Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Sortir un alignement multiple de reads d'un clone

#3305 · opened Jun 25, 2018 by Mikaël Salson bio-analyze-more bio-control cpp-representative feature
- 3
updated Mar 08, 2019
La recherche de recombinaisons inattendues n'utilise pas les version +up et +down des germlines

#3214 · opened May 03, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important LIL-Lille bio-analyze-more bio-germlines-pseudo cpp
- 1
- 2
updated May 20, 2020
Ikaros : les séquences communiquées sont trop longues, voir ce qu'il faut garder

#3165 · opened Apr 11, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important PAR-Debré bio-analyze-more bio-germlines-pseudo
- 12
updated May 20, 2020
Pouvoir effectuer des analyses de translocations sur des séquences arbitraires

#2818 · opened Nov 21, 2017 by Ryan Herbert PAR-Debré bio-analyze-more bio-germlines com-vw-vidjil-workshop user-request
- 4
updated Apr 03, 2019
Pas assez de clones pour des études de répertoire

#2506 · opened Jun 01, 2017 by Mathieu Giraud REN-Rennes bio-analyze-more
- 1
updated Apr 08, 2019
Plusieurs recombinaisons dans une séquence, scFv

#2318 · opened Apr 04, 2017 by Mathieu Giraud bio-analyze-more bio-germlines-pseudo bio-paired-chains client cpp cpp-heuristic repseq-IMGT
- 9
updated Jan 15, 2021
Segmenter et MiXCR: on ne voit pas les CDR3, ni les bords V/J précis

#2288 · opened Mar 22, 2017 by Mathieu Giraud bio-AA bio-analyze-more client client-aligner repseq-Shugay repseq-formats repseq-mixcr
- 2
updated Sep 27, 2017
Fort pourcentage de séquences non assemblées par PEAR

#2242 · opened Mar 09, 2017 by Mikaël Salson Paris-Pitié bio-analyze-more server-pre-process
- 4
updated Jan 21, 2019
Faut-il afficher 1000 clones dans le client sur un échantillon ?

#2236 · opened Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud Paris-Pitié bio-CLL bio-analyze-more client feature
- 9
updated Apr 08, 2019
Tagguer le IGH D7-27-0/92/0-J1 non recombiné d'une manière particulière

#2232 · opened Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud Algo 2018.08 Paris-Pitié bio-analyze-more bio-primers cpp priority-1-low
- CLOSED
- 1
- 5
updated Jan 15, 2021
Recherche des recombinaisons DDH

#2072 · opened Dec 16, 2016 by Mikaël Salson PAN-Necker bio-analyze-more bio-germlines cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D
- 4
updated Jan 10, 2019
Fichiers avec plus de 2G reads et int overflow

#1968 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team bio-analyze-more cpp priority-2 repseq-formats
- 0
updated Feb 01, 2017
CD et autres choses utiles pour l'immuno en RNA-Seq

#1801 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team LYON-Sarah bio-analyze-more bio-control bio-germlines bio-germlines-pseudo bio-immuno bio-rnaseq cpp cpp-heuristic feature priority-2
- 8
updated Aug 27, 2018
Évolution clonale : changement de V (V switch), similarité VDJ-aware

#1726 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team BRU-Bruxelles Boldrini-Brasil LIL-Lille PAR-Debré bio-analyze-more feature server-fuse user-request
- 7
updated Apr 18, 2019
DDJ en TRD+ / kmers 4 écrasent 5

#1692 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker bio-analyze-more bio-germlines dev-tests-curated-vdj
- 0
updated Dec 04, 2020
Classes des Ig en RNA-Seq

#1687 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker LYON-Sarah bio-analyze-more bio-immuno cpp cpp-heuristic feature priority-2
- CLOSED
- 0
updated Dec 04, 2017
Avoir les locus complets quelque part

#1629 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team bio-analyze-more bio-control bio-germlines priority-2
- 0
updated Apr 17, 2018
Représentative : trop courte ? Graine utilisée ? Et en multi-système ?

#1165 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team bio-analyze-more bio-germlines cpp cpp-representative
- 1
updated Dec 11, 2020
diagnostic sur toutes nos séquences

#977 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker bio-analyze-more bio-control cpp cpp-heuristic priority-2 sub
- CLOSED
- 0
updated Nov 20, 2018
Séquences segmentées mais fenêtres non trouvées (J trop court)

#976 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker bio-analyze-more bio-control cpp cpp-heuristic priority-2
- CLOSED
- 1
updated Nov 20, 2018

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