Skip to content

GitLab

  • Projects
  • Groups
  • Snippets
  • Help
    • Loading...
  • Help
    • Help
    • Support
    • Community forum
    • Submit feedback
    • Contribute to GitLab
  • Sign in
vidjil
vidjil
  • Project overview
    • Project overview
    • Details
    • Activity
    • Releases
  • Repository
    • Repository
    • Files
    • Commits
    • Branches
    • Tags
    • Contributors
    • Graph
    • Compare
  • Issues 1,688
    • Issues 1,688
    • List
    • Boards
    • Labels
    • Service Desk
    • Milestones
  • Merge Requests 84
    • Merge Requests 84
  • CI / CD
    • CI / CD
    • Pipelines
    • Jobs
    • Schedules
  • Operations
    • Operations
    • Incidents
    • Environments
  • Packages & Registries
    • Packages & Registries
    • Container Registry
  • Analytics
    • Analytics
    • CI / CD
    • Repository
    • Value Stream
  • Snippets
    • Snippets
  • Members
    • Members
  • Collapse sidebar
  • Activity
  • Graph
  • Create a new issue
  • Jobs
  • Commits
  • Issue Boards
  • vidjil
  • vidjilvidjil
  • Issues

  • Open 65
  • Closed 66
  • All 131
New issue
  • Priority Created date Last updated Milestone due date Due date Popularity Label priority Manual
  • Compare patients : checkbox pour n'afficher que les analyses les plus récentes par config
    #2268 · opened Mar 20, 2017 by Thonier Florian   *-go LIL-Lille client-database doc server server-ergonomy
    • 12
    updated Feb 28, 2019
  • Segmenter : ordre des germlines/séquences
    #2491 · opened May 23, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client client-aligner user-request
    • 1
    updated Aug 30, 2017
  • Lignes des axes noires/grises
    #2499 · opened May 25, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client client-grid client-ugly user-request
    • 11
    updated Aug 09, 2018
  • Vh pas trouvé, uniquement Dh-Jh
    #2508 · opened Jun 01, 2017 by Mathieu Giraud   Algo -- Important   !!-bug LIL-Lille bio-e-value cpp cpp-heuristic user-request
    • 3
    updated Jun 27, 2018
  • Discordance de productivité
    #2526 · opened Jun 09, 2017 by Mathieu Giraud   Lille-LAL-next   BRU-Bruxelles LIL-Lille bio-AA bio-CLL cpp user-request
    • 1
    • 34
    updated Dec 31, 2020
  • Filtrer / sélectionner / afficher les clones suivant un axe générique
    #2059 · opened Dec 13, 2016 by Mathieu Giraud   *-too-vague LIL-Lille client client-axis feature priority-1-low
    • 2
    updated Feb 12, 2020
  • Configuration trop stringeante sur la recherche du D
    #2002 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !!-bug LIL-Lille PAN-Necker bio-e-value cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D priority-3-month user-request
    • 7
    updated Oct 14, 2020
  • Recherche de séquence approchée
    #1693 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   LIL-Lille bio-primers client client-cloneList client-filter priority-2
    • 1
    updated Jul 13, 2017
  • Intégrer ou lier Premier BioSoft
    #2557 · opened Jul 13, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille bio-primers repseq-platform
    • 2
    updated Jul 24, 2017
  • Remettre l'amorce par patient dans le client
    #2558 · opened Jul 13, 2017 by Mathieu Giraud   *-too-vague LIL-Lille bio-primers user-request
    • 0
    updated Jul 13, 2017
  • Ajouter un clone et relance de fuse
    #2602 · opened Aug 30, 2017 by Mathieu Giraud   !-hard !-reflexion LIL-Lille client-virtual-clone server-fuse user-request
    • 0
    updated Aug 30, 2017
  • Ajouter plusieurs clones virtuels d'un coup
    #2604 · opened Aug 30, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client client-virtual-clone user-request
    • 0
    updated Sep 08, 2017
  • Avoir des tests fonctionnels sur des jeux de démo complet
    #2723 · opened Oct 13, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion #-quality #-vidjilnet LIL-Lille cpp dev-ci dev-tests dev-tests-watir
    • 8
    updated Dec 09, 2020
  • Passer avec la souris sur les séquences du segmenteur supprime la vue des mutations
    #2743 · opened Oct 20, 2017 by Mathieu Giraud   !!-bug LIL-Lille client client-aligner user-request
    • 3
    updated Mar 19, 2019
  • Export : donner les informations d'IMGT dans le rapport ?
