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  • #1949

Closed
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Opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Quand on a le choix entre plusieurs points, choisit-on vraiment la représentative la plus pertinente ?

Sur ce patient : http://rbx.vidjil.org/browser/index.html?patient=2206&config=26 La représentative affichée pour le 2è clone au diagnostic est une séquence de 112bp. Il s'agit de la séquence trouvée au premier point de suivi (et non au diag). Pourquoi est-elle prise ? Car ce clone est le top 1 au fu1, alors qu'il est top 2 au diag. Mais le fu1 est très peu segmenté et donc ce top 1 représente 91 reads au fu1 contre plus de 20 000 au diag.

Devrait-on prendre la représentative du point avec le plus de reads ? avec la représentative la plus longue ?


0d40d04c point avec le plus de reads


Tâche rouverte, le commit a été réverté (8d6525b4)


@duez @RyanHerb @mikael-s @magiraud

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information
Assignee
Assign to
None
Milestone
None
Assign milestone
Time tracking
None
Due date
None
Reference: vidjil/vidjil#1949