Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Classes pour les méthodes de segmentation

#2968 · opened Dec 22, 2017 by Mathieu Giraud Algo -- Important !-hard *-go cpp cpp-heuristic dev-refactor
- 4
updated Feb 10, 2021
SEG_METHOD_ONE : séquences non recombinées, usages

#1724 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team Algo -- Important !-reflexion bio-analyze-more cpp cpp-dynprog cpp-finesegmenter cpp-heuristic dev-policy priority-2 user-request
- 5
updated Feb 10, 2021
Prise en compte de la central région pour la p-valeur : mauvaise idée pour choix du meilleur locus

#1878 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team Algo -- Important !!-bug bio-analyze-more bio-e-value bio-germlines cpp-heuristic
- 3
updated Dec 04, 2020
Seuil pour les D, e-valeur

#1879 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team Algo -- Important bio-e-value cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D doc priority-3-month
- 23
updated Oct 14, 2020
top par système dans vidjil-algo

#3381 · opened Jul 13, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important *-go cpp cpp-export dev-refactor
- 0
updated Jun 25, 2020
similarity.cgi n'est pas testé

#3019 · opened Jan 31, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important dev-tests server-cgi
- 0
updated May 26, 2020
should-vdj-to-tap ne vérifie pas correctement le locus

#3365 · opened Jul 12, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important !!-bug *-go dev-tests-curated-vdj
- 1
updated May 20, 2020
Nomenclature ERG

#3229 · opened May 25, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important bikeshedding bio-germlines
- 8
updated May 20, 2020
Ikaros : les séquences communiquées sont trop longues, voir ce qu'il faut garder

#3165 · opened Apr 11, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important PAR-Debré bio-analyze-more bio-germlines-pseudo
- 12
updated May 20, 2020
La recherche de recombinaisons inattendues n'utilise pas les version +up et +down des germlines

#3214 · opened May 03, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important LIL-Lille bio-analyze-more bio-germlines-pseudo cpp
- 1
- 2
updated May 20, 2020
La quatorzième séquence de X5 est en BUG, court DD2 non trouvé

#3028 · opened Jan 31, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important com-first-time-user dev-tests-curated-vdj
- 1
updated May 20, 2020
Agrandir la taille des graines pour limiter les faux positifs

#3388 · opened Jul 16, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important *-go cpp cpp-heuristic
- 1
updated Nov 23, 2019
Le résultat de la segmentation change selon le contexte

#2003 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team Algo -- Important +-working-dead cpp cpp-dynprog cpp-finesegmenter-D cpp-representative
- 10
updated Nov 23, 2019
Central region : couper en deux pour ne pas pénaliser deux fois

#2656 · opened Sep 20, 2017 by Mathieu Giraud Algo -- Important bio-e-value cpp cpp-heuristic
- 1
updated Mar 14, 2019
Mettre à jour Demo-X5

#3022 · opened Jan 31, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important bio-germlines com-first-time-user doc
- 1
updated Mar 06, 2019
SEG_METHOD_543C : ne pas prendre en compte C dans la p-valeur du J

#2993 · opened Jan 18, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important *-go cpp-heuristic
- 0
updated Jul 16, 2018
Blinder les tests sur les options

#2750 · opened Oct 23, 2017 by Mathieu Giraud Algo -- Important cpp cpp-options dev-tests-should-get
- 1
updated Jun 27, 2018
Vh pas trouvé, uniquement Dh-Jh

#2508 · opened Jun 01, 2017 by Mathieu Giraud Algo -- Important !!-bug LIL-Lille bio-e-value cpp cpp-heuristic user-request
- 3
updated Jun 27, 2018
Shorter / shifted w : autoriser de plus grands shifts, mais jusqu'à où ?

#2987 · opened Jan 17, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important !-reflexion cpp-heuristic
- 1
updated Jun 27, 2018
Coût du FineSegmenter : est-on trop généreux avec les mismatches ?

#2825 · opened Nov 21, 2017 by Mikaël Salson Algo -- Important !!-bug !-important BRU-Bruxelles PAR-Debré cpp-costs cpp-finesegmenter dev-tests-should-get
- 3
updated Jun 26, 2018