    #2819 · opened Nov 21, 2017 by Mikaël Salson   LIL-Lille client client-export client-rapport com-vw-vidjil-workshop feature repseq-IMGT user-request
    • 1
    updated Apr 05, 2018
  • bug lors des click sur les locus pour les switcher
    #2831 · opened Nov 21, 2017 by Thonier Florian   !!-bug LIL-Lille client client-menu
    • 2
    updated Jan 10, 2019
  • le graph timeline ne se remplit plus si on switch les locus
    #2832 · opened Nov 21, 2017 by Thonier Florian   !!-bug LIL-Lille client client-graph client-menu
    • 4
    updated Jan 10, 2019
  • Profils pour divers maladies/usages / Presets for different pathologies/uses
    #2836 · opened Nov 21, 2017 by Thonier Florian   !-reflexion BRU-Bruxelles LIL-Lille TOU-Toulouse client client-menu com-vw-vidjil-workshop user-request
    • 7
    updated Dec 04, 2020
  • Qualité de chaque échantillon dans un run, contrôles (vue spécifique)
    #2875 · opened Nov 22, 2017 by Mikaël Salson   LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process server-qc-stats server-sample-sets user-request
    • 12
    updated Sep 14, 2018
  • Évolution clonale : changement de V (V switch), similarité VDJ-aware
    #1726 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   BRU-Bruxelles Boldrini-Brasil LIL-Lille PAR-Debré bio-analyze-more feature server-fuse user-request
    • 7
    updated Apr 18, 2019
  • Rapport : date de naissance + autres infos du patient (run/set) ?
    #3126 · opened Apr 05, 2018 by Mathieu Giraud   Lille-LAL-next   !-easy *-go LIL-Lille client-rapport user-request
    • 6
    updated Feb 13, 2020
  • Point caché (dans l'épingle) qui apparaît malgré tout dans le graphique
    #3128 · opened Apr 05, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug LIL-Lille client-ergonomy client-graph user-request
    • 0
    updated Apr 05, 2018
  • Afficher les primers/amorces dans le client
    #3152 · opened Apr 09, 2018 by Mathieu Giraud   LIL-Lille bio-control bio-primers server-qc-stats
    • 6
    updated Jan 13, 2021
  • La recherche de recombinaisons inattendues n'utilise pas les version +up et +down des germlines
    #3214 · opened May 03, 2018 by Mikaël Salson   Algo -- Important   LIL-Lille bio-analyze-more bio-germlines-pseudo cpp
    • 1
    • 2
    updated May 20, 2020
  • Export des informations d'un clone
    #3243 · opened May 31, 2018 by Mikaël Salson   LIL-Lille client client-cloneList client-export user-request
    • 1
    • 7
    updated Jan 16, 2020
  • Stéréotypie CDR3 à un subset connu
    #3334 · opened Jul 05, 2018 by Mathieu Giraud   CLL-2018-septembre   !-important LIL-Lille bio-AA bio-CLL client-warning feature user-request
    • 8
    updated Sep 25, 2019
  • Pas de résultat visible avec des runs COMPLETED
    #3400 · opened Jul 19, 2018 by Ryan Herbert   !!-bug LIL-Lille server server-task.py
    • 2
    updated Jul 19, 2018
  • Pouvoir selectionner le clone support consensus lors d'un merge
    #3657 · opened Dec 12, 2018 by Thonier Florian   LIL-Lille client client-cluster feature
    • 0
    updated Dec 12, 2018
  • Pouvoir supprimer les primers des séquences
    #3714 · opened Feb 08, 2019 by Thonier Florian   LIL-Lille REN-Rennes bio-CLL bio-primers client client-filter feature next-audio user-request
    • 8
    updated Jan 15, 2021
  • CloneDB : afficher les tags
    #3716 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson   +-deploy LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
    • 1
    • 2
    updated Dec 03, 2019
  • CloneDB : les sample sets peuvent être redondants
    #3717 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson   LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
    • 1
    updated Feb 11, 2019
  • Demander plusieurs alignement successifs fait planter le segmenteur
    #3835 · opened Mar 19, 2019 by Mikaël Salson   !!-bug LIL-Lille client client-aligner
    • 5
    updated Oct 14, 2020
  • Stéréotypie CDR3, en général
    #3906 · opened Apr 18, 2019 by Mathieu Giraud   LIL-Lille bio-AA bio-CLL client-warning feature
    • 0
    updated Nov 20, 2020
  • Compare samples : trier par ordre chronologique
    #3935 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson   LIL-Lille client-ergonomy server-compare-samples user-request
    • 0
    updated Jun 20, 2019
  • Rapports monitor : que sont les graphs « normalization » ?
