Supprimer, -G, -g germlines, et promouvoir -g germlines/homo-sapiens.h
Dans la discussion de #2134 (closed) :
-G
n'est qu'un raccourci pour des options qui sont désormais très avancées (et qu'on avait mis à un moment où on n'avait pas encore de fichier .g.)
Indépendamment de #2134 (closed), j'ai une très forte envie de supprimer -G
, qui est un peu bizarre et dépend des noms de fichiers. L'option recommandée serait -g
, et on peut toujours faire -V
/ -D
/ -J
(plus les réglages de graines et autres) si besoin. C'est l'occasion de le faire, comme avec la prochaine release on change la ligne de commande en raison du homo-sapiens.g
.