Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Afficher un échantillon sans l'impact des autres échantillons

#2442 · created May 15, 2017 by Mathieu Giraud Web 2021.05 !-reflexion Amiens-Nordine LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client server-fuse user-request
- CLOSED
- 1
- 34
updated Apr 20, 2021
Affichage de la qualité dans l'aligneur : bikeshedding

#2313 · created Apr 04, 2017 by Mathieu Giraud Web 2021.11 Paris-Pitié bio-control client client-aligner feature repseq-formats
- 8
updated May 05, 2021
Avertir lorsque le pourcentage de séquences assemblées est faible

#2243 · created Mar 09, 2017 by Mikaël Salson Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process
- 3
updated Oct 19, 2018
Fort pourcentage de séquences non assemblées par PEAR

#2242 · created Mar 09, 2017 by Mikaël Salson Paris-Pitié bio-analyze-more server-pre-process
- 4
updated Jan 21, 2019
Titre des samples lors de la comparaison de différentes analyses d'un même fichier (compare samples)

#2241 · created Mar 09, 2017 by Mikaël Salson !-hard Paris-Pitié client-ergonomy server server-compare-last-results
- 2
updated Mar 13, 2017
`-y all`: on devrait avoir les séquences consensus dans `.vdj.fa`

#2239 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud Algo 2017.03 !!-bug +-deploy Paris-Pitié cpp repseq-formats
- CLOSED
- 2
updated Mar 29, 2017
Faut-il afficher 1000 clones dans le client sur un échantillon ?

#2236 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud Paris-Pitié bio-CLL bio-analyze-more client feature
- 9
updated Apr 08, 2019
Statistiques sur l'ensemble des patients/runs/groupe d'échantillon (vue générique)

#2235 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud MON-Monza PAN-Necker Paris-Pitié bio-control dev-dead-code server-qc-stats user-request
- CLOSED
- 16
updated Sep 14, 2018
Avoir un rapport plus générique

#2233 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud !-important LIL-Lille PAR-Debré Paris-Pitié bio-control client client-rapport user-request
- 8
updated Dec 11, 2020
Tagguer le IGH D7-27-0/92/0-J1 non recombiné d'une manière particulière

#2232 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud Algo 2018.08 Paris-Pitié bio-analyze-more bio-primers cpp priority-1-low
- CLOSED
- 1
- 5
updated Jan 15, 2021
Donner toute la séquence en acides aminés

#2140 · created Jan 30, 2017 by Mikaël Salson *-go Paris-Pitié bio-AA bio-CLL client client-aligner feature
- CLOSED
- 7
updated Apr 08, 2021
Le FineSegmenter ne donne pas le début du V ou la fin du J

#2138 · created Jan 27, 2017 by Mikaël Salson Algo 2020.06 !-hard Paris-Pitié bio-capture cpp cpp-dynprog cpp-finesegmenter feature sequencers-Nanopore
- CLOSED
- 1
- 11
updated Oct 14, 2020
Visualiser FR1 et autres dans le client

#2135 · created Jan 27, 2017 by Mathieu Giraud Paris-Pitié bio-CLL client-aligner feature
- CLOSED
- 4
updated Apr 08, 2021
Afficher les mutations synonymes/silencieuses dans le segmenteur

#2056 · created Dec 12, 2016 by Mikaël Salson CLL-2018-septembre LIL-Lille Paris-Pitié bio-AA bio-CLL client client-aligner feature user-request
- CLOSED
- 1
- 13
updated Apr 18, 2019
Décalage des informations sous la séquence dans le segmenter

#1982 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team *-go Paris-Pitié client client-aligner client-ergonomy priority-2
- CLOSED
- 9
updated Apr 08, 2021
Sortir la séquence consensus complète en donnant un histogramme de la représentativité (à la JalView)

#1972 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker !-reflexion Paris-Pitié cpp-representative feature priority-2
- 0
updated Jun 25, 2018
Contrôle de la contamination sur un run

#1744 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team LIL-Lille MON-Monza PAN-Necker Paris-Pitié bio-control client feature priority-3-month server-qc-stats user-request
- 22
updated Dec 11, 2020
Export csv de la liste des clones en sortie de l'algo

#1727 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team BRU-Bruxelles Paris-Pitié bio-analyze-more client-export com-vw-vidjil-workshop feature priority-3-month repseq-IMGT
- CLOSED
- 8
updated Jun 19, 2020
-w all, pour une autre configuration 'clonality' très stricte, sur toute la séquence

#1642 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team Algo 2017.03 PAN-Necker Paris-Pitié bio-CLL cpp cpp-options feature priority-2
- CLOSED
- 4
updated Apr 15, 2020
Replicats pour gommer des erreurs de PCR/séquençage

#1638 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker Paris-Pitié bio-control feature priority-2
- 1
updated Jul 30, 2020

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