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Created Jan 27, 2017 by Mikaël Salson@mikael-sOwner

Le FineSegmenter ne donne pas le début du V ou la fin du J

En l'état actuel, le FineSegmenter met le début du V à la position 1 de la séquence, et la fin du J à la dernière position de la séquence. Dans le cas d'un séquençage de produits de PCR ce n'est pas un problème. Avec de la capture ou du RNA-Seq (avec de longs reads), cela devient plus problématique.

La correction de ce bug aura aussi des conséquences pour la recherche du codon stop dans la séquence (voir #1824 (closed)/#2142 (closed)).

cc @magiraud

Edited May 22, 2019 by Mathieu Giraud
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