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Mise à jour terminée. Pour connaître les apports de la version 13.8.4 par rapport à notre ancienne version vous pouvez lire les "Release Notes" suivantes :
https://about.gitlab.com/releases/2021/02/11/security-release-gitlab-13-8-4-released/
https://about.gitlab.com/releases/2021/02/05/gitlab-13-8-3-released/

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  • #4699

Closed
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Opened Feb 15, 2021 by Mathieu Giraud@magiraudOwner

vidjil-algo: pouvoir prendre des séquences en ligne de commande

Depuis !887 (merged), il est agréable de pouvoir faire

echo ">seq\ngggtcttactactgtgcctgtgacaccacaccgataaactcatctttggaaaaggaacccg" | ./vidjil-algo --all -g germline -

Va-t-on plus loin avec une option type --seq pour prendre directement des séquences ? (peut-être même sans header fasta ?) Cela pourrait faciliter le débuggage / valgrind quand nécessaire, mais c'est vraiment priority-1-low.

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information
Assignee
Assign to
None
Milestone
None
Assign milestone
Time tracking
None
Due date
None
Reference: vidjil/vidjil#4699