hard
#-quality
bio-control
repseq-formats
server-database
server-fuse
server-pre-process
server-task.py
15
updated
Jan 22, 2021
Plot submenu: une icône .svg disparaît après utilisation
#3156
· opened
Apr 09, 2018
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
client-ugly
user-request
2
updated
Aug 09, 2018
Plusieurs configs ne sont plus visibles
#3157
· opened
Apr 10, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
!-important
server
server-admin
server-config
CLOSED
9
updated
May 28, 2020
Pouvoir afficher tsne sur une distance arbitraire venant du json ou d'ailleurs
#3158
· opened
Apr 10, 2018
by
Mathieu Giraud
client
client-grid
feature
0
updated
Apr 10, 2018
json: simple ou double quotes ?
#3159
· opened
Apr 10, 2018
by
Mathieu Giraud
bikeshedding
dev-policy
repseq-formats
0
updated
Apr 10, 2018
fuse.py: codec can't encode character
#3160
· opened
Apr 10, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
client-i18n
server-fuse
0
updated
Apr 10, 2018
Vérifier le format d'IMGT
#3161
· opened
Apr 10, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-tests
dev-tests-should-get
repseq-IMGT
repseq-formats
3
updated
Apr 10, 2018
should: stdout/stderr
#3162
· opened
Apr 10, 2018
by
Mathieu Giraud
bikeshedding
dev-tests-should-get
CLOSED
1
updated
Apr 18, 2018
Suite à un changement de format d'IMGT V-QUEST : il manque les % d'identité
#3163
· opened
Apr 10, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
!!-crisis
+-working
bio-CLL
repseq-IMGT
CLOSED
1
2
updated
Apr 17, 2018
N'afficher que les nucléotides qui diffèrent quand on aligne les séquences
#3164
· opened
Apr 11, 2018
by
Mikaël Salson
Paris-Pitié
client-aligner
client-ergonomy
server-cgi
user-request
0
updated
Oct 14, 2020
Ikaros : les séquences communiquées sont trop longues, voir ce qu'il faut garder
#3165
· opened
Apr 11, 2018
by
Mikaël Salson
Algo -- Important
PAR-Debré
bio-analyze-more
bio-germlines-pseudo
12
updated
May 20, 2020
should: erreur Unicode : mettre les slaves en UTF-8
#3166
· opened
Apr 12, 2018
by
Mathieu Giraud
1
updated
Apr 12, 2018
Inclusion de should.py
#3167
· opened
Apr 12, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-build
dev-tests-should-get
CLOSED
1
0
updated
Apr 20, 2018
Warnings / qualité par type de manipulation ou même par utilisateur
#3168
· opened
Apr 13, 2018
by
Mathieu Giraud
!-hard
bio-control
server-qc-stats
1
updated
Sep 14, 2018
La liste patients met beaucoup trop de temps à se charger
#3169
· opened
Apr 13, 2018
by
Mikaël Salson
!-important
server
server-database
server-speed
CLOSED
3
33
updated
Feb 11, 2021
Pre-process: stocker le log en fichier et non pas en texte brut
#3170
· opened
Apr 13, 2018
by
Mathieu Giraud
server
server-pre-process
1
updated
Apr 13, 2018
Statistiques multi-samples et contrôle de qualité run/sample, plan de bataille
#3171
· opened
Apr 13, 2018
by
Mathieu Giraud
!-important
bio-control
ec-ngs
server-qc-stats
5
updated
Nov 27, 2019
Extraction d'info depuis .vidjil pour contrôleur stats
#3172
· opened
Apr 13, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-refactor
server-fuse
server-qc-stats
CLOSED
2
updated
Sep 14, 2018
Pagination par défaut de la reqûete patients
#3173
· opened
Apr 13, 2018
by
Mathieu Giraud
server-speed
2
updated
Jun 18, 2020
La colonne groups n'affiche plus rien
#3174
· opened
Apr 13, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
server
server-groups
4
updated
Jul 01, 2020
Documenter le processus de A à Z pour déployer sur un serveur sous Docker
#3175
· opened
Apr 13, 2018
by
Mikaël Salson
dev-packaging
doc
server-admin
server-docker
CLOSED
5
updated
Oct 16, 2018
Le changement de patients via le menu patients, après demande de confirmation, est non fonctionnel
#3176
· opened
Apr 16, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
*-go
client
client-database
client-ergonomy
0
updated
Apr 16, 2018
Export graph : ne pas le proposer si le graph n'est pas affiché
#3177
· opened
Apr 16, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
*-go
client-export
client-graph
client-grid
1
updated
Sep 26, 2018
Ajout de samples : « specific set » est peu clair
#3178
· opened
Apr 16, 2018
by
Mikaël Salson
!-reflexion
bikeshedding
client-ergonomy
server
CLOSED
1
updated
Apr 17, 2018
incohérence du champ "sets" en mode modification d'échantillon
#3179
· opened
