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  • #1887

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Opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Nouvelle vue, grid avec tous les locus / résumé

Proposition pour une vue "Summary, by locus" où on voit tous les locus, fichier ci-dessous. Cliquer sur un locus fait basculer dans la vue grid normale avec ce locus.

Dans un premier temps, on peut voir toutes les bulles juste en vrac. Mais on pourrait aussi voir un "mini-scatterplot", comme sur le TRA (on ne voit pas les axes, mais on se doute qu'il y a deux paquets).

Les rectangles ne doivent pas être visible, ils montrent juste ce qui peut être regroupé pour que cela tienne tout seul sur 1 ligne ou 2.

Enfin, on verra ce qu'on mettra dans la liste des valeurs (reads, clone, ...). On n'est pas obligé d'avoir la légende, un tooltip pourrait suffire ?


Il y a beaucoup de nombres, ce n'est pas parsable très facilement. Avoir la vue en histo pour montrer le nombre de reads, clones par système ? Plus une courbe pour montrer un indice de diversité ?


On peut déjà faire une vue plot (ou bar): x = locus, y = autre chose (comme size ou...) Mais ce n'est pas très sexy.

L'idée est d'avoir un endroit avec une vue globale. Et de limiter effectivement les nombres à ce qu'on pense le plus important (voire à remplacer les nombres par un truc visuel). Mais peut-être que certaines personnes voudraient voir d'autres informations (par ex le % de productif). Autres propositions bienvenues.

courbe + indice de diversité : voir #1783. Par contre, une courbe avec l'axe x qui serait les locus serait confus (pour l'instant on ne fait que des courbes sur le time graph, voir nouvelle tâche)


@RyanHerb @duez

Edited Dec 04, 2020 by Mathieu Giraud
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Reference: vidjil/vidjil#1887