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Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 07 février entre 13h30 et 14h00. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes (habituellement de l'ordre de trois minutes).

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Issue created Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

germlines.js: mise à jour des séquences

Marc, tu as un script quelque part qui crée le .js ? Il faudrait le relancer... (et le mettre dans le git, à côté de split-from-imgt.py). Note qu'il y a maintenant des fichiers isolés (type TRDD2-01.fa, et il y aura aussi KDE.fa), certaines séquences peuvent être en double.

Ou bien, à terme, faire que le javascript accède directement aux séquences dans les fichiers fasta dans germline (et dans ce cas, plus besoin de js/germline.js vu que le reste est dans germline.data)


faire que le javascript accède directement aux séquences dans les fichiers fasta dans germline

On peut parser n'importe quel fichier texte en javascript sauf les fichiers locaux (toujours la même restriction le javascript n'a pas a accéder aux fichiers de l'utilisateur) donc faisable mais il faut abandonner le offline


donc pour l'instant le germline.js est une bonne solution (pas parfaite, mais bon)


séquences a jour ainsi que le script déplacé dans /germline

41b25020 948fead4


e4d33aca : script rajouté dans get-germline


@duez

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