Documenter / cacher -c detect / windows / germline ?

Depuis discussion dans !906:

Peut-être cacher ici -c detect ? D'ailleurs, cacher également -c windows (pas décrit dans la doc...) ? Voire -c germlines ?

Je penche pour cacher tout cela, ou au moins le mettre en "advanced options" (à voir comment, passer tout -c en advanced ? Et faire un preset pour -c designations -2 -3 ?)

Ce n'est pas que du bikeshedding, c'est juste qu'une commande non documentée n'apporte pas de clarté. Dans tout vidjil-algo.md, il y a une seule occurrence de -c designations, et aucune des autres. Surtout que, selon la commande, plein d'autres options ne servent plus.