Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Compare patients : checkbox pour n'afficher que les analyses les plus récentes par config

#2268 · opened Mar 20, 2017 by Thonier Florian *-go LIL-Lille client-database doc server server-ergonomy
- 12
updated Feb 28, 2019
Segmenter : ordre des germlines/séquences

#2491 · opened May 23, 2017 by Mathieu Giraud LIL-Lille client client-aligner user-request
- 1
updated Aug 30, 2017
Lignes des axes noires/grises

#2499 · opened May 25, 2017 by Mathieu Giraud LIL-Lille client client-grid client-ugly user-request
- 11
updated Aug 09, 2018
Vh pas trouvé, uniquement Dh-Jh

#2508 · opened Jun 01, 2017 by Mathieu Giraud Algo -- Important !!-bug LIL-Lille bio-e-value cpp cpp-heuristic user-request
- 3
updated Jun 27, 2018
Discordance de productivité

#2526 · opened Jun 09, 2017 by Mathieu Giraud Lille-LAL-next BRU-Bruxelles LIL-Lille bio-AA bio-CLL cpp user-request
- 1
- 34
updated Dec 31, 2020
Filtrer / sélectionner / afficher les clones suivant un axe générique

#2059 · opened Dec 13, 2016 by Mathieu Giraud *-too-vague LIL-Lille client client-axis feature priority-1-low
- 2
updated Feb 12, 2020
Configuration trop stringeante sur la recherche du D

#2002 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !!-bug LIL-Lille PAN-Necker bio-e-value cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D priority-3-month user-request
- 7
updated Oct 14, 2020
Recherche de séquence approchée

#1693 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team LIL-Lille bio-primers client client-cloneList client-filter priority-2
- 1
updated Jul 13, 2017
Intégrer ou lier Premier BioSoft

#2557 · opened Jul 13, 2017 by Mathieu Giraud LIL-Lille bio-primers repseq-platform
- 2
updated Jul 24, 2017
Remettre l'amorce par patient dans le client

#2558 · opened Jul 13, 2017 by Mathieu Giraud *-too-vague LIL-Lille bio-primers user-request
- 0
updated Jul 13, 2017
Ajouter un clone et relance de fuse

#2602 · opened Aug 30, 2017 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion LIL-Lille client-virtual-clone server-fuse user-request
- 0
updated Aug 30, 2017
Ajouter plusieurs clones virtuels d'un coup

#2604 · opened Aug 30, 2017 by Mathieu Giraud LIL-Lille client client-virtual-clone user-request
- 0
updated Sep 08, 2017
Avoir des tests fonctionnels sur des jeux de démo complet

#2723 · opened Oct 13, 2017 by Mathieu Giraud !-reflexion #-quality #-vidjilnet LIL-Lille cpp dev-ci dev-tests dev-tests-watir
- 8
updated Dec 09, 2020
Passer avec la souris sur les séquences du segmenteur supprime la vue des mutations

#2743 · opened Oct 20, 2017 by Mathieu Giraud !!-bug LIL-Lille client client-aligner user-request
- 3
updated Mar 19, 2019
Export : donner les informations d'IMGT dans le rapport ?

#2819 · opened Nov 21, 2017 by Mikaël Salson LIL-Lille client client-export client-rapport com-vw-vidjil-workshop feature repseq-IMGT user-request
- 1
updated Apr 05, 2018
bug lors des click sur les locus pour les switcher

#2831 · opened Nov 21, 2017 by Thonier Florian !!-bug LIL-Lille client client-menu
- 2
updated Jan 10, 2019
le graph timeline ne se remplit plus si on switch les locus

#2832 · opened Nov 21, 2017 by Thonier Florian !!-bug LIL-Lille client client-graph client-menu
- 4
updated Jan 10, 2019
Profils pour divers maladies/usages / Presets for different pathologies/uses

#2836 · opened Nov 21, 2017 by Thonier Florian !-reflexion BRU-Bruxelles LIL-Lille TOU-Toulouse client client-menu com-vw-vidjil-workshop user-request
- 7
updated Dec 04, 2020
Qualité de chaque échantillon dans un run, contrôles (vue spécifique)

#2875 · opened Nov 22, 2017 by Mikaël Salson LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process server-qc-stats server-sample-sets user-request
- 12
updated Sep 14, 2018
Évolution clonale : changement de V (V switch), similarité VDJ-aware

#1726 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team BRU-Bruxelles Boldrini-Brasil LIL-Lille PAR-Debré bio-analyze-more feature server-fuse user-request
- 7
updated Apr 18, 2019
Rapport : date de naissance + autres infos du patient (run/set) ?

