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New issue
  • Priority Created date Last updated Milestone due date Due date Popularity Label priority Manual
  • Les utilisateurs ne peuvent pas supprimer un set
    #4305 · opened May 26, 2020 by Thonier Florian   Web 2021.05   !!-annoying !!-bug LIL-Lille client priority-3-month server server-sample-sets user-request
    • 13
    updated Feb 19, 2021
  • sample_set.delete() ne devrait généralement pas supprimer les samples et les résultats
    #2591 · opened Aug 25, 2017 by Mathieu Giraud   !-important !-security *-go server
    • 1
    • 6
    updated Feb 19, 2021
  • Réduire le nombre de requêtes pour la requête Sample_Set
    #2475 · opened May 19, 2017 by Ryan Herbert   !-important !-reflexion +-working-dead server server-database server-speed
    • 1
    • 3
    updated Dec 17, 2019
  • La liste des fichiers pour un compare patients/sets met trop de temps à s'afficher.
    #2494 · opened May 23, 2017 by Ryan Herbert   !-important +-merge server server-speed
    • 9
    updated Apr 13, 2018
  • Supprimer les fichiers fused si aucun résultat n'existe plus avec cette config
    #2486 · opened May 23, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server server-fuse
    • 0
    updated Jul 12, 2018
  • Killer les processus en timeout
    #2213 · opened Mar 02, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server server-task.py
    • 5
    updated May 12, 2020
  • Notifications zombies
    #1791 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !!-bug *-go client-notifications priority-3-month server
    • 2
    updated Nov 09, 2017
  • La recherche de patients prend trop de temps
    #2295 · opened Mar 30, 2017 by Mikaël Salson   !-hard !-important *-go server server-speed
    • 10
    updated Dec 17, 2019
  • Compare patients : checkbox pour n'afficher que les analyses les plus récentes par config
    #2268 · opened Mar 20, 2017 by Thonier Florian   *-go LIL-Lille client-database doc server server-ergonomy
    • 12
    updated Feb 28, 2019
  • Filtrer la liste des sample_sets par groupe
    #2146 · opened Jan 31, 2017 by Mikaël Salson   *-go BRU-Bruxelles server server-ergonomy server-groups server-sample-sets
    • 0
    updated Feb 28, 2019
  • Nom du serveur dans modules/defs.py
    #2046 · opened Dec 07, 2016 by Mathieu Giraud   *-go server server-hosting
    • 3
    updated Sep 22, 2017
  • Clarifier ce que fait chaque config, éventuellement les renommer
    #1944 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Déploiement 2020.06   *-go beware-migration bikeshedding com com-first-time-user doc priority-2 server server-config support-policy
    • 31
    updated Jun 10, 2020
  • Mettre un verrou tant que des fichiers sont en cours de run/upload pour ne pas lancer fuse ?
    #2479 · opened May 22, 2017 by Mikaël Salson   !-hard !-reflexion server server-fuse server-speed
    • 3
    updated Aug 22, 2017
  • Le lien logout ne redirige pas correctement
    #2477 · opened May 22, 2017 by Mikaël Salson   Web 2018.01   !!-bug +-merge dev-dead-code server
    • 1
    • 23
    updated Jan 13, 2021
  • Surveiller périodiquement les erreurs / tickets sur le serveur + nettoyer
    #1647 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Dec 13, 2016   !!-bug priority-3-month server server-hosting ⟳-recurring-issue
    • 2
    updated Jul 05, 2017
  • Donner accès aux fichiers produits par les pre-process
    #2143 · opened Jan 30, 2017 by Mathieu Giraud   client-export feature server server-pre-process
    • 1
    updated Jan 08, 2019
  • Doc pour Ngnix
    #2083 · opened Dec 27, 2016 by Mathieu Giraud   doc server server-hosting
    • 1
    updated Jul 05, 2017
  • Permettre des OR dans les requêtes de recherche de sample sets ou samples
    #2171 · opened Feb 08, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion REN-Rennes bio-metadata server server-sample-sets
    • 0
    updated Jul 10, 2017
  • Pouvoir chercher dans la liste des utilisateurs
    #1780 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   *-go client-autocomplete priority-2 server server-admin server-ergonomy
    • 1
    • 3
    updated Feb 09, 2021
  • Doit on ajouter le créateur du groupe au groupe en question ?
