Issues · vidjil / vidjil

New issue

app/analyze: mauvais affichage lorsqu'il n'y a que des séquences non segmentées

#2283 · opened Mar 22, 2017 by Mathieu Giraud !!-bug *-go app-analyze priority-1-low
- 2
updated May 22, 2017
Des e-valeurs sont supérieures à 1

#1607 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker !!-bug *-go bio-e-value client cpp-heuristic priority-1-low
- 0
updated May 22, 2017
Le :hover sur les histogrammes reste trop longtemps

#2231 · opened Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud *-go client client-bar client-ergonomy priority-1-low
- 0
updated May 22, 2017
Le créateur de la notification ne l'a pas visitée

#2039 · opened Dec 02, 2016 by Mikaël Salson *-go client-ergonomy client-notifications priority-1-low server-admin
- 1
updated Nov 09, 2017
Aligneur : paramétrer pour que les alignements soient jolis

#2509 · opened Jun 02, 2017 by Mathieu Giraud priority-1-low server-cgi
- 0
updated Jun 02, 2017
Exploiter les qualités des .fastq ?

#1544 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard cpp cpp-heuristic priority-1-low repseq-formats
- 1
updated Sep 16, 2019
Filtre plus flexible sur les germlines choisies par -g 0 of 2 tasks completed

#2159 · opened Feb 02, 2017 by Mathieu Giraud bio-germlines cpp cpp-options priority-1-low
- 0
updated Jul 10, 2017
Filtrer / sélectionner / afficher les clones suivant un axe générique

#2059 · opened Dec 13, 2016 by Mathieu Giraud *-too-vague LIL-Lille client client-axis feature priority-1-low
- 2
updated Feb 12, 2020
N'afficher que les patients avec des mise à jours non encore visualisées par l'utilisateur

#2608 · opened Sep 01, 2017 by Thonier Florian !-reflexion client client-accessibility client-menu client-views feature priority-1-low server-database
- 4
updated Oct 17, 2017
Support des langages LTR et concaténation de chaînes

#2709 · opened Oct 11, 2017 by Mathieu Giraud client-i18n priority-1-low
- 1
updated Oct 17, 2017
Déployer automatiquement les tags par défaut sur une nouvelle installation

#2713 · opened Oct 11, 2017 by Mathieu Giraud client-tags priority-1-low
- 0
updated Oct 11, 2017
Sauvegarder la position de l'ascenseur sur chaque liste patient/run/set

#1386 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team *-go client-database priority-1-low server-ergonomy
- 0
updated Feb 28, 2019
Hover sur la quantité / + / - pourrait indiquer "xxx reads"

#2815 · opened Nov 20, 2017 by Mathieu Giraud *-go client-aligner client-cloneList client-ergonomy feature priority-1-low
- 1
updated Nov 20, 2017
Pouvoir changer la couleur affectée à chaque tag

#2879 · opened Nov 22, 2017 by Mathieu Giraud client client-cloneList client-color-by client-custom client-ergonomy priority-1-low
- 0
updated Dec 10, 2019
Mettre à jour la BIL

#1395 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team #-vidjilnet *-go priority-1-low ⟳-recurring-issue
- 0
updated Dec 04, 2017
Option pour afficher le json bien formaté sur stdout et/ou format_json plus intéressant

#3000 · opened Jan 19, 2018 by Mathieu Giraud cpp-export dev-tests priority-1-low repseq-formats
- 1
updated Jan 19, 2018
Filtrage de BioReader sans re-réserver de la mémoire

#3114 · opened Apr 03, 2018 by Mathieu Giraud cpp-dynprog cpp-mem priority-1-low
- 0
updated Apr 03, 2018
Export csv depuis fuse.py

#3256 · opened Jun 05, 2018 by Mathieu Giraud client-export priority-1-low server-fuse
- 3
updated Jan 10, 2019
BinReadStorage : Pertinence de 30 bins, tests ?

#3394 · opened Jul 18, 2018 by Mathieu Giraud cpp-representative dev-tests priority-1-low
- 2
updated Mar 15, 2019
Un nom de branche trop long peut casser les tests

#3557 · opened Oct 16, 2018 by Mathieu Giraud dev-ci dev-gitlab priority-1-low
- 2
updated Oct 16, 2018
Tutorial en .md

#3574 · opened Oct 17, 2018 by Mathieu Giraud dev-ci doc priority-1-low
- 5
updated Oct 31, 2020
Page de connexion sur serveurs externes

#3576 · opened Oct 18, 2018 by Mathieu Giraud priority-1-low server server-admin
- 2
updated Oct 18, 2018
Rafraîchir automatiquement la page de la DB pour voir la progression des jobs.