    #3936 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson   !!-bug *-go LIL-Lille client client-normalization client-rapport user-request
    • 0
    updated Jun 20, 2019
  • Rapport monitor : mettre les informations de chaque sample
    #3937 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson   LIL-Lille bio-mrd client-rapport feature user-request
    • 1
    updated Jun 21, 2019
  • Flash et docker
    #3993 · opened Oct 07, 2019 by Mathieu Giraud   !-reflexion BRU-Bruxelles LIL-Lille doc server-docker server-hosting server-pre-process
    • 5
    updated Sep 21, 2020
  • Warning (algo puis client) quand un clone peut avoir plusieurs dénominations proches
    #4050 · opened Nov 14, 2019 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client-warning
    • 7
    updated Jun 22, 2020
  • Add germline gene : problème lorsqu'on change de clone
    #4062 · opened Nov 22, 2019 by Mikaël Salson   Lille-LAL-next   !!-bug *-go LIL-Lille client client-aligner server-cgi user-request
    • 1
    updated Oct 14, 2020
  • Clones de distribution : le filtrage par locus ne fonctionne pas
    #4072 · opened Nov 27, 2019 by Mikaël Salson   !!-bug LIL-Lille client client-filter client-virtual-clone
    • 10
    updated Jun 23, 2020
  • Vue des utilisateurs ayant accès à mes données
    #4115 · opened Jan 09, 2020 by Mathieu Giraud   LIL-Lille server-auth user-request user-traceability
    • 1
    updated Nov 18, 2020
  • Points décalés dans le rapport
    #4182 · opened Feb 13, 2020 by Mathieu Giraud   !!-bug LIL-Lille client-graph client-rapport user-request
    • 7
    updated Feb 26, 2020
  • Documenter les distributions + export all clones
    #4237 · opened Apr 07, 2020 by Mathieu Giraud   Déploiement 2020.06   Jun 28, 2020   *-go LIL-Lille doc user-request
    • 7
    updated Jul 09, 2020
  • Les utilisateurs ne peuvent pas supprimer un set
    #4305 · opened May 26, 2020 by Thonier Florian   Web 2021.03   !!-annoying !!-bug LIL-Lille client priority-3-month server server-sample-sets user-request
    • 13
    updated Dec 11, 2020
  • "Day after first sample" pas pertinent quand plusieurs échantillons à la même date
    #4355 · opened Jun 18, 2020 by Mathieu Giraud   *-go LIL-Lille client-ergonomy client-graph
    • 0
    updated Jun 18, 2020
  • Pouvoir choisir plusieurs fichiers de reads pour un sample avec un disque réseau
    #4361 · opened Jun 19, 2020 by Mikaël Salson   LIL-Lille server server-disk server-pre-process server-upload
    • 0
    updated Jun 19, 2020
  • Prendre en compte l'ordre des gènes dans le locus, en particulier pour les DD ?
