Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Détecter les primers dimers

#2820 · created Nov 21, 2017 by Mathieu Giraud LIL-Immuno PAR-Debré Paris-Pitié bio-control bio-primers client-warning cpp cpp-heuristic user-request
- 1
- 9
updated Jun 18, 2020
Doc/Tuto : à partir de quel seuil apparaissent les warnings ?

#2864 · created Nov 22, 2017 by Tatiana Rocher PAR-Debré bio-control client client-warning doc doc-tutorial
- 0
updated Sep 18, 2020
Qualité de chaque échantillon dans un run, contrôles (vue spécifique)

#2875 · created Nov 22, 2017 by Mikaël Salson LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process server-qc-stats server-sample-sets user-request
- 12
updated Sep 14, 2018
Avoir un fichier qui teste tous les warnings ou presque

#3021 · created Jan 31, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important bio-control client-warning dev-tests-should-get doc
- 0
updated Jun 26, 2018
Implémenter le warning sur CDR3 sur séquences non gappées

#3030 · created Jan 31, 2018 by Mathieu Giraud bio-AA bio-control client-warning
- 0
updated Apr 05, 2018
warnings et fuse : une entrée par sample

#3058 · created Feb 20, 2018 by Mathieu Giraud *-go bio-control client-warning server-fuse
- 2
updated Mar 06, 2019
Warnings e-value / coverage calculé par le client

#3059 · created Feb 20, 2018 by Mathieu Giraud bio-control client-warning
- 0
updated Feb 20, 2018
Aide détaillée sur les warnings

#3060 · created Feb 20, 2018 by Mathieu Giraud *-go bio-control client-warning doc warning-meta
- 1
updated Feb 03, 2021
Documenter le mécanisme de warnings dans format-analysis.org

#3086 · created Mar 15, 2018 by Mathieu Giraud bio-control client-warning doc
- 0
updated Apr 13, 2018
Faire utiliser à Clonedb les warnings

#3135 · created Apr 05, 2018 by Mathieu Giraud app-clonedb client-warning
- 4
updated Dec 03, 2019
Fichiers BAM avec données pairées : exception ou non ?

#3281 · created Jun 13, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion client-warning com dev-policy
- 0
updated Jun 13, 2018
Stéréotypie CDR3 à un subset connu

#3334 · created Jul 05, 2018 by Mathieu Giraud CLL-2018-septembre !-important LIL-Lille bio-AA bio-CLL client-warning feature user-request
- 8
updated Feb 23, 2021
Détection de séquences VJ particulières

#3357 · created Jul 11, 2018 by Mikaël Salson bio-primers client-warning cpp cpp-heuristic
- 1
updated Aug 30, 2018
Gestion plus propre des warnings 1 of 3 tasks completed

#3360 · created Jul 11, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion client-warning cpp dev-refactor warning-meta
- 1
- 7
updated Feb 03, 2021
repetition d'un warning de clone présent sur plusieurs sample : simplifier, factoriser

#3440 · created Aug 27, 2018 by Thonier Florian !-easy *-go client client-cloneList client-ergonomy client-info client-warning
- 3
updated Dec 04, 2020
ERG; ajouter un warning pour une séquence aspecifique

#3443 · created Aug 30, 2018 by Thonier Florian PAR-Debré client-warning
- 1
updated Aug 30, 2018
Étendre le warning W69 à des scores proches à une p-valeur près

#3580 · created Oct 18, 2018 by Mathieu Giraud client-warning math-stats priority-1-low
- 1
updated Jan 10, 2019
Affichage des différents niveaux de warning

#3735 · created Feb 13, 2019 by Mikaël Salson client client-ergonomy client-warning warning-meta
- 2
updated Feb 03, 2021
Stéréotypie CDR3, en général

#3906 · created Apr 18, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Lille bio-AA bio-CLL client-warning feature
- 0
updated Nov 20, 2020
Améliorer le signal/bruit sur les warnings, warnings pertinents

#4049 · created Nov 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion client-warning
- 2
updated Mar 17, 2021
Warning (algo puis client) quand un clone peut avoir plusieurs dénominations proches

