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  • #1635

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Opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Renommer le clone "other"

other ne veut pas dire grand chose et est parfois mal compris : est-ce que c'est autre chose que du VDJ ? d'autres locus ? du bruit ? On pourrait mettre :

  1. clones 101...xxx
  2. clones < xxx %
  3. lower/lowest clones Dans les cas 1 et 2 les nombres doivent être mis à jour automatiquement quand on modifie le nombre de clones affichés.

Il y a aussi une tâche pour séparer le clone other, mais déjà on peut renommer le clone actuel, ce n'est pas très compliqué :)


Oui, bonne idée !

  1. clones 101...xxx
  2. clones < xxx % "clones below 0.02%" serait vraiment classe. Mais le soucis est que le % dépend des locus affichés... (ou même "TRG clones below 0.02%", tâche "other par locus")

2bis. clones < 4 reads ?

  1. lower/lowest clones ou bien "other clones" :-)

(un jour, on fera un top par système, mais c'est quasi orthogonal)


mmm... tout est fait dans le browser, avec plusieurs tests .id = "other", cela va être l'occasion de rendre cela plus propre :-)


Cela a été rendu plus propre... mais c'est orthogonal. Pour afficher ce que l'on veut, il suffit de jouer sur le "name".

Pb: c'est en fait les clones qui ne sont pas affichés. Si on fait un "search", un "filter by tag", le other récupère tous les autres. La description "clones below ...." n'est pas suffisante.

Dans ce cas, il faudrait vraiment séparer, "clones below..." d'un côté et "hidden/filtered clones" de l'autre.


cd03a465. Renommé. Un jour, on pourra séparer mieux.


@magiraud @mikael-s

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Reference: vidjil/vidjil#1635