Faire une fonction qui filtre un BioReader en fonction d'une séquence
Pour #920 (closed) on a besoin de ne lancer le FineSegmenter que sur un sous-ensemble du répertoire.
Cela sera fait en passant un BioReader
restreint aux gènes d'intérêt à la fonction align_against_collections
. Il faut donc faire une fonction chargée de créer ce BioReader
restreint.
Elle prendra deux paramètres (au moins ?) :
- le
BioReader
d'origine - la séquence utilisée comme filtre (les k-mers de cette séquence sont utilisés pour déterminer les gènes d'intérêt)
(Cyprien : pour garder l'info tu peux mettre ce numéro d'issue dans tes messages de commit, à la fin de la description. Par exemple « See #3080 (closed) »)