#3579 · opened Oct 18, 2018 by Mathieu Giraud priority-1-low server
- 5
updated Nov 21, 2018
Étendre le warning W69 à des scores proches à une p-valeur près

#3580 · opened Oct 18, 2018 by Mathieu Giraud client-warning math-stats priority-1-low
- 1
updated Jan 10, 2019
vmi et info : X5 sur deux lignes au lieu de trois

#3604 · opened Nov 02, 2018 by Mathieu Giraud client-ugly priority-1-low
- 0
updated Nov 02, 2018
Le bouton CDR3 devrait être 2-3 pixels plus haut, aligné avec "toBlast"

#3612 · opened Nov 07, 2018 by Mathieu Giraud *-go bio-AA client client-ugly priority-1-low
- 0
updated Nov 07, 2018
Rajouter Demo-X5 au menu file des environnements de review

#3613 · opened Nov 07, 2018 by Mathieu Giraud dev-gitlab dev-tests priority-1-low
- 0
updated Nov 07, 2018
Utiliser .gitlab/route-map.yml ?

#3631 · opened Nov 26, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion dev-ci dev-gitlab priority-1-low
- 0
updated Nov 26, 2018
id des groupes, admin des configs

#3680 · opened Jan 15, 2019 by Mathieu Giraud *-go bikeshedding priority-1-low server-admin
- 2
updated Jan 15, 2019
algo: sortir {} dans le .vidjil quand il n'y a pas de clones

#3685 · opened Jan 17, 2019 by Mathieu Giraud !-easy cpp priority-1-low
- 0
updated Dec 03, 2019
Ascenseur de la liste des clones curieux sous FF

#3710 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud client-cloneList client-less-css priority-1-low
- 0
updated Feb 05, 2019
Savoir si une germline est incomplète ou pas ?

#3725 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud !-easy bio-germlines-pseudo cpp dev-refactor priority-1-low
- 0
updated Feb 12, 2019
Output files depuis client ?

#3732 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion priority-1-low
- 0
updated Feb 13, 2019
FineSegmenter et séquences revcomp ?

#3736 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-finesegmenter dev-refactor priority-1-low
- 1
updated May 28, 2020
Vidjil-algo / CLI11: mieux utiliser et homogénéiser le mécanisme d'erreurs

#3775 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 14, 2019
app/analyze: info sur ligne de commande, version vidjil-algo, log...

#3776 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go app-analyze priority-1-low
- 1
updated Mar 15, 2019
Une séquence vide peut générer un bad_alloc ?

#3783 · opened Mar 07, 2019 by Mathieu Giraud *-too-vague cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 07, 2019
Upload puis lancement multiple via .csv

#3832 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion TOU-Toulouse priority-1-low server server-task.py
- 2
updated Mar 19, 2019
User interface for entering spikes

#3846 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-mrd bio-spikes client priority-1-low
- 0
updated Jan 13, 2021
vidjil-algo: parse config.labels within CL11_json

#3887 · opened Apr 02, 2019 by Mathieu Giraud !-hard cpp cpp-options priority-1-low
- 1
updated Apr 02, 2019
gitlab-ci.yml: utiliser `default:`

#3963 · opened Aug 02, 2019 by Mathieu Giraud dev-gitlab priority-1-low
- 0
updated Aug 02, 2019
Meilleures barres de progresion

#4031 · opened Nov 05, 2019 by Mathieu Giraud cpp priority-1-low
- 0
updated Nov 06, 2019
URL et sélection de clones non visibles

#4059 · opened Nov 21, 2019 by Mathieu Giraud client-api priority-1-low
- 2
updated Nov 21, 2019
Get the number of current logged-in users

#4101 · opened Dec 13, 2019 by Thonier Florian doc feature priority-1-low server-admin
- 7
updated Sep 23, 2020
AIRR: warnings pour IgBlast

#4163 · opened Jan 24, 2020 by Mathieu Giraud bio-e-value client-warning priority-1-low
- 0
updated Jan 24, 2020
Filtrer des clones en sélectionnant un span sur un dégradé de couleur

#4176 · opened Feb 12, 2020 by Mathieu Giraud client-color-by client-filter priority-1-low
- 0
updated Feb 12, 2020
Courbes un peu plus angulées mais pas comme avant

#4177 · opened Feb 12, 2020 by Mathieu Giraud bikeshedding client-graph priority-1-low
- 0
updated Feb 12, 2020
Rupture de l'axe des Y / broken Y-axis

#4179 · opened Feb 12, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion client-bar cpp-filter-fine priority-1-low
- 0
updated Feb 12, 2020
Nouvelle vue dessinant les chromosomes et les locus

#4180 · opened Feb 12, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion *-too-vague client-views priority-1-low
- 1
updated Dec 04, 2020
Clones dans .analysis (et pas dans .vidjil): ne créer de nouveau locus que si reads existe et est > 0 ?