#4050 · created Nov 14, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Lille client-warning
- 7
updated Jun 22, 2020
CloneDB sur clones ayant déjà des warnings

#4080 · created Dec 03, 2019 by Mathieu Giraud app-clonedb client-warning
- 1
updated Dec 03, 2019
AIRR: warnings pour IgBlast

#4163 · created Jan 24, 2020 by Mathieu Giraud bio-e-value client-warning priority-1-low
- 0
updated Jan 24, 2020
Nouvelle vue pour l'affichage des warnings

#4165 · created Jan 24, 2020 by Mikaël Salson Web 2021.11 May 17, 2021 !-reflexion client client-ergonomy client-views client-warning doc warning-meta
- 1
- 7
updated Mar 17, 2021
Warning si version très ancienne de l'algorithme (et vue database)

#4337 · created Jun 11, 2020 by Thonier Florian client client-ergonomy client-warning feature server server-database
- 0
updated Jun 11, 2020
Prendre en compte l'ordre des gènes dans le locus, en particulier pour les DD ?

#4373 · created Jun 23, 2020 by Mathieu Giraud LIL-Lille client-warning
- 0
updated Jun 23, 2020
Avoir un warning quand le nombre de différences est faible par rapport au nombre d'hypermutations

#4412 · created Jul 22, 2020 by Mikaël Salson NAN - Nantes bio-CLL client-warning cpp cpp-finesegmenter patho-LLC
- 1
- 0
updated Jul 22, 2020
Vidjil-algo : les warnings sont affichés y compris pour des clones qui ne sont pas affichés

#4425 · created Jul 28, 2020 by Mikaël Salson client-warning cpp
- 1
- 3
updated Jul 30, 2020
warning 69 (Several genes with equal probability) ; pouvoir corriger automatiquement ou verifier un peu plus

#4441 · created Jul 30, 2020 by Thonier Florian client client-warning feature
- 1
updated Jul 30, 2020
Filtrage des warnings

#4444 · created Jul 30, 2020 by Mathieu Giraud client-warning feature warning-meta
- 0
updated Feb 03, 2021
Warning sur le formulaire d'upload des fichiers suivant les noms

#4502 · created Sep 30, 2020 by Thonier Florian client client-ergonomy client-notifications client-warning feature
- 0
updated Sep 30, 2020
Adapters Illumina

#1669 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team !!-bug bio-control client-warning
- 1
updated Sep 15, 2017
.fastq cassé, ignorer des séquences

#1723 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team client-warning cpp
- 4
updated Oct 11, 2019
Avertir lorsque le pourcentage de séquences assemblées est faible

#2243 · created Mar 09, 2017 by Mikaël Salson Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process
- 3
updated Oct 19, 2018
Warning quand des programmes différents donnent des estimations différentes de productivité

#4651 · created Jan 19, 2021 by Mathieu Giraud bio-productivity client-warning repseq-IMGT
- 3
updated Feb 17, 2021
Warning et/ou confirmation quand merge de séquences productives + non-productives

#4652 · created Jan 19, 2021 by Mathieu Giraud LIL-Lille bio-productivity client-warning
- 0
updated Jan 19, 2021
vidjil-algo: warning quand une désignation a un mauvais score

#4654 · created Jan 19, 2021 by Mathieu Giraud client-warning cpp-finesegmenter math-stats
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updated Jan 19, 2021
Warning reads Illumina non mergés à 151bp ?

#4666 · created Jan 27, 2021 by Mathieu Giraud client-warning sequencers-Illumina server-pre-process
- 4
updated Jan 27, 2021
Warning sur certaines séquences en sortie des pre-process

#4669 · created Jan 27, 2021 by Mathieu Giraud client-warning server-pre-process wont-fix
- 0
updated Jan 27, 2021
Suggestion de nouveaux warnings

#4673 · created Feb 03, 2021 by Mathieu Giraud client-warning
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updated Feb 03, 2021
Warning s'affiche sur un coverage faible alors que ce n'est pas le coverage pris par fuse

#4753 · created Apr 08, 2021 by Mikaël Salson !!-bug client client-warning cpp-representative
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updated Apr 08, 2021