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Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 07 février entre 13h30 et 14h00. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes (habituellement de l'ordre de trois minutes).

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  • #1997
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Issue created Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Garder des séquences d'intérêt : -W / -@

(voir aussi "Permettre à certaines séquences de forcer le -t dans le fuse")

Mikaël : 14602c22 DNA sequences that should be found in the window (or windows that should be found into it) can be kept whatever their concentration is. We therefore mimick what is done for labelled windows. As the two methods looks similar (while this one seems more general), we may want to remove the -W option, to keep only this new -@ option.

Mathieu :

Effectivement, cela m’a l’air plus général … mais, si j’ai bien compris, -@ avec une séquence de la taille de la fenêtre est quasiment équivalent à -W (est-ce que cela fait bien la même interaction avec -F comme sans -F ?)

Bref :

  • autant appeler la nouvelle option « -W », c’est rétro-compatible ?
  • voir si cela vaut le coup d’avoir, comme avant, une map <string, string> et non pas une list. Les labels en questions servaient aussi dans « -l », mais bon, je ne suis pas sûr qu’on s’en sert beaucoup. Mais si on remet au goût du jour, on pourrait mieux se servir de ces labels.

yeah, merci


@magiraud @mikael-s

Edited Jan 17, 2019 by Mikaël Salson
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