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GitLab

Closed
Created by Mikaël Salson@mikael-sOwner

Faire une fonction qui filtre un BioReader en fonction d'une séquence

Pour #920 (closed) on a besoin de ne lancer le FineSegmenter que sur un sous-ensemble du répertoire.

Cela sera fait en passant un BioReader restreint aux gènes d'intérêt à la fonction align_against_collections. Il faut donc faire une fonction chargée de créer ce BioReader restreint. Elle prendra deux paramètres (au moins ?) :

  1. le BioReader d'origine
  2. la séquence utilisée comme filtre (les k-mers de cette séquence sont utilisés pour déterminer les gènes d'intérêt)

(Cyprien : pour garder l'info tu peux mettre ce numéro d'issue dans tes messages de commit, à la fin de la description. Par exemple « See #3080 (closed) »)

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