#4202 · opened Feb 25, 2020 by Mathieu Giraud client-virtual-clone priority-1-low
- 0
updated Feb 25, 2020
Avoir un contrôleur pour ajouter (ou renommer) une classification d'une config

#4233 · opened Apr 03, 2020 by Mikaël Salson *-go priority-1-low server server-config
- 3
updated Jun 25, 2020
Login sur review server boucle alors que loggué

#4243 · opened Apr 14, 2020 by Mathieu Giraud dev-ci priority-1-low
- 1
updated Apr 14, 2020
make forcedep

#4283 · opened May 06, 2020 by Mathieu Giraud cpp-compiler dev-build doc priority-1-low
- 0
updated May 06, 2020
benchmark-releases.py: pouvoir se comparer à n'importe quel commit

#4288 · opened May 11, 2020 by Mathieu Giraud cpp-speed priority-1-low
- 1
updated May 27, 2020
--analysis-filter également sur J ?

#4296 · opened May 20, 2020 by Mathieu Giraud cpp-filter-fine cpp-finesegmenter cpp-speed priority-1-low
- 0
updated May 20, 2020
benchmark-releases.py: isoler ce qui est spécifique à vidjil-algo

#4306 · opened May 27, 2020 by Mathieu Giraud cpp-speed dev-refactor priority-1-low
- 0
updated May 27, 2020
validate-links.py: ancres dans les liens relatifs

#4307 · opened May 27, 2020 by Mathieu Giraud doc priority-1-low
- 1
updated Sep 17, 2020
getProbabilityAtLeastOrAbove() d'avoir 3 k-mers parmi 2 devrait être 0

#4318 · opened Jun 03, 2020 by Mathieu Giraud bikeshedding math-stats priority-1-low
- 0
updated Jun 03, 2020
Fichiers dans un répertoire /upload

#4333 · opened Jun 10, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion beware-migration priority-1-low server-hosting server-upload
- 6
updated Jun 19, 2020
Avoir des statistiques globales de détection dans le .vidjil sous forme parsable

#4335 · opened Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud cpp-export priority-1-low
- 0
updated Jun 11, 2020
Chiffres significatifs : average_read_length, e-value

#4338 · opened Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud bikeshedding bio-e-value cpp-export priority-1-low
- 1
updated Jun 11, 2020
Vocabulaire "detected", choses restantes

#4341 · opened Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud bikeshedding priority-1-low
- 1
updated Jun 12, 2020
Blancs dans .vidjil ?

#4343 · opened Jun 12, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-export priority-1-low
- 3
updated Jul 28, 2020
validate-links: code d'erreur

#4344 · opened Jun 12, 2020 by Mathieu Giraud doc priority-1-low
- 0
updated Jun 12, 2020
Le web2py trackè_changes peut-il dégrader les performances en prod ?

#4348 · opened Jun 15, 2020 by Mathieu Giraud priority-1-low server-speed
- 0
updated Jun 15, 2020
Auto-logguer Démo ?

#4351 · opened Jun 16, 2020 by Mathieu Giraud com-first-time-user priority-1-low server-auth
- 0
updated Jun 16, 2020
Rendre plus conscient qu'on soit les locus DJ

#4352 · opened Jun 16, 2020 by Mathieu Giraud bio-germlines-pseudo priority-1-low
- 0
updated Jun 16, 2020
Fichiers dans /results/tmp

#4362 · opened Jun 19, 2020 by Mathieu Giraud priority-1-low server-hosting
- 0
updated Jul 03, 2020
Changement de descripteur d'un axe

#4438 · opened Jul 29, 2020 by Mathieu Giraud priority-1-low
- 0
updated Jul 29, 2020
Positionner correctement les axes du graphes à l'initialisation

#4447 · opened Aug 04, 2020 by Mathieu Giraud client-graph client-ugly priority-1-low
- 0
updated Aug 04, 2020
Graphe : supprimer la barre grise verticale lors de l'export png/svg

#4448 · opened Aug 04, 2020 by Mathieu Giraud LIL-Immuno client-export client-graph priority-1-low
- 0
updated Aug 04, 2020
clipboard.js et données incomplètes