Apr 17, 2018
by
Thonier Florian
*-go
client
client-accessibility
client-ergonomy
client-info
server-sample-sets
1
updated
Jun 13, 2018
Documenter le multi-upload
#3180
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
*-go
doc
doc-tutorial
server-upload
CLOSED
4
updated
Sep 27, 2020
Lancer CloneDB depuis fuse.py ou en offline
#3181
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
!-reflexion
app-clonedb
client-speed
server-fuse
server-speed
0
updated
Feb 14, 2019
Aligner "Common sets" sur "Other sets"
#3182
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
*-go
bikeshedding
client-design
client-less-css
0
updated
Apr 17, 2018
Un sample devrait appartenir à au plus un patient et au plus un run
#3183
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
bio-control
client
server-sample-sets
1
updated
Jun 18, 2018
Factoriser js/form_builder.js et views/partial/file/form.html
#3184
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
!-hard
client
dev-refactor
2
updated
Apr 17, 2018
Requêtes SQL imbriquées
#3185
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
server-database
server-speed
0
updated
Apr 17, 2018
Filtrage du BioReader pour align_against_collection : gérer le cas s'il y a peu de résultats à getMultiResults()
#3187
· opened
Apr 17, 2018
by
Mikaël Salson
!-hard
!-reflexion
bio-e-value
cpp
cpp-filter-fine
18
updated
Jul 12, 2018
Extraire buildACAutomatonToFilterBioReader et filterBioReaderWithACAutomaton vers un nouveau filter.cpp
#3188
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-filter-fine
dev-refactor
CLOSED
0
updated
Jun 12, 2018
Corriger les fuites de mémoire en lien avec le filtrage du BioReader
#3189
· opened
Apr 17, 2018
by
Mikaël Salson
cpp
cpp-filter-fine
cpp-mem
CLOSED
2
updated
Jun 12, 2018
Précéder align_against_collection de la création et du filtrage par automate
#3190
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-filter-fine
CLOSED
17
updated
Jun 13, 2018
Voir où créer l'automate de filtrage et le transmettre dans les germlines
#3191
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp
cpp-filter-fine
CLOSED
3
updated
Jun 13, 2018
Avoir un axe "germlines dans l'ordre du locus"
#3192
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
*-go
bio-control
bio-germlines
client
client-axis
3
updated
Jan 20, 2021
Color by length
#3193
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
client
client-axis
0
updated
Jan 15, 2019
Pouvoir visualiser, sans télécharger, un fichier (texte) faisant partie de la sortie d'un répertoire tmp/ d'analyse
#3194
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
server
6
updated
Apr 18, 2018
Visualisation des fichiers de résultats : le permettre aussi dans les sous-répertoires
#3195
· opened
Apr 17, 2018
by
Mikaël Salson
*-go
feature
server
server-task.py
1
updated
Apr 18, 2018
.vidjil: better document `top` and/or make it optionnal
#3196
· opened
Apr 17, 2018
by
Mathieu Giraud
doc
repseq-formats
server-fuse
8
updated
Jul 23, 2019
Afficher le SHA1 du git browser et server quelque part depuis le web
#1847
· opened
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
+-working-dead
client
dev-build
dev-ci
priority-3-month
CLOSED
1
7
updated
Nov 22, 2019
should.py et tests avec utilisation conséquente du shell
#3197
· opened
Apr 18, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-tests-should-get
CLOSED
1
9
updated
Apr 20, 2018
Timeout de certains jobs should-get-tests en raison d'une grosse stdout
#3198
· opened
Apr 18, 2018
by
Mathieu Giraud
13
updated
Apr 20, 2018
Bug lors de l'ajout de samples à plusieurs patients
#3199
· opened
Apr 19, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
!!-crisis
!-important
*-go
LIL-Lille
server
server-sample-sets
CLOSED
1
2
updated
Jun 13, 2018
Supprimer un sample set supprime forcément les fichiers de séquence : laisser le choix
#3200
· opened
Apr 19, 2018
by
Mikaël Salson
feature
server
server-sample-sets
CLOSED
0
updated
Jun 24, 2020
Tests unitaires serveur sur le multi-upload
#3201
· opened
Apr 19, 2018
by
Mikaël Salson
#-quality
*-go
dev-tests
server
server-sample-sets
0
updated
May 24, 2018
Plus d'enregistrement du first login/last login
#3202
· opened
Apr 20, 2018
by
Thonier Florian
!!-bug
client
client-database
server
server-admin
CLOSED
1
3
updated
Oct 02, 2018
Fail de should ?
