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Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 07 février entre 13h30 et 14h00. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes (habituellement de l'ordre de trois minutes).

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  • #1935
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Issue created Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

IndexError: list index out of range dans le contrôleur get_data

Pas seulement pour l'utilisateur demo, mais accessible pour demo : http://rbx.vidjil.org/browser/index.html?patient=1507&config=25


Je ne sais pas pourquoi mais il y a des champs à NULL dans sample_set_membership (par exemple pour les éléments db.sample_set_membership.sample_set_id == 4845 Du coup on n'accède pas non plus aux résultats de MiXCR (pas accessible à demo, par contre).


Les champs à NULL sont les sequence_file_id


Pour le patient demo X5, il n'y a pas de runs pour la config multi+inc+xxx (sequence_file supprimé après un run ?). Donc le fused_file est chargé, mais aucune donnée de correspond dans la base de données et la requête du contrôleur ne fournit pas suffisamment de résultats (içi 0 ?) et entraîne un débordement d'index en essayant de faire correspondre le contenu du fused_file avec la BDD.


Ça continue à arriver épisodiquement à des utilisateurs : https://rbx.vidjil.org/admin/default/ticket/vidjil/82.115.175.156.2016-05-23.09-19-14.93a81edc-3c60-458f-9caa-86430525fa87

(titre de la tâche changé, précédemment : Compte démo : erreur lors de l'accès à la config multi+inc+xxx sur demo X5)


hotfix: 6127ab44778 (99dcbf89 sur dev)


@magiraud @RyanHerb @mikael-s

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