Regarder dynprog.cpp et segment.cpp
@Berveglieri_Nicolas et @eelkhatib, vous avez maintenant accès au git de vidjil avec le code.
Comme discuté tout à l"heure, je vous invite à :
- installer vidjil (
algo/
) - tester le module qui utilse la programmation dynamique : par exemple
./vidjil -c segment -g germline/homo-sapiens.g data/segment_S22.fa
- regarder en détail
algo/core/dynprog.cpp
, et, dansalgo/core/segment.cpp
,align_against_collection()
. Faire en particulier desprintf
ou autre chose pour bien être conscient de ce qui se passe dansalign_against_collection()
et/ou dansDynProg
.
Voir #2080