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Attention une mise à jour du serveur va être effectuée le vendredi 16 avril entre 12h et 12h30. Cette mise à jour va générer une interruption du service de quelques minutes.

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  • #1239

Closed
Open
Opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

align.cgi ne fonctionne plus en tant que CGI

Depuis le commit 59a1bcf6 Fasta::add() affiche un message sur cout. Or le CGI ouvre un fichier FASTA et le constructeur fait appel à la fonction add, du coup on se retrouve avec un <== /tmp/VidjilAlignxndSPK 54 bp in 3 sequences au début de la sortie, ce qui fait foirer le parsing du Json.

Vire-t-on l'affichage du Fasta (perso j'ai rien contre…) ? Ou autre solution ?

(J'avais aussi introduit d'autre problèmes en refactorant, c'est corrigé par a6ca2f2..19c540a)


2cb2d703 et 027ac257. Cela rend fasta.cpp un peu plus lourd, mais de l'extérieur cela ne se voit pas. J'aime bien cet affichage, cela permet de se rendre compte de ce qu'il se passe.


Dans mon précédent message je faisais référence à des commits que j'ai oublié de pousser (pour corriger d'autres aspects) : du coup les commits sont 239b954f..469d4337


@nobody

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information
Assignee
Assign to
None
Milestone
None
Assign milestone
Time tracking
None
Due date
None
Reference: vidjil/vidjil#1239