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Opened Apr 07, 2020 by Thonier Florian@flothoniMaintainer

En mode align, la suppression de certaines lignes efface des mutations

http://app.vidjil.org/?set=37318&config=2; sélectionner tous les V3-15 /J3. Parmi cette séléction 2 clonotype ne sont pas identique aux autres. Si on les supprime après avoir fait un align, on ne retrouve pas les mutation entre les autres clonotype restant.

Si on regarde cet échantillon, on voit que toutes ces séquences sont identiques sur le CDR3, mais diffèrent sur la longueur de séquence. (plus ou moins longue en V).

PS: voir mon commentaire suivant pour une meilleur description de la méthode de reproduction du bug.

Edited Apr 07, 2020 by Thonier Florian
To upload designs, you'll need to enable LFS and have admin enable hashed storage. More information
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Milestone
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None
Reference: vidjil/vidjil#4235