Skip to content

GitLab

  • Projects
  • Groups
  • Snippets
  • Help
    • Loading...
  • Help
    • Help
    • Support
    • Community forum
    • Submit feedback
    • Contribute to GitLab
  • Sign in
vidjil
vidjil
  • Project overview
    • Project overview
    • Details
    • Activity
    • Releases
  • Repository
    • Repository
    • Files
    • Commits
    • Branches
    • Tags
    • Contributors
    • Graph
    • Compare
  • Issues 1,696
    • Issues 1,696
    • List
    • Boards
    • Labels
    • Service Desk
    • Milestones
  • Merge Requests 88
    • Merge Requests 88
  • CI / CD
    • CI / CD
    • Pipelines
    • Jobs
    • Schedules
  • Operations
    • Operations
    • Incidents
    • Environments
  • Packages & Registries
    • Packages & Registries
    • Container Registry
  • Analytics
    • Analytics
    • CI / CD
    • Repository
    • Value Stream
  • Snippets
    • Snippets
  • Members
    • Members
  • Collapse sidebar
  • Activity
  • Graph
  • Create a new issue
  • Jobs
  • Commits
  • Issue Boards
  • vidjil
  • vidjilvidjil
  • Issues
  • #4425

Closed
Open
Opened Jul 28, 2020 by Mikaël Salson@mikael-sOwner

Vidjil-algo : les warnings sont affichés y compris pour des clones qui ne sont pas affichés

En lançant :

./vidjil-algo -r 1 -g germline demo/LIL-L4.fastq.gz

on obtient (depuis !711 (merged) ?) à la fin de nombreuses lignes consécutives :

[warning] (W50) Short or shifted window

Or on ne sait pas ce que ça veut dire puisque les clones ne sont plus affichés. Donc n'afficher ces warnings sur la sortie standard que si le clone lui-même est affiché.

To upload designs, you'll need to enable LFS and have admin enable hashed storage. More information
Assignee
Assign to
None
Milestone
None
Assign milestone
Time tracking
None
Due date
None
Reference: vidjil/vidjil#4425