Une séquence n'est pas analysée quand le filtrage est activé
Depuis algo/tests
:
../../vidjil-algo -c segment -g ../../germline/homo-sapiens.g:IGH should-vdj-tests/2767-Debre-IGH.should-vdj.fa
, la deuxième séquence.
Le test contient IGHV3-7*01 (112/CCAGGACC/6, 112/CC/0) IGHD2-2 (16/GAATACCTAGTACC/12, 16/GAATACCTAGT/9, 16/GAA/2) (IGHJ4*01, IGHJ4*02)
Sur dev
, ou bien sur !237 (merged) avec -Z all
:
>IGHV3-7*01 + VDJ 1 144 147 161 165 213 IGHV3-7*01 112/CC/0 IGHD2-2*01 16/GAA/2 IGHJ4*02 IGH SEG_+
Mais sur !237 (merged):
>IGHV3-7*01 ! @30 @165 IGH UNSEG only J/3' 1.499151e+03 1.499151e+03/6.475415e-15
Voir #3344 ?