Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Coût du FineSegmenter : est-on trop généreux avec les mismatches ?

#2825 · created Nov 21, 2017 by Mikaël Salson Algo -- Important !!-bug !-important BRU-Bruxelles PAR-Debré cpp-costs cpp-finesegmenter dev-tests-should-get
- 3
updated Jun 26, 2018
Seuil pour les D, e-valeur

#1879 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team Algo -- Important bio-e-value cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D doc priority-3-month
- 23
updated Oct 14, 2020
Mauvais alignement du J : check_and_resolve_overlap() et alignements curieux localement

#3315 · created Jun 27, 2018 by Mikaël Salson !!-bug cpp cpp-costs cpp-dynprog
- 7
updated Jul 12, 2018
Gaps affine pour deletion_end pour de très grandes délétions

#3275 · created Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud *-go bio-large-deletion cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 12
updated Apr 01, 2021
dynprog : Avoir une fonction donnant le score maximum et/ou une distance

#3038 · created Feb 08, 2018 by Mathieu Giraud *-go cpp-cluster cpp-costs cpp-dynprog
- 0
updated Feb 08, 2018
Plusieurs configurations pour les coûts

#2856 · created Nov 22, 2017 by Mathieu Giraud cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D cpp-options server-config
- 0
updated Nov 27, 2017
Gaps affines pour le FineSegmenter

#2768 · created Oct 31, 2017 by Mathieu Giraud cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 2
updated Mar 16, 2021
Avoir une meilleure modélisation des délétions à la fin du V et au début du J

#2124 · created Jan 24, 2017 by Mathieu Giraud bio-e-value bio-large-deletion cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 23
updated Jan 26, 2021
Pas d'assigation VDJ lorsqu'il y a de grosses délétions

#2119 · created Jan 20, 2017 by Mikaël Salson !!-bug KIE-Kiel LIL-Lille bio-analyze-more bio-large-deletion cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 3
updated Jan 26, 2021
Favoriser une meilleure distribution des insertions dans le FineSegmenter

#2110 · created Jan 17, 2017 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion bio-e-value cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 5
updated Nov 22, 2017
Recherche des recombinaisons DDH

#2072 · created Dec 16, 2016 by Mikaël Salson PAN-Necker bio-analyze-more bio-germlines cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D
- 4
updated Jan 10, 2019
Configuration trop stringeante sur la recherche du D

#2002 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team !!-bug LIL-Lille PAN-Necker bio-e-value cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D priority-3-month user-request
- 7
updated Oct 14, 2020
Plusieurs J à la suite : prendre le premier J

#1971 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team PAR-Debré cpp cpp-costs cpp-finesegmenter dev-tests-should-get user-request
- 4
updated Feb 23, 2018