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En mode align, la suppression de certaines lignes efface des mutations
http://app.vidjil.org/?set=37318&config=2; sélectionner tous les V3-15 /J3. Parmi cette séléction 2 clonotype ne sont pas identique aux autres. Si on les supprime après avoir fait un align, on ne retrouve pas les mutation entre les autres clonotype restant.
Si on regarde cet échantillon, on voit que toutes ces séquences sont identiques sur le CDR3, mais diffèrent sur la longueur de séquence. (plus ou moins longue en V).
PS: voir mon commentaire suivant pour une meilleur description de la méthode de reproduction du bug.