vidjil-algo: pouvoir prendre des séquences en ligne de commande
Depuis !887 (merged), il est agréable de pouvoir faire
echo ">seq\ngggtcttactactgtgcctgtgacaccacaccgataaactcatctttggaaaaggaacccg" | ./vidjil-algo --all -g germline -
Va-t-on plus loin avec une option type --seq
pour prendre directement des séquences ? (peut-être même sans header fasta ?)
Cela pourrait faciliter le débuggage / valgrind quand nécessaire, mais c'est vraiment priority-1-low.