Roadmap été/automne 2022 suite au CST
Discuté ensemble @mikael-s @flothoni @duez, complété un peu
More tags/colors. Done
API / Demo. TODO
Initial work towards tools for Clonal evolution (one month, first tools)
- usages de tSNE, rafraîchir cela, documenter...
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⚡ faire un point et documenter tSNE #5083 (closed) - tSNE 1D (avec par exemple axe V) ? #5042
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- extensions de tSNE
- tSNE sur toute la séquence ? sur les V ? (avec threshold si fenêtre proche ?) #5084 (pas la priorité ?)
- tSNE sur d'autres distances #3158 #4093 repseq-IMGT CDR3/AA #5111
- aussi alignements #3332
- pour tSNE comme alignements, client-speed back (ou .js): update cgi ? #2786 #5041 ?
- On ne rentre pas dans #1726 et autres: bien trop complexe pour un mois
Contamination (one month). See and export how clonotypes may be common in several stages
- stats-qc #4539/#3171
- et/ou post-process
- affichage dans le rapport ? (afficher stats-qc dans rapport ?)
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⚡ en pur client, #5082 et #5054 (closed) - en pur client, via warnings #4133, va avec #5080 / !1240 (merged)
Profiles for diseases (one month). This will begin by stabilizing/enhancing the reports for different diseases
- en septembre, après retours sur nouveaux rapports client-rapport, rajout d'éléments...
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⚡ #5012 (closed) serait déjà fantastique