#4478 · opened Sep 22, 2020 by Mathieu Giraud priority-1-low server server-sample-sets
- 0
updated Sep 22, 2020
Afficher le sha1 dans le client

#4483 · opened Sep 23, 2020 by Mathieu Giraud *-go priority-1-low
- 0
updated Sep 23, 2020
À la création d'un serveur, demander deux fois le mot de passe admin

#4507 · opened Oct 06, 2020 by Mathieu Giraud *-go priority-1-low server-admin server-auth
- 0
updated Oct 06, 2020
visu3/sp2 et raccourcis claviers

#4517 · opened Oct 13, 2020 by Mathieu Giraud client-keyboard priority-1-low
- 0
updated Oct 13, 2020
vmi et raccourcis claviers

#4518 · opened Oct 13, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion client-keyboard priority-1-low vmi-responsive
- 0
updated Oct 13, 2020
export html : exporter les infos du modèle, mécanisme générique depuis json

#888 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-reflexion *-too-vague client client-export priority-1-low
- 1
updated Apr 12, 2017
fuse.py, autres prog python: PEP8

#965 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team dev-policy dev-tests priority-1-low server-fuse
- 1
updated Aug 20, 2019
fuse.py doit fonctionner même si certains fichiers sont vides/inexistants par bug C++

#987 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team priority-1-low server-fuse
- 1
updated May 18, 2017
model.js, select germline: warning si système pas connu

#1017 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker bio-germlines client priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2016
courbes visualisées en "stack plot"

#1041 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team client client-graph client-views feature priority-1-low
- 0
updated Dec 11, 2020
Envoi d'un mail lorsque le job est terminé

#1070 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team bio-capture feature priority-1-low repseq-Nikos server server-smtp
- 0
updated Feb 01, 2017
css: noms plus explicites que db.column_1

#1156 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker client-database client-less-css priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2016
vidjil.cpp : modulariser selon les différentes commandes

#1180 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker cpp dev-refactor dev-robust priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2016
dynprog: allouer S, B (et aussi gap1/2/linkgap) en une seule fois

#1206 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team cpp-dynprog cpp-finesegmenter cpp-speed priority-1-low
- 1
updated Jun 13, 2018
N, autres nucléotides étendus

#1229 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard !-reflexion *-too-vague cpp cpp-dynprog cpp-heuristic priority-1-low
- 5
updated Feb 21, 2020
Zéro warning à la compilation

#1233 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team cpp dev-build dev-ci dev-robust priority-1-low ⟳-recurring-issue
- 14
updated Jun 19, 2020
CSS : uniformiser les parties à mettre en couleur

#1318 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker *-too-vague client client-less-css dev-policy priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2016
Tooltip sur 'e', 'X' et autres éléments

#1320 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker client client-ergonomy priority-1-low
- 0
updated Aug 23, 2017
Est-ce que toutes les classes CSS sont utilisées ?

#1325 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker client-less-css dev-policy priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2016
Stats sur clones sélectionnés : position

#1326 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker !-reflexion client-ergonomy client-less-css priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2016
Que devrait indiquer le menu "analysis" tout comme les #visu.axis_select pour des systèmes bizarres ?

#1328 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker !-reflexion bio-germlines priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2016
Python 3 pour web2py / web3py

#1345 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team client-i18n dev-policy priority-1-low server server-fuse
- 6
updated Aug 07, 2020
export html: transformation en .pdf par le serveur

#1359 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker !-reflexion client-export priority-1-low server
- 0
updated Nov 29, 2016
BaseSpace Illumina

#1378 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker collaboration priority-1-low repseq-community
- 0
updated Nov 29, 2016
Nomenclature : 5/3, L/R, Donnor/Acceptor ?

#1436 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team bikeshedding priority-1-low repseq-IMGT repseq-Nikos repseq-community repseq-standardization
- 0
updated Apr 04, 2017
fuse.py: si le fichier .vidjil est malformé, erreur propre

#1441 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker dev-robust priority-1-low server-fuse
- 0
updated Nov 29, 2016
Méta-données : technique de séquençage

#1556 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker #-aap-ADT-Inria bio-metadata priority-1-low server-database
- 0
updated Feb 07, 2017
Convention_de_codage ou ConventionDeCodage ?

#1650 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker cpp dev-policy priority-1-low
- 0
updated Dec 02, 2019
minifier JS ?

#1665 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team client priority-1-low
- 0
updated Nov 29, 2017