Détection de séquences VJ particulières
Pour #2232 (closed), mais cela peut aussi être dans d'autres situations comme avec des dimers d'amorces, on a des clones qui ressortent et qui ne sont pas significatifs.
On aimerait leur mettre des warnings (#2247 (closed)).
Une solution est de coder en dur la valeur des recombinaisons et de lever un warning lorsqu'on rencontre cette valeur-là. Une autre solution serait de stocker les séquences elle-mêmes et de détecter les fenêtres dans ces séquences. Toutes les séquences partageant cette fenêtre seront clusterisées avec ce qui nous permet ensuite de faire ce qu'on veut.
Cela éviterait de stocker des choses plus ou moins robustes en dur.