The one place for your designs
To enable design management, you'll need to meet the requirements. If you need help, reach out to our support team for assistance.
Aho : segmentation en DJ au lieu de VDJ
Sur le test simple should-vdj-tests/igh-vdj.should-vdj.fa on segmente en DJ au lieu de segmenter en VDJ.
>(IGHV1-18*01, IGHV1-18*04) 0//0 IGHD3-16*01 0//0 IGHJ4*01 [IGH]
agcctacatggagctgaggagcctgagatctgacgacacggccgtgtattactgtgcgagaga
gtattatgattacgtttgggggagttatgcttatacc
actactttgactactggggccaaggaaccctggtcaccgtctcctcagEn IGH :
IGH SEG_+ 1.339458e-30 2.318227e-129/1.339458e-30+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H ?+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V+V _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _+h+h+h+h+h+h+h+h+h _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _En IGH+ :
IGH+ SEG_+ 1.329853e-39 8.909570e-83/1.329853e-39 _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _+h+h+h+h+h+h+h+h+h _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _Cela passe en IGH+ à cause du J, qui a pourtant autant d'affectations dans les deux cas. Mais la différence c'est que la fenêtre est plus proche du J en IGH+ qu'en IGH. La e-valeur est donc calculée sur une zone moins grande pour le J en IGH+ qu'en IGH, la e-valeur est donc moins élevée en IGH+ et IGH+ gagne.