    #2575 · opened Aug 23, 2017 by Ryan Herbert   !-reflexion server server-auth server-groups
    • 0
    updated Dec 19, 2017
  • La vue user/info n'a pas de liens fonctionnels
    #2576 · opened Aug 23, 2017 by Ryan Herbert   server server-admin server-ergonomy server-groups
    • 0
    updated Feb 28, 2019
  • Une erreur serveur se produit lorsqu'on essaye d'ajouter un dossier depuis le network
    #2577 · opened Aug 23, 2017 by Ryan Herbert   !!-bug *-go server
    • 0
    updated Aug 23, 2017
  • Supprimer un fichier sans results ne doit pas proposer de conserver les résults
    #2578 · opened Aug 23, 2017 by Ryan Herbert   !!-bug *-go server
    • 0
    updated Jan 10, 2019
  • Supprimer un process ne supprime pas le scheduler_task associé
    #2579 · opened Aug 23, 2017 by Ryan Herbert   !!-bug !-reflexion server server-task.py
    • 0
    updated Aug 07, 2020
  • delete() dans patient.py et run.py
    #2592 · opened Aug 25, 2017 by Mathieu Giraud   dev-refactor server
    • 0
    updated Aug 25, 2017
  • ajouter information sur les patients ouvert par un utilisateur dans la database
    #2609 · opened Sep 01, 2017 by Thonier Florian   !-reflexion feature server server-database server-task.py
    • 0
    updated Sep 01, 2017
  • .vidjil file list provoque une erreur serveur
    #2617 · opened Sep 08, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server
    • 1
    updated Sep 08, 2017
  • Choses à vérifier lors d'une mise à jour serveur
    #2691 · opened Oct 06, 2017 by Mathieu Giraud   #-crisis-prevention server
    • 1
    updated Oct 06, 2017
  • Avoir des tests sur user_group.py
    #2711 · opened Oct 11, 2017 by Mikaël Salson   Web 2018.01   !-important *-go dev-tests server
    • 1
    updated Nov 16, 2017
  • Supprimer l'association d'un sample à un patient fait une server error
    #2719 · opened Oct 12, 2017 by Mathieu Giraud   !!-bug server
    • 4
    updated Oct 16, 2017
  • fuse avec un fichier inexistant (deleted)
    #2736 · opened Oct 19, 2017 by Thonier Florian   !!-bug server server-database server-fuse server-sample-sets
    • 2
    updated Nov 16, 2017
  • Login ne met pas d'erreur si mauvais login/mot de passe
    #1113 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   *-go client-database com-first-time-user priority-2 server server-auth
    • 4
    updated Sep 24, 2020
  • Organiser les sample_sets par projet pour accélérer les requêtes
    #2747 · opened Oct 23, 2017 by Ryan Herbert   !-hard !-reflexion dev-refactor server server-auth server-database server-speed
    • 4
    updated Sep 23, 2020
  • Message d'alerte non diffusé vers https
    #2752 · opened Oct 24, 2017 by Thonier Florian   !!-bug client client-ergonomy server server-config
    • 3
    updated Oct 24, 2017
  • Scripts et print de python3
    #2758 · opened Oct 26, 2017 by Mathieu Giraud   server server-monitor
    • 0
    updated Oct 26, 2017
  • Sauvegarder la db à la fois en .csv et en .sql
    #2762 · opened Oct 27, 2017 by Mathieu Giraud   !-security *-go server server-backup
    • 6
    updated Mar 29, 2018
  • Décalage dans les login de connexion
    #2773 · opened Nov 10, 2017 by Thonier Florian   !!-bug client server
    • 3
    updated Nov 23, 2017
  • API URL: d'autres services utiles, côté serveur
    #2794 · opened Nov 15, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion client-api server server-admin
    • 1
    updated Nov 16, 2017
  • Authentification par LDAP
    #2062 · opened Dec 13, 2016 by Thonier Florian   !-reflexion !-security #-vidjilnet BRU-Bruxelles feature server server-auth server-hosting server-integration user-request
    • 6
    updated Jan 27, 2021
  • Priorités sur le serveur et 'Could not connect to database'
    #1446 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-hard !-reflexion priority-2 server server-hosting server-speed
    • 0
    updated Nov 22, 2017
  • Redémarrer les workers de manière systématique après une mise en production
    #2322 · opened Apr 04, 2017 by Mikaël Salson   server server-hosting
    • 3
    updated Nov 22, 2017
  • Configuration de logrotate dans le paquet serveur
    #2001 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   priority-2 server server-hosting
    • 2
