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Dynprog : Une mauvaise résolution de l'overlap conserve une erreur en fin de gène
En corrigeant des tests pour #2851 (closed) je tombe là-dessus :
# read: GTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTTAGCACAGATACGCAGTATTTTGGCCC
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# TRBV7-2*02 GTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTAGC
# TRBJ2-3*01 AGCACAGATACGCAGTATTTEn interdisant les homopolymères (coût par défaut à l'infini), Vidjil me sort quand même un TRBV7-2*02 2/0/0 TRBJ2-3*01. Pourquoi Vidjil aligne-t-il le troisième T dans le V ?
Comment est-il possible de débugger cela pour voir ce qui l'a amené à faire ce choix ?