Test du filtrage : faire des tests négatifs
Discuté avec @boreec : suite à #3250 (closed) les tests passent toujours, ce qui est surprenant.
En regardant un peu le code, on pense qu'en demandant le filtrage d'une séquence bidon elle sera filtrée comme étant la première séquence du germline. La raison à cela est que les k-mers UNKNOWN et les k-mers de la 1è séquence ont tous deux le numéro 1 qui leur est affecté. La séquence bidon aura donc des k-mers UNKNOWN ui seront interprétés comme provenant de la séquence 1.
Il faudrait donc vérifier que si on filtre avec une séquence qui n'a rien à voir, on obtient bien en sortie le germline complet. Attention en attendant #3187 si on le fait sur de vraies données il est possible qu'une séquence bidon est malgré tout 1 ou 2 k-mers partagés avec un IGHV. On peut très bien faire ce test sur des données fabriquées à la main pour être sûr que la séquence « bidon » n'ait aucun k-mer partagé avec les séquences de nos germlines.