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Created Jul 28, 2020 by Mikaël Salson@mikael-sOwner

Vidjil-algo : les warnings sont affichés y compris pour des clones qui ne sont pas affichés

En lançant :

./vidjil-algo -r 1 -g germline demo/LIL-L4.fastq.gz

on obtient (depuis !711 (merged) ?) à la fin de nombreuses lignes consécutives :

[warning] (W50) Short or shifted window

Or on ne sait pas ce que ça veut dire puisque les clones ne sont plus affichés. Donc n'afficher ces warnings sur la sortie standard que si le clone lui-même est affiché.

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information
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