Nouveau TRGJ1*02
Pour mémoire, il y a six gènes dans TRGJ.
Nous connaissons bien TRGJ1*02, qui jusqu'à maintenant avait 3 nucléotides de moins en 5' que TRGJ1*01. Depuis juillet 2018, il a rattrapé son grand frère:
M12960|TRGJ1*01 F|J-REGION|157..206 gaattattataagaaactctttggcagtggaacaacactggttgtcacag
M12957|TRGJ1*02 (old) (F)|J-REGION|23..69 ...ttattataagaaactctttggcagtggaacaacactTgttgtcacag
IMGT000011|TRGJ1*02 (new) F|J-REGION|118516..118565 gaattattataagaaactctttggcagtggaacaacactTgttgtcacagIl n'est désormais plus marqué (F), et la différence avec TRGJ1*01 devient encore plus subtile, après ~40 nt. Cela va changer à la marge l'annotation de certaines séquences.
Je serai curieux de connaître les raisons d'un tel changement.
cc @flothoni
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