La recherche de recombinaisons inattendues n'utilise pas les version +up et +down des germlines
Dans un problème remonté par Aurélie (cf. https://serveur-vidjil.chrul.net/browser/index.html?set=32653&config=25) on a un réarrangement +TRDV2 -TRDD2 ce qui devrait être trouvé comme étant unexpected. Sauf que, pour les unexpected, on n'utilise pas les parties amont et aval des gènes. Du coup il n'y a pas assez de signal pour détecter le TRDD2 (surtout qu'il n'y a que la partie intronique !).
Il faudrait donc les intégrer à la recherche de recombinaison unexepected. Dans ce cas j'imagine qu'il ne faudra prendre que les versions amont ou aval et pas du tout les versions restreintes aux gènes pour éviter des conflits (ce qui conduirait à des ambiguous).
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