Graîne pour xxx
La graîne utilisé pour xxx est plus courte que pour d'autres locus (IGH, TRA, TRB, IGH+, TRA+D, TRD+), du coup une séquence ne passant pas dans un locus normal (à cause d'erreurs ou hypermutations) pourrait passer en xxx alors que la recombinaison n'a rien d'extraordinaire. Exemple ici : http://rbx.vidjil.org/browser/index.html?patient=1655&config=25
Bien vu. Je me demandais ce que faisait ces séquences.
Que doit-on faire ?
- allonger la graine de xxx (ou les seuils de e-valeur) pour ne plus avoir cela
- interdire que xxx retourne un V/J d'un autre locus
- ou... "sauver" ces séquences et les remettre (même dans le C++) dans le locus d'origine. Si on a confiance dans nos calculs d'e-valeur, ce serait la bonne chose à faire : une séquence xxx qui passe est pertinente.