#3205
· opened
Apr 20, 2018
by
Mathieu Giraud
+-working
2
updated
Apr 20, 2018
Repasser sur les tests .should en bénéficiant des nouvelles syntaxes
#3206
· opened
Apr 20, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-refactor
dev-tests-should-get
8
updated
Aug 21, 2020
Compléter le test sur getMultiResults qui n'avait pas été terminé
#3208
· opened
Apr 26, 2018
by
Cyprien Borée
cpp-filter-fine
dev-tests
CLOSED
1
updated
Jun 12, 2018
Créer un cas de test pour getMultiResults où la séquence à tester est plus courte que celles représentées par les K-mers
#3209
· opened
Apr 26, 2018
by
Cyprien Borée
cpp-aho
cpp-filter-fine
dev-tests
CLOSED
1
updated
Jun 12, 2018
Créer un test fonctionnel pour le filtrage de BioReader
#3210
· opened
Apr 26, 2018
by
Cyprien Borée
Algo 2018.08
cpp-filter-fine
dev-tests-should-get
CLOSED
1
3
updated
Jul 11, 2018
Cas d'usages et tests avant nouvelle feautre
#3211
· opened
Apr 27, 2018
by
Mathieu Giraud
#-crisis-prevention
dev-policy
0
updated
Apr 27, 2018
modifier la méthode insert de automaton pour mettre l'information dans les différentes étapes de l'automate
#3212
· opened
Apr 27, 2018
by
Cyprien Borée
cpp
cpp-aho
cpp-filter-fine
CLOSED
1
updated
May 15, 2018
Éditer un sample qui possède un pre-process empêche de relancer une analyse dessus
#3213
· opened
May 03, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
server
server-pre-process
server-task.py
CLOSED
1
1
updated
Sep 24, 2019
La recherche de recombinaisons inattendues n'utilise pas les version +up et +down des germlines
#3214
· opened
May 03, 2018
by
Mikaël Salson
Algo -- Important
LIL-Lille
bio-analyze-more
bio-germlines-pseudo
cpp
1
2
updated
May 20, 2020
Controleur qui renvoie ou met à disposition un .zip de tous les fastq + métadonnées
#3215
· opened
May 11, 2018
by
Mathieu Giraud
bio-control
feature
server
0
updated
May 11, 2018
Utilisation des séquences "cibles"
#3216
· opened
May 11, 2018
by
Thonier Florian
!-reflexion
PAN-Necker
app-clonedb
client
cpp
data
feature
user-request
1
updated
May 11, 2018
Filtrage par automate: prendre les N meilleures séquences
#3217
· opened
May 15, 2018
by
Mathieu Giraud
cpp-filter-fine
cpp-speed
CLOSED
23
updated
Jun 13, 2018
Supprimer les k-mers non significatifs ?
#3218
· opened
May 15, 2018
by
Mathieu Giraud
!-reflexion
cpp-filter-fine
0
updated
Feb 21, 2020
Fusion de reads : essayer Flash (et BBMerge ?)
#3219
· opened
May 15, 2018
by
Mikaël Salson
!-reflexion
#-legal
server-pre-process
CLOSED
28
updated
Mar 20, 2020
tous les sample sont affichés en deleted lors d'une analyse clntab/vidjil
#3220
· opened
May 16, 2018
by
Thonier Florian
!!-bug
client
server
server-config
server-database
3
updated
May 16, 2018
Valeurs triées en deux parties avec des histogrammes mélangeant entiers et flottants
#3221
· opened
May 16, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
!-important
client
client-axis
client-bar
repseq-igrec
CLOSED
4
updated
Aug 14, 2018
vue commune pour les preprocess de merge
#3222
· opened
May 17, 2018
by
Thonier Florian
!-reflexion
client
server
server-pre-process
0
updated
May 17, 2018
Évaluer la spécificité du filtrage
#3223
· opened
May 17, 2018
by
Mikaël Salson
Algo 2018.08
cpp
cpp-filter-fine
CLOSED
34
updated
Jul 09, 2018
Lors du filtrage : décaler les valeurs des KmerAffect supérieures à AMBIGUOUS ou UNKNOWN
#3224
· opened
May 22, 2018
by
Mikaël Salson
!!-bug
cpp
cpp-filter-fine
CLOSED
4
updated
Jun 12, 2018
Filtrage par automate : prendre les N meilleures séquences et leurs « voisines »
#3225
· opened
May 22, 2018
by
Mikaël Salson
Algo 2018.09
!-reflexion
cpp
cpp-filter-fine
math-stats
CLOSED
1
6
updated
Oct 10, 2018
Ne plus générer de paquets Debian
#3226
· opened
May 23, 2018
by
Mathieu Giraud
dev-build
dev-packaging
0
updated
May 23, 2018
Filtrage des germlines : évaluer le temps pris par l'alignement
#3227
· opened
May 24, 2018
by
Mikaël Salson
cpp
cpp-filter-fine
cpp-speed
3
updated
Jun 06, 2018
Nomenclature ERG
#3229
· opened
May 25, 2018
by
Mathieu Giraud
Algo -- Important
bikeshedding
bio-germlines
8
updated
May 20, 2020
Vérification de l'intégrité des données
#3230
· opened
May 25, 2018
by
Mathieu Giraud
!-security
server
server-upload
1
updated
Jul 30, 2020
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