Heuristique : analyser les germlines non recombinés
0618/R1, de Maria
- on ne segmente < 0.1% en mutli+inc+xxx
- mais 18% en MAX_1U (avec -e 10000000) (et même 21% en -t 0) En en ayant regardé le premier cluster, plus que du MAX_1U, c'est en fait du... non recombiné.
On devrait avoir une méthode de segmentation qui sort des trucs non recombinés. #1724. On prend l'affectation maximum, et regarde combien il y en a... mais quel calcul de proba faire ensuite ? Pour que cela ne passe pas devant une vraie séquence recombinée ? #2653
Faut-il avoir des probas conditionnelles ?
Germlines avec les séquences avals des V et amonts des J, et on fait du V, contre du V-aval ou du J-amont contre du J de façon tout à fait classique.
Pourquoi pas... mais devra-t-on rentrer toutes ces germlines ? Ou bien, si elles sont juste présentes quelque part, le MAX_12 va les trouver.
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