Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Etendre vidjilparser.py pour générer des fichiers

#3423 · created Jul 30, 2018 by Ryan Herbert !-reflexion
- 0
updated Jul 30, 2018
Séquences stockées dans `seqs_by_window` : champs, compression ?

#3389 · created Jul 17, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-mem
- 9
updated Jul 18, 2018
Indexer séparément, mais à la suite, les up/down-stream

#3386 · created Jul 16, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-germlines-pseudo cpp cpp-heuristic
- 0
updated Jul 16, 2018
identito-vigilance: protocole par le biais des SNP

#3379 · created Jul 13, 2018 by Thonier Florian !-reflexion bio-control
- 0
updated Jul 13, 2018
Une séquence passe en unexpected au lieu d'IGH

#3370 · created Jul 12, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion bio-germlines-pseudo cpp cpp-heuristic dev-tests-curated-vdj
- 1
updated Jul 13, 2018
Gestion plus propre des warnings 1 of 3 tasks completed

#3360 · created Jul 11, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion client-warning cpp dev-refactor warning-meta
- 1
- 7
updated Feb 03, 2021
Calcul de la séquence consensus : changer le choix des reads utilisés

#3304 · created Jun 25, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion cpp cpp-representative
- CLOSED
- 1
updated Dec 11, 2020
Allèles non *01 (non-génome de référence) et up-downstream

#3301 · created Jun 22, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-germlines-pseudo wont-fix
- CLOSED
- 5
updated Jul 20, 2018
Ordre sur les flags de task.py

#3300 · created Jun 18, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion server-task.py wont-fix
- 0
updated Jun 18, 2018
Faire des cas difficiles pour les heuristiques (segmentation, filtrage) par graines

#3297 · created Jun 18, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-filter-fine dev-tests-should-get
- 4
updated Jul 11, 2018
Fichiers BAM avec données pairées : exception ou non ?

#3281 · created Jun 13, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion client-warning com dev-policy
- 0
updated Jun 13, 2018
vidjil.cpp ne devrait pas, par défaut, sortir un fichier par clone segmenté

#3269 · created Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp cpp-export cpp-filter-fine cpp-options
- 0
updated Jun 22, 2018
Filtrage des germlines : le désactiver pour les "petites" germlines ?

#3267 · created Jun 11, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-filter-fine cpp-speed
- 5
updated Jul 06, 2018
Filtrage par automate : prendre les N meilleures séquences et leurs « voisines »

#3225 · created May 22, 2018 by Mikaël Salson Algo 2018.09 !-reflexion cpp cpp-filter-fine math-stats
- CLOSED
- 1
- 6
updated Oct 10, 2018
vue commune pour les preprocess de merge

#3222 · created May 17, 2018 by Thonier Florian !-reflexion client server server-pre-process
- 0
updated May 17, 2018
Fusion de reads : essayer Flash (et BBMerge ?)

#3219 · created May 15, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion #-legal server-pre-process
- CLOSED
- 28
updated Mar 20, 2020
Supprimer les k-mers non significatifs ?

#3218 · created May 15, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-filter-fine
- 0
updated Feb 21, 2020
Utilisation des séquences "cibles"

#3216 · created May 11, 2018 by Thonier Florian !-reflexion PAN-Necker app-clonedb client cpp data feature user-request
- 1
updated May 11, 2018
Lancer CloneDB depuis fuse.py ou en offline

#3181 · created Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion app-clonedb client-speed server-fuse server-speed
- 0
updated Feb 14, 2019
Ajout de samples : « specific set » est peu clair

#3178 · created Apr 16, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion bikeshedding client-ergonomy server
- CLOSED
- 1
updated Apr 17, 2018

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