RNA-seq, representative, coverage
Est-ce que notre manière de faire la représentative est adaptée au RNA-Seq ? Peut-être que oui, mais on n'y avait pas nécessairement pensé au début... Et notre mesure de coverage.
Voir sur rbx patients/tim-0453/clone-IGL.fa, alignement en attaché. Belle distribution (mais quelques splice events à la fin ? Que dit CRAC ?) Ici coverage = 100%, juste parce que la gaussienne doit être belle.
Faudrait-il une autre mesure pour dire un coverage plus absolu, pour différencier le cas où les reads sont exactement alignées ?