Estimer le temps pris par sur vidjil -c clones : KmerSegmenter / représentative / FineSegmenter
Depuis #3227 (comment 94004) :
le temps total pour l'utilisateur sera plutôt ce qui vient de
vidjil-algo -c clones -z 0, en tout cas on a envie de connaître la contribution de chacune des étapes, à l'intérieur comme à l'extérieur du FineSegmenter.
Ici il s'agit plus généralement d'estimer les diverses parties :
- temps initial négligeable
- KmerSegmenter: maintenant avec les 14 germlines, et après Aho #2556 (closed) ?
- représentatives
- FineSegmenter (à
-z100, 1000, 10000), surtout après filtrage cpp-filter-fine
... et de voir quelles sont les parties prioritaires à travailler pour une accélération d'ensemble.
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