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Garder des séquences d'intérêt : -W / -@
(voir aussi "Permettre à certaines séquences de forcer le -t dans le fuse")
Mikaël : 14602c22 DNA sequences that should be found in the window (or windows that should be found into it) can be kept whatever their concentration is. We therefore mimick what is done for labelled windows. As the two methods looks similar (while this one seems more general), we may want to remove the -W option, to keep only this new -@ option.
Mathieu :
Effectivement, cela m’a l’air plus général … mais, si j’ai bien compris, -@ avec une séquence de la taille de la fenêtre est quasiment équivalent à -W (est-ce que cela fait bien la même interaction avec -F comme sans -F ?)
Bref :
- autant appeler la nouvelle option « -W », c’est rétro-compatible ?
- voir si cela vaut le coup d’avoir, comme avant, une map <string, string> et non pas une list. Les labels en questions servaient aussi dans « -l », mais bon, je ne suis pas sûr qu’on s’en sert beaucoup. Mais si on remet au goût du jour, on pourrait mieux se servir de ces labels.
yeah, merci