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Created Aug 28, 2017 by Mikaël Salson@mikael-sOwner

[Aho] Meilleure e-valeur avec xxx qu'avec une recombinaison classique

Sur should-vdj-tests/BRI_multi.should-vdj.fa (par exemple) une séquence est segmentée en xxx au lieu de l'être en TRA+D. La e-valeur en xxx est 10^-109 contre 10^-100 en TRA+D. Pourtant l'index load du xxx est bien plus élevé (3,7% contre 0,004%).

La séquence est :

>TRDV2*01 3/CGGAGG/19 TRAJ48*01 [TRA+D]
TGCAAAGAACCTGGCTGTACTTAAGATACTTGCACCATCAGAGAGAGATGAAGGGTCTTACTACTGTGCCTGTGACCGGAGGGAAATTAACCTTTGGGACTGGAACAAGACTCACCATCATACCCAGTAAGTTCTTCATCCTTGGTCAGGAAATCAGCCTGCATAAGATTCTGGGGA
Edited Jul 19, 2018 by Mikaël Salson
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Heuristique 2.0
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Heuristique 2.0
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