    updated Nov 22, 2017
  • Un pre-process en timeout apparaît toujours running
    #1989 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !!-bug priority-2 server server-ergonomy server-pre-process
    • 2
    updated Feb 28, 2019
  • Erreur serveur à la suppression de sample sets
    #2893 · opened Nov 23, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug MON-Monza PAN-Necker REN-Rennes server server-sample-sets
    • 3
    updated Sep 24, 2018
  • My Account: accès à ses préférences
    #2953 · opened Dec 13, 2017 by Mathieu Giraud   client-custom server server-auth server-my-account
    • 1
    updated Sep 24, 2020
  • Demander confirmation avant de mettre un patient/run/set en public
    #2956 · opened Dec 19, 2017 by Mathieu Giraud   #-crisis-prevention #-sensible server server-admin
    • 0
    updated Dec 19, 2017
  • Avoir un mysql.log
    #2957 · opened Dec 19, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion server server-database server-monitor server-speed wont-fix
    • 12
    updated Dec 19, 2017
  • Avoir un mysql-write.log, INSERT et UPDATE
    #2958 · opened Dec 19, 2017 by Mathieu Giraud   *-go server server-database server-monitor
    • 1
    updated Dec 19, 2017
  • Groupe public géré par web2py
    #2959 · opened Dec 19, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion dev-refactor server server-auth server-groups
    • 1
    updated Jan 08, 2018
  • Améliorer le calcul du nombre de patients/runs créés
    #2969 · opened Dec 27, 2017 by Ryan Herbert   server
    • 0
    updated Dec 27, 2017
  • Le bouton « from IMGT » échoue parfois et provoque une erreur serveur
    #3007 · opened Jan 23, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug repseq-IMGT server
    • 0
    updated Jan 23, 2018
  • Stats : controlleur 'stats' vs controlleur 'compare patients' vs controlleur 'set'
    #3064 · opened Feb 27, 2018 by Mathieu Giraud   !-reflexion dev-refactor server
    • 0
    updated Feb 27, 2018
  • Empecher la modifications d'un patient lorsque des analyses sont en attente
    #3069 · opened Mar 02, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion client feature server server-ergonomy server-monitor server-speed
    • 3
    updated Mar 15, 2019
  • Mise en cache de l'autocompletion des samples sets : problème des mises à jour
    #3070 · opened Mar 02, 2018 by Thonier Florian   !!-bug client-autocomplete client-database server server-sample-sets
    • 5
    updated Jan 23, 2020
  • Contrôleurs obsolètes/inutilisés dans results_file.py
    #3075 · opened Mar 06, 2018 by Mikaël Salson   !-reflexion !-security dev-dead-code dev-tests server
    • 1
    updated Mar 07, 2018
  • Comment creer un groupe de fusion pour faire des partages ou réunion
    #3081 · opened Mar 12, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion LIM-Limoges client feature server server-admin server-database user-request
    • 1
    updated Mar 15, 2018
  • Pear et/ou le scheduler tombe en echec lors du dump
    #3088 · opened Mar 19, 2018 by Thonier Florian   doc server server-pre-process
    • 3
    updated Mar 20, 2018
  • Le filtrage par tag n'est pas cohérent entre la liste des sample sets et le compare samples
    #3094 · opened Mar 21, 2018 by Mikaël Salson   *-go client-tags server server-ergonomy
    • 0
    updated Feb 28, 2019
  • Le compare samples ne fonctionne pas sur dev
    #3095 · opened Mar 21, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug server
    • 0
    updated Mar 21, 2018
  • Empêcher la validation du formulaire d'upload de samples si les champs fichiers ne sont pas renseignés
    #3096 · opened Mar 22, 2018 by Mikaël Salson   server server-sample-sets server-upload
    • 0
    updated Mar 22, 2018
  • ajouter des exceptions aux timeout
    #3110 · opened Mar 28, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion client server server-speed
    • 4
    updated Mar 28, 2018
  • Indiquer clairement que des messages se cachent derrière les notifications serveurs
    #3153 · opened Apr 09, 2018 by Mikaël Salson   client-ergonomy client-notifications server
    • 0
    updated Apr 09, 2018
  • Pre-process: stocker le log en fichier et non pas en texte brut
    #3170 · opened Apr 13, 2018 by Mathieu Giraud   server server-pre-process
