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Created by Mikaël Salson@mikael-sOwner

Dynprog : Une mauvaise résolution de l'overlap conserve une erreur en fin de gène

En corrigeant des tests pour #2851 (closed) je tombe là-dessus :

# read:       GTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTTAGCACAGATACGCAGTATTTTGGCCC
#             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
# TRBV7-2*02  GTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTAGC
# TRBJ2-3*01                          AGCACAGATACGCAGTATTT

En interdisant les homopolymères (coût par défaut à l'infini), Vidjil me sort quand même un TRBV7-2*02 2/0/0 TRBJ2-3*01. Pourquoi Vidjil aligne-t-il le troisième T dans le V ?

Comment est-il possible de débugger cela pour voir ce qui l'a amené à faire ce choix ?

Edited by Mikaël Salson
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