#3126 · opened Apr 05, 2018 by Mathieu Giraud Lille-LAL-next !-easy *-go LIL-Lille client-rapport user-request
- 6
updated Feb 13, 2020
Point caché (dans l'épingle) qui apparaît malgré tout dans le graphique

#3128 · opened Apr 05, 2018 by Mikaël Salson !!-bug LIL-Lille client-ergonomy client-graph user-request
- 0
updated Apr 05, 2018
Afficher les primers/amorces dans le client

#3152 · opened Apr 09, 2018 by Mathieu Giraud LIL-Lille bio-control bio-primers server-qc-stats
- 6
updated Jan 13, 2021
La recherche de recombinaisons inattendues n'utilise pas les version +up et +down des germlines

#3214 · opened May 03, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important LIL-Lille bio-analyze-more bio-germlines-pseudo cpp
- 1
- 2
updated May 20, 2020
Export des informations d'un clone

#3243 · opened May 31, 2018 by Mikaël Salson LIL-Lille client client-cloneList client-export user-request
- 1
- 7
updated Jan 16, 2020
Stéréotypie CDR3 à un subset connu

#3334 · opened Jul 05, 2018 by Mathieu Giraud CLL-2018-septembre !-important LIL-Lille bio-AA bio-CLL client-warning feature user-request
- 8
updated Sep 25, 2019
Pas de résultat visible avec des runs COMPLETED

#3400 · opened Jul 19, 2018 by Ryan Herbert !!-bug LIL-Lille server server-task.py
- 2
updated Jul 19, 2018
Pouvoir selectionner le clone support consensus lors d'un merge

#3657 · opened Dec 12, 2018 by Thonier Florian LIL-Lille client client-cluster feature
- 0
updated Dec 12, 2018
Pouvoir supprimer les primers des séquences

#3714 · opened Feb 08, 2019 by Thonier Florian LIL-Lille REN-Rennes bio-CLL bio-primers client client-filter feature next-audio user-request
- 8
updated Jan 15, 2021
CloneDB : afficher les tags

#3716 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson +-deploy LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
- 2
updated Dec 03, 2019
CloneDB : les sample sets peuvent être redondants

#3717 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
updated Feb 11, 2019
Demander plusieurs alignement successifs fait planter le segmenteur

#3835 · opened Mar 19, 2019 by Mikaël Salson !!-bug LIL-Lille client client-aligner
- 5
updated Oct 14, 2020
Stéréotypie CDR3, en général

#3906 · opened Apr 18, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Lille bio-AA bio-CLL client-warning feature
- 0
updated Nov 20, 2020
Compare samples : trier par ordre chronologique

#3935 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson LIL-Lille client-ergonomy server-compare-samples user-request
- 0
updated Jun 20, 2019
Rapports monitor : que sont les graphs « normalization » ?

#3936 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson !!-bug *-go LIL-Lille client client-normalization client-rapport user-request
- 0
updated Jun 20, 2019
Rapport monitor : mettre les informations de chaque sample

#3937 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson LIL-Lille bio-mrd client-rapport feature user-request
- 1
updated Jun 21, 2019
Flash et docker

#3993 · opened Oct 07, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion BRU-Bruxelles LIL-Lille doc server-docker server-hosting server-pre-process
- 5
updated Sep 21, 2020
Warning (algo puis client) quand un clone peut avoir plusieurs dénominations proches

#4050 · opened Nov 14, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Lille client-warning
- 7
updated Jun 22, 2020
Add germline gene : problème lorsqu'on change de clone

#4062 · opened Nov 22, 2019 by Mikaël Salson Lille-LAL-next !!-bug *-go LIL-Lille client client-aligner server-cgi user-request
- 1
updated Oct 14, 2020
Clones de distribution : le filtrage par locus ne fonctionne pas

#4072 · opened Nov 27, 2019 by Mikaël Salson !!-bug LIL-Lille client client-filter client-virtual-clone
- 10
updated Jun 23, 2020
Vue des utilisateurs ayant accès à mes données

#4115 · opened Jan 09, 2020 by Mathieu Giraud LIL-Lille server-auth user-request user-traceability
- 1
updated Nov 18, 2020
Points décalés dans le rapport

#4182 · opened Feb 13, 2020 by Mathieu Giraud !!-bug LIL-Lille client-graph client-rapport user-request
- 7
updated Feb 26, 2020
Documenter les distributions + export all clones

#4237 · opened Apr 07, 2020 by Mathieu Giraud Déploiement 2020.06 Jun 28, 2020 *-go LIL-Lille doc user-request
- 7
updated Jul 09, 2020
Les utilisateurs ne peuvent pas supprimer un set

#4305 · opened May 26, 2020 by Thonier Florian Web 2021.03 !!-annoying !!-bug LIL-Lille client priority-3-month server server-sample-sets user-request
- 13
updated Dec 11, 2020
"Day after first sample" pas pertinent quand plusieurs échantillons à la même date

#4355 · opened Jun 18, 2020 by Mathieu Giraud *-go LIL-Lille client-ergonomy client-graph
- 0
updated Jun 18, 2020
Pouvoir choisir plusieurs fichiers de reads pour un sample avec un disque réseau

#4361 · opened Jun 19, 2020 by Mikaël Salson LIL-Lille server server-disk server-pre-process server-upload
- 0
updated Jun 19, 2020
Prendre en compte l'ordre des gènes dans le locus, en particulier pour les DD ?

