Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)
et/ou utiliser des N voire autres caractères
Mikaël: "ad60c833 est un bon début"
Discussion en audio du 11 décembre.
L'objet Fasta se souvient de la qualité. La représentative se souvient des 1000 plus longs. On pourrait déjà faire qualité moyenne sur fenêtre (les 1000 plus longs, voire tout).
Faire sur toute la séquence : plus complexe, comment combiner qualité + nombre des séquences ? Peut-être c'est plus informatif (et simple) de montrer le coverage par base (attention, approximatif car k-mers).
Discuté au VW16.
Marc a fait cela pour la fenêtre (branche windows_quality)
mergé pour la fenêtre
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