    #4373 · opened Jun 23, 2020 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client-warning
    • 0
    updated Jun 23, 2020
  • top par système : fuse.py
    #1382 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-hard !-reflexion BRU-Bruxelles LIL-Lille REN-Rennes client com-vw-vidjil-workshop cpp feature priority-2
    • 11
    updated Jun 30, 2020
  • BCL2 / JH
    #1485 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   LIL-Lille LYON-Sarah PAR-Debré REN-Rennes bio-germlines priority-3-month
    • 5
    updated Apr 03, 2019
  • Signature / Geler une analyse
    #1587 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-reflexion #-quality LIL-Lille client-database client-rapport dev-robust priority-2 server server-database
    • 3
    updated Jun 14, 2019
  • API des controlleurs : documenter
    #1589 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   KIE-Kiel LIL-Lille doc ec-ngs priority-2 repseq-platform server server-api
    • 3
    updated Nov 20, 2020
  • Afficher séparément les tubes de PCR différents, même quand ils concernent le même locus
    #1684 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-hard !-reflexion LIL-Lille bio-control bio-germlines client client-axis feature priority-3-month
    • 2
    updated Jan 09, 2019
  • Contrôle de la contamination sur un run
    #1744 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   LIL-Lille MON-Monza PAN-Necker Paris-Pitié bio-control client feature priority-3-month server-qc-stats user-request
    • 22
    updated Dec 11, 2020
  • Créer un nouveau clone artificiel / ajouter une séquence (modèle)   0 of 3 tasks completed
    #1921 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Web 2018.01   Aug 27, 2017   LIL-Lille PRA-Prague client client-virtual-clone feature
    • 5
    updated Jan 10, 2018
  • Couleurs dans le rapport exporté : conserver le color_by()
    #1976 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Lille-LAL-next   !!-annoying LIL-Lille client-color-by client-ergonomy client-rapport priority-3-month user-request
    • 2
    • 12
    updated Jan 06, 2021
  • Lorsqu'on affiche les données d'un run, les courbes sont affichées (et séparées) par date
    #2017 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker LIL-Lille client-ergonomy client-graph priority-2
    • 0
    updated Nov 29, 2016
  • Colonne "results" de la liste patient vide
    #2035 · opened Dec 01, 2016 by Thonier Florian   LIL-Lille client-database client-ergonomy
    • 4
    updated Nov 21, 2017
  • Mode anonyme / impersonate pour utilisateurs (ayant pourtant le droit infos personnelles)
    #2114 · opened Jan 19, 2017 by Mathieu Giraud   #-privacy LIL-Lille client server server-auth
    • 0
    updated Jan 19, 2017
  • Pas d'assigation VDJ lorsqu'il y a de grosses délétions
    #2119 · opened Jan 20, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug KIE-Kiel LIL-Lille bio-analyze-more bio-large-deletion cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
    • 3
    updated Jun 25, 2018
  • Killer un processus qui tourne sur un fichier qu'on écrase ?
    #2165 · opened Feb 03, 2017 by Mikaël Salson   LIL-Lille dev-robust server server-task.py server-upload
    • 4
    updated Mar 02, 2017
  • Avoir un rapport plus générique
    #2233 · opened Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud   !-important LIL-Lille PAR-Debré Paris-Pitié bio-control client client-rapport user-request
    • 8
    updated Dec 11, 2020
  • segmenteur, gènes VDJ : affichage des mutations par rapport aux gènes
    #2356 · opened Apr 11, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille bio-CLL client client-aligner client-less-css
    • 2
    updated Oct 14, 2020
  • Afficher un échantillon sans l'impact des autres échantillons
    #2442 · opened May 15, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion Amiens-Nordine LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client server-fuse user-request
    • 21
    updated Dec 11, 2020
  • Updated ERIC recommendations
    #2443 · opened May 15, 2017 by Mathieu Giraud   CLL-2018-septembre   LIL-Lille bio-CLL bio-control client client-aligner
    • 3
    updated Jan 15, 2021
  • vidjil-algo: Avoir un meilleur suffixe pour l'export des reads des clones
    #4546 · opened Nov 02, 2020 by Mathieu Giraud   *-go LIL-Lille cpp-export priority-1-low
    • 0
    updated Nov 02, 2020