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Vidjil-algo : les warnings sont affichés y compris pour des clones qui ne sont pas affichés
En lançant :
./vidjil-algo -r 1 -g germline demo/LIL-L4.fastq.gz
on obtient (depuis !711 (merged) ?) à la fin de nombreuses lignes consécutives :
[warning] (W50) Short or shifted windowOr on ne sait pas ce que ça veut dire puisque les clones ne sont plus affichés. Donc n'afficher ces warnings sur la sortie standard que si le clone lui-même est affiché.