Pas de séquences en minuscules dans vidjil-algo ?
En regardant #2985, je me rends compte que dans tools.cpp
/tools.h
, certaines fonctions sont case-sensitive
(nuc_to_int
, ou peut-être pas vu l'encodage ASCII) et d'autres non (complement_nucleotide
).
D'un autre côté, dans fasta.cpp
, on a bien une transformation en majuscule dans OnlineFasta::next()
. Est-ce notre seule porte d'entrée de séquences dans vidjil-algo ? Il y a bien quelques options obscures qui doivent accepter des séquences en ligne de commande. D'autres choses ?