#4373 · opened Jun 23, 2020 by Mathieu Giraud LIL-Lille client-warning
- 0
updated Jun 23, 2020
top par système : fuse.py

#1382 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard !-reflexion BRU-Bruxelles LIL-Lille REN-Rennes client com-vw-vidjil-workshop cpp feature priority-2
- 11
updated Jun 30, 2020
BCL2 / JH

#1485 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team LIL-Lille LYON-Sarah PAR-Debré REN-Rennes bio-germlines priority-3-month
- 5
updated Apr 03, 2019
Signature / Geler une analyse

#1587 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-reflexion #-quality LIL-Lille client-database client-rapport dev-robust priority-2 server server-database
- 3
updated Jun 14, 2019
API des controlleurs : documenter

#1589 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team KIE-Kiel LIL-Lille doc ec-ngs priority-2 repseq-platform server server-api
- 3
updated Nov 20, 2020
Afficher séparément les tubes de PCR différents, même quand ils concernent le même locus

#1684 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard !-reflexion LIL-Lille bio-control bio-germlines client client-axis feature priority-3-month
- 2
updated Jan 09, 2019
Contrôle de la contamination sur un run

#1744 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team LIL-Lille MON-Monza PAN-Necker Paris-Pitié bio-control client feature priority-3-month server-qc-stats user-request
- 22
updated Dec 11, 2020
Créer un nouveau clone artificiel / ajouter une séquence (modèle) 0 of 3 tasks completed

#1921 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team Web 2018.01 Aug 27, 2017 LIL-Lille PRA-Prague client client-virtual-clone feature
- 5
updated Jan 10, 2018
Couleurs dans le rapport exporté : conserver le color_by()

#1976 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team Lille-LAL-next !!-annoying LIL-Lille client-color-by client-ergonomy client-rapport priority-3-month user-request
- 2
- 12
updated Jan 06, 2021
Lorsqu'on affiche les données d'un run, les courbes sont affichées (et séparées) par date

#2017 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker LIL-Lille client-ergonomy client-graph priority-2
- 0
updated Nov 29, 2016
Colonne "results" de la liste patient vide

#2035 · opened Dec 01, 2016 by Thonier Florian LIL-Lille client-database client-ergonomy
- 4
updated Nov 21, 2017
Mode anonyme / impersonate pour utilisateurs (ayant pourtant le droit infos personnelles)

#2114 · opened Jan 19, 2017 by Mathieu Giraud #-privacy LIL-Lille client server server-auth
- 0
updated Jan 19, 2017
Pas d'assigation VDJ lorsqu'il y a de grosses délétions

#2119 · opened Jan 20, 2017 by Mikaël Salson !!-bug KIE-Kiel LIL-Lille bio-analyze-more bio-large-deletion cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 3
updated Jun 25, 2018
Killer un processus qui tourne sur un fichier qu'on écrase ?

#2165 · opened Feb 03, 2017 by Mikaël Salson LIL-Lille dev-robust server server-task.py server-upload
- 4
updated Mar 02, 2017
Avoir un rapport plus générique

#2233 · opened Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud !-important LIL-Lille PAR-Debré Paris-Pitié bio-control client client-rapport user-request
- 8
updated Dec 11, 2020
segmenteur, gènes VDJ : affichage des mutations par rapport aux gènes

#2356 · opened Apr 11, 2017 by Mathieu Giraud LIL-Lille bio-CLL client client-aligner client-less-css
- 2
updated Oct 14, 2020
Afficher un échantillon sans l'impact des autres échantillons

#2442 · opened May 15, 2017 by Mathieu Giraud !-reflexion Amiens-Nordine LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client server-fuse user-request
- 21
updated Dec 11, 2020
Updated ERIC recommendations

#2443 · opened May 15, 2017 by Mathieu Giraud CLL-2018-septembre LIL-Lille bio-CLL bio-control client client-aligner
- 3
updated Jan 15, 2021
vidjil-algo: Avoir un meilleur suffixe pour l'export des reads des clones

#4546 · opened Nov 02, 2020 by Mathieu Giraud *-go LIL-Lille cpp-export priority-1-low
- 0
updated Nov 02, 2020