    • 1
    updated Apr 13, 2018
  • La colonne groups n'affiche plus rien
    #3174 · opened Apr 13, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug server server-groups
    • 4
    updated Jul 01, 2020
  • Pouvoir visualiser, sans télécharger, un fichier (texte) faisant partie de la sortie d'un répertoire tmp/ d'analyse
    #3194 · opened Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud   server
    • 6
    updated Apr 18, 2018
  • Visualisation des fichiers de résultats : le permettre aussi dans les sous-répertoires
    #3195 · opened Apr 17, 2018 by Mikaël Salson   *-go feature server server-task.py
    • 1
    updated Apr 18, 2018
  • Tests unitaires serveur sur le multi-upload
    #3201 · opened Apr 19, 2018 by Mikaël Salson   #-quality *-go dev-tests server server-sample-sets
    • 0
    updated May 24, 2018
  • Controleur qui renvoie ou met à disposition un .zip de tous les fastq + métadonnées
    #3215 · opened May 11, 2018 by Mathieu Giraud   bio-control feature server
    • 0
    updated May 11, 2018
  • tous les sample sont affichés en deleted lors d'une analyse clntab/vidjil
    #3220 · opened May 16, 2018 by Thonier Florian   !!-bug client server server-config server-database
    • 3
    updated May 16, 2018
  • vue commune pour les preprocess de merge
    #3222 · opened May 17, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion client server server-pre-process
    • 0
    updated May 17, 2018
  • Vérification de l'intégrité des données
    #3230 · opened May 25, 2018 by Mathieu Giraud   !-security server server-upload
    • 1
    updated Jul 30, 2020
  • Upload qui provoque un "missing id" : d'où vient-il ?
    #3253 · opened Jun 04, 2018 by Thonier Florian   !!-bug client client-database server server-database server-upload
    • 10
    updated Jun 08, 2018
  • Ne pas accepter d'ajouter un sample avec un seul fichier quand le pre-process en demande deux
    #3323 · opened Jun 22, 2018 by Mathieu Giraud   server server-pre-process
    • 1
    updated Jul 04, 2018
  • La redirection de /vidjil/default/index ne fonctionne pas toujours comme prévu
    #3345 · opened Jul 06, 2018 by Ryan Herbert   !!-bug server
    • 0
    updated Jul 06, 2018
  • Stocker en base de données tous les accès
    #3374 · opened Jul 13, 2018 by Mikaël Salson   !-security #-quality #-vidjilnet server server-database server-logs
    • 6
    updated Jan 08, 2019
  • La page des logs est trop longue à charger : la paginer
    #3375 · opened Jul 13, 2018 by Mikaël Salson   server server-database server-ergonomy server-speed
    • 1
    updated Feb 28, 2019
  • Pas de résultat visible avec des runs COMPLETED
    #3400 · opened Jul 19, 2018 by Ryan Herbert   !!-bug LIL-Lille server server-task.py
    • 2
    updated Jul 19, 2018
  • Liste de tests fonctionnels server   18 of 62 tasks completed
    #3401 · opened Jul 19, 2018 by Ryan Herbert   dev-robust dev-tests-watir server
    • 1
    • 5
    updated Jan 26, 2021
  • Décoration des champs du contrôleur multi samples
    #3407 · opened Jul 20, 2018 by Mikaël Salson   server server-ergonomy server-sample-sets
    • 2
    updated Feb 28, 2019
  • Compare sample : depuis la liste globale pour une même config on ne voit que le plus ancien résultat
    #3412 · opened Jul 20, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug server server-compare-last-results server-compare-samples
    • 7
    updated Feb 27, 2019
  • Point sur les problèmes rencontré avec docker
    #3458 · opened Sep 14, 2018 by Thonier Florian   dev-packaging server server-docker
    • 1
    updated Jan 10, 2019
  • Avoir un fichier de conf constant pour les updates de docker
    #3459 · opened Sep 14, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion *-go server server-docker
    • 8
    updated Jan 04, 2021
  • Pouvoir couper les accès sur le serveur
    #3482 · opened Sep 25, 2018 by Mathieu Giraud   client-notifications server server-sysadmin
    • 2
    updated Feb 09, 2021
  • Filtrage sur le nom uniquement par défaut
    #3541 · opened Oct 09, 2018 by Mikaël Salson   server server-ergonomy server-sample-sets
    • 1
    updated Feb 28, 2019
  • Tests serveurs unitaires : un même sample set utilisé deux fois ?
    #3547 · opened Oct 12, 2018 by Mikaël Salson   dev-tests server
    • 1
    updated Oct 15, 2018
  • bouton dans l'interface pour relancer le swheduler web2py
    #3554 · opened Oct 16, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion feature server server-admin server-ergonomy
    • 1
    • 1
    • 6
    updated Feb 09, 2021
  • Scheduler : Error cleaning up
    #3558 · opened Oct 16, 2018 by Ryan Herbert   !!-bug server server-task.py
    • 17
    updated Aug 22, 2019
  • Page de connexion sur serveurs externes
    #3576 · opened Oct 18, 2018 by Mathieu Giraud   priority-1-low server server-admin
    • 4
    updated Feb 09, 2021
  • Rafraîchir automatiquement la page de la DB pour voir la progression des jobs.
    #3579 · opened Oct 18, 2018 by Mathieu Giraud   priority-1-low server
    • 5
    updated Nov 21, 2018
  • Signaler à l'utilisateur que son fichier FAILED a un soucis
    #3611 · opened Nov 07, 2018 by Mathieu Giraud   server
    • 5
    updated Nov 12, 2018
  • Tests dockers : rm: cannot remove '*/S.gpg-agent.browser': No such file or directory
    #3628 · opened Nov 16, 2018 by Mikaël Salson   dev-tests server server-docker
    • 1
    updated Nov 16, 2018
  • Pouvoir désactiver le lancement de runs dans defs.py
    #3633 · opened Nov 27, 2018 by Mathieu Giraud   *-go server
    • 0
    updated Dec 13, 2019
  • sucess si pear assemble des fichiers de tailles différentes
    #3637 · opened Nov 27, 2018 by Thonier Florian   !!-bug server server-logs server-pre-process
    • 0
    updated Nov 27, 2018
  • Impossible de modifier les permissions d'un groupe
    #3669 · opened Jan 02, 2019 by Mikaël Salson   !!-bug !-easy *-go server server-admin server-auth server-ergonomy server-groups server-permissions
    • 6
    updated Feb 11, 2020
  • Champ de recherche sur la page d'un sample set : utiliser l'autocomplétion
    #3687 · opened Jan 17, 2019 by Mikaël Salson   !-easy *-go client-autocomplete server server-ergonomy
    • 0
    updated Feb 28, 2019
  • Mettre à jour web2py (tests unitaires serveurs échouent)
    #3751 · opened Feb 27, 2019 by Mikaël Salson   dev-tests server
    • 7
    updated Oct 20, 2020
  • Affichage du lien vers l'analyse d'un sample réassocié à un patient/run/set
    #3753 · opened Feb 28, 2019 by Anne de Septenville   Paris-Pitié server server-ergonomy server-sample-sets
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    updated Mar 11, 2019
  • Docker : rendre les sessions persistantes ?
    #3804 · opened Mar 15, 2019 by Mikaël Salson   server server-docker
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    updated Nov 22, 2019
  • Avoir une bouton pour lancer une analyse sur tous les samples
    #3827 · opened Mar 19, 2019 by Thonier Florian   Paris-Pitié feature server server-ergonomy server-sample-sets
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    updated Nov 20, 2020
  • Upload puis lancement multiple via .csv
    #3832 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud   !-hard !-reflexion TOU-Toulouse priority-1-low server server-task.py
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    updated